RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556416.1

CLMN-205, Transcript of calmin, humanhuman

TSL 2

Gene CLMN, Length 1,772 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMN-205ENST00000556416 USP8P40818 1118 aa25.15■■□□□ 1.62
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CLMN-205ENST00000556416 NPAS4Q8IUM7 802 aa25.15■■□□□ 1.62
CLMN-205ENST00000556416 FMNL3Q8IVF7 1028 aa25.15■■□□□ 1.62
CLMN-205ENST00000556416 FAM71AQ8IYT1 594 aa25.15■■□□□ 1.62
CLMN-205ENST00000556416 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CLMN-205ENST00000556416 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa25.15■■□□□ 1.62
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CLMN-205ENST00000556416 UBR7Q8N806 425 aa25.13■■□□□ 1.61
CLMN-205ENST00000556416 IL23AQ9NPF7 189 aa25.13■■□□□ 1.61
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CLMN-205ENST00000556416 SYN1P17600 705 aa25.08■■□□□ 1.61
CLMN-205ENST00000556416 WDR5P61964 334 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
CLMN-205ENST00000556416 DEFB103AP81534 67 aa25.08■■□□□ 1.61
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