RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577310.1

SNX11-204, Transcript of sorting nexin 11, humanhuman

TSL 3

Gene SNX11, Length 358 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11-204ENST00000577310 CCNE2O96020 404 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 CDK4P11802 303 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 MYL4P12829 197 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 GJA1P17302 382 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 WEE1P30291 646 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 KIF5BP33176 963 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 MLH1P40692 756 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 SCNN1GP51170 649 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 SCRN1Q12765 414 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 MYO1EQ12965 1108 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 RUNX3Q13761 415 aa6.67□□□□□ -1.34
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SNX11-204ENST00000577310 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 UBXN11Q5T124 520 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 SLC36A4Q6YBV0 504 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 MFSD6Q6ZSS7 791 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 TCEAL8Q8IYN2 117 aa6.67□□□□□ -1.34
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SNX11-204ENST00000577310 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa6.67□□□□□ -1.34
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SNX11-204ENST00000577310 BPIFB1Q8TDL5 484 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 OXER1Q8TDS5 423 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
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SNX11-204ENST00000577310 ESR2Q92731 530 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 FAM167AQ96KS9 214 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 FAM83CQ9BQN1 747 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 MXRA8Q9BRK3 442 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 BCL11AQ9H165 835 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 ASAH2Q9NR71 780 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 TM7SF3Q9NS93 570 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 SUSD2Q9UGT4 822 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 TNNQ9UQP3 1299 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 ANK1P16157 1881 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 CSMD2Q7Z408 3487 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 ESYT2A0FGR8 921 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 SFTPCP11686 197 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 ATF2P15336 505 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 GNSP15586 552 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 FGFR3P22607 806 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 MCM2P49736 904 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 GRIK2Q13002 908 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 EXD3Q8N9H8 876 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 GSTCDQ8NEC7 633 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 ENGASEQ8NFI3 743 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 ZFP42Q96MM3 310 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 DPH1Q9BZG8 443 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 GKN1Q9NS71 199 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 ECHDC1Q9NTX5 307 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 MAD2L2Q9UI95 211 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 MMP17Q9ULZ9 603 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 TBX20Q9UMR3 447 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 SSUH2Q9Y2M2 353 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 GIT1Q9Y2X7 761 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 IPPQ9Y573 584 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 INSL5Q9Y5Q6 135 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 CER1O95813 267 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 FGAP02671 866 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 ITGB6P18564 788 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 SREBF1P36956 1147 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 DNM2P50570 870 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 NFKB2Q00653 900 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 GRIK3Q13003 919 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 PSMD2Q13200 908 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 SLC8B1Q6J4K2 584 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 IL27RAQ6UWB1 636 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 GPIHBP1Q8IV16 184 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 USP33Q8TEY7 942 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 RABGGTAQ92696 567 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 POM121Q96HA1 1249 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 HIC2Q96JB3 615 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 SEMA3CQ99985 751 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 PAAF1Q9BRP4 392 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 CYP4F11Q9HBI6 524 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 HPS4Q9NQG7 708 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-204ENST00000577310 NRBP2Q9NSY0 501 aa6.65□□□□□ -1.34
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