RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 SLC37A4O43826 429 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 KPNA6O60684 536 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 TDP2O95551 362 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 IVLP07476 585 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 MAPTP10636 758 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 EPB41P11171 864 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 CEACAM1P13688 526 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 CASP1P29466 404 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 CDC25AP30304 524 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 KIF11P52732 1056 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 UBE3AQ05086 875 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 ENPEPQ07075 957 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 CETN1Q12798 172 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 MCM6Q14566 821 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 MTF1Q14872 753 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 PPP2R5AQ15172 486 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 CFAP221Q4G0U5 840 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 ATAT1Q5SQI0 421 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 CCDC181Q5TID7 509 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 EMBQ6PCB8 327 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 WDR59Q6PJI9 974 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 HS2ST1Q7LGA3 356 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 OTOP3Q7RTS5 596 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 USP37Q86T82 979 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 GPBP1Q86WP2 473 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 MCF2L2Q86YR7 1114 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 TRIM59Q8IWR1 403 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 SYCE1Q8N0S2 351 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 CPXCR1Q8N123 301 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 SPIRE2Q8WWL2 714 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 HAS1Q92839 578 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 CLDN23Q96B33 292 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 DNAJC19Q96DA6 116 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 UBA5Q9GZZ9 404 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 SLC39A2Q9NP94 309 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 JADE2Q9NQC1 790 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 AIPL1Q9NZN9 384 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 SNX12Q9UMY4 172 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-218ENST00000584243 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 P4HA2O15460 535 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 EEF2P13639 858 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 THPOP40225 353 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 GATMP50440 423 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 PMS1P54277 932 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 KLRC3Q07444 240 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 IKQ13123 557 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 MTAPQ13126 283 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 PPP2R5CQ13362 524 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 SLC18A3Q16572 532 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 PLA2G2CQ5R387 149 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 FAM83BQ5T0W9 1011 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 RNF43Q68DV7 783 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 TCEAL6Q6IPX3 200 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 PDXDC1Q6P996 788 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 GBP6Q6ZN66 633 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 MMGT1Q8N4V1 131 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 FAM181AQ8N9Y4 354 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 ACRBPQ8NEB7 543 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 ETNPPLQ8TBG4 499 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 MDM1Q8TC05 714 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 TCEAL3Q969E4 200 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 FAM81BQ96LP2 452 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 RIT2Q99578 217 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 CRACR2AQ9BSW2 395 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 FUT8Q9BYC5 575 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 ZMYND15Q9H091 742 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 FAM107BQ9H098 131 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 MMRN2Q9H8L6 949 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 ZNF446Q9NWS9 450 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 FEM1BQ9UK73 627 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 KIAA1024Q9UPX6 916 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 MTMR7Q9Y216 660 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 FAM170BA6NMN3 283 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 MAPK13O15264 365 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 AFPP02771 609 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 POLR2MP0CAP2 368 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 CYP11B2P19099 503 aa8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms