RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552189.5

SENP1-210, Transcript of SUMO specific peptidase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SENP1, Length 4,967 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1-210ENST00000552189 PTPN22Q9Y2R2 807 aa8.4□□□□□ -1.06
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SENP1-210ENST00000552189 H0Y626 953 aa8.4□□□□□ -1.06
SENP1-210ENST00000552189 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
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SENP1-210ENST00000552189 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
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SENP1-210ENST00000552189 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
SENP1-210ENST00000552189 SLC30A5Q8TAD4 765 aa8.4□□□□□ -1.07
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SENP1-210ENST00000552189 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa8.39□□□□□ -1.07
SENP1-210ENST00000552189 TAOK1Q7L7X3 1001 aa8.39□□□□□ -1.07
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SENP1-210ENST00000552189 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
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SENP1-210ENST00000552189 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SENP1-210ENST00000552189 A0A1W2PQY0 241 aa8.39□□□□□ -1.07
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SENP1-210ENST00000552189 SOX5P35711 763 aa8.39□□□□□ -1.07
SENP1-210ENST00000552189 TM4SF4P48230 202 aa8.39□□□□□ -1.07
SENP1-210ENST00000552189 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
SENP1-210ENST00000552189 HAS1Q92839 578 aa8.39□□□□□ -1.07
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SENP1-210ENST00000552189 CGRRF1Q99675 332 aa8.39□□□□□ -1.07
SENP1-210ENST00000552189 CHST12Q9NRB3 414 aa8.39□□□□□ -1.07
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SENP1-210ENST00000552189 FTCDO95954 541 aa8.39□□□□□ -1.07
SENP1-210ENST00000552189 CCNE2O96020 404 aa8.39□□□□□ -1.07
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SENP1-210ENST00000552189 CA4P22748 312 aa8.39□□□□□ -1.07
SENP1-210ENST00000552189 NUMBP49757 651 aa8.39□□□□□ -1.07
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SENP1-210ENST00000552189 CCDC15Q0P6D6 951 aa8.39□□□□□ -1.07
SENP1-210ENST00000552189 PTPAQ15257 358 aa8.39□□□□□ -1.07
SENP1-210ENST00000552189 RAB30Q15771 203 aa8.39□□□□□ -1.07
SENP1-210ENST00000552189 PSMD5Q16401 504 aa8.39□□□□□ -1.07
SENP1-210ENST00000552189 UGCGQ16739 394 aa8.39□□□□□ -1.07
SENP1-210ENST00000552189 EFHC1Q5JVL4 640 aa8.39□□□□□ -1.07
SENP1-210ENST00000552189 JADE1Q6IE81 842 aa8.39□□□□□ -1.07
SENP1-210ENST00000552189 ANO5Q75V66 913 aa8.39□□□□□ -1.07
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