RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636481.1

CHRNA4-215, Transcript of cholinergic receptor nicotinic alpha 4 subunit, humanhuman

TSL 5

Gene CHRNA4, Length 126 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4-215ENST00000636481 HPS4Q9NQG7 708 aa3.06□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa3.06□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 TOR4AQ9NXH8 423 aa3.06□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 GMIPQ9P107 970 aa3.06□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 CEP72Q9P209 647 aa3.06□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 MTRRQ9UBK8 725 aa3.06□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 BTBD3Q9Y2F9 522 aa3.06□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 GIT1Q9Y2X7 761 aa3.06□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa3.06□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 INSL5Q9Y5Q6 135 aa3.06□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 A0A1W2PQD8 194 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 A1L4Q6 167 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 TMEM150BA6NC51 233 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 DDX11L8A8MPP1 907 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 MEI4A8MW99 385 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 PIK3CDO00329 1044 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 KCNK3O14649 394 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 FLRT2O43155 660 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 TRAPPC3O43617 180 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 CHMP2AO43633 222 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 CYTH3O43739 400 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 DIAPH2O60879 1101 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 NDUFS2O75306 463 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 B3GAT3O94766 335 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 ERLIN2O94905 339 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 ABLIM3O94929 683 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 NPTXRO95502 500 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 PRAMEF12O95522 483 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 CER1O95813 267 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 OATP04181 439 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 THP07101 528 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 CPB1P15086 417 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 ATF2P15336 505 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 GABRR2P28476 465 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 TNFRSF8P28908 595 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 AFMP43652 599 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 BRCC3P46736 316 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 ALDH1A3P47895 512 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 USP11P51784 963 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 CYP4F8P98187 520 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 PRKCEQ02156 737 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 BFSP1Q12934 665 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 GRIK3Q13003 919 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 NR1H3Q13133 447 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 TUSC3Q13454 348 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 RTP5Q14D33 572 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 NCAPHQ15003 741 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 TAF12Q16514 161 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 CRY1Q16526 586 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 HLA-BQ31612 363 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 TBC1D25Q3MII6 688 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 WDR45BQ5MNZ6 344 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 ZNF787Q6DD87 383 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 NOTUMQ6P988 496 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 ANKS3Q6ZW76 656 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 TMC8Q8IU68 726 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 TCEAL8Q8IYN2 117 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 CPA6Q8N4T0 437 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 ALLCQ8N6M5 410 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 OLIG1Q8TAK6 271 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 USP33Q8TEY7 942 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 ERLEC1Q96DZ1 483 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 HIC2Q96JB3 615 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 TBC1D32Q96NH3 1257 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 ZNF577Q9BSK1 485 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 NRSN2Q9GZP1 204 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 MINDY3Q9H8M7 445 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 ZSWIM5Q9P217 1185 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 SUSD2Q9UGT4 822 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 MMP17Q9ULZ9 603 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 CYP8B1Q9UNU6 501 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 BACE2Q9Y5Z0 518 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 ASXL3Q9C0F0 2248 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 MYH8P13535 1937 aa3.05□□□□□ -1.92
CHRNA4-215ENST00000636481 MYH4Q9Y623 1939 aa3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms