RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	TGM1	P22735	817 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	GUCY2C	P25092	1073 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	TEAD2	Q15562	447 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	IQCE	Q6IPM2	695 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	ELMOD1	Q8N336	334 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	APPL2	Q8NEU8	664 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	IRF7	Q92985	503 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	YIPF1	Q9Y548	306 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	ARNTL	O00327	626 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	MAN2B1	O00754	1011 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	OR4Q2	P0C623	313 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	PLS3	P13797	630 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	PRPH	P41219	470 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	STRN3	Q13033	797 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	BEST2	Q8NFU1	509 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM3C	Q92520	227 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	PNMA5	Q96PV4	448 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	LRRC3	Q9BY71	257 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	ASAH2	Q9NR71	780 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	LAMA1	P25391	3075 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	TTC26	A0AVF1	554 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931		M0QZQ0	153 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	LAD1	O00515	517 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	LRPAP1	P30533	357 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	TNFSF9	P41273	254 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	GUCY2F	P51841	1108 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	MCL1	Q07820	350 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	GAS6	Q14393	721 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	ZBTB6	Q15916	424 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	LPAL2	Q16609	132 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	HYI	Q5T013	277 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	ZPBP2	Q6X784	338 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	TMC8	Q8IU68	726 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	LEMD2	Q8NC56	503 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	PLIN2	Q99541	437 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	KIF2C	Q99661	725 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	MAFF	Q9ULX9	164 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LETMD1-231	ENST00000551931		A0A1W2PRU2	124 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LETMD1-231	ENST00000551931	PPEF2	O14830	753 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF263	O14978	683 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LETMD1-231	ENST00000551931	CLDN3	O15551	220 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LETMD1-231	ENST00000551931	OAZ2	O95190	189 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LETMD1-231	ENST00000551931	NEFL	P07196	543 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LETMD1-231	ENST00000551931	CHRNB1	P11230	501 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LETMD1-231	ENST00000551931	CCNE1	P24864	410 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LETMD1-231	ENST00000551931	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
LETMD1-231	ENST00000551931	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC12A3	P55017	1021 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LETMD1-231	ENST00000551931	SATB1	Q01826	763 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LETMD1-231	ENST00000551931	DUSP4	Q13115	394 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LETMD1-231	ENST00000551931	WDR44	Q5JSH3	913 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LETMD1-231	ENST00000551931	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LETMD1-231	ENST00000551931	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LETMD1-231	ENST00000551931	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LETMD1-231	ENST00000551931	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
LETMD1-231	ENST00000551931	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
LETMD1-231	ENST00000551931	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
LETMD1-231	ENST00000551931	KIF12	Q96FN5	646 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LETMD1-231	ENST00000551931	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LETMD1-231	ENST00000551931	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
LETMD1-231	ENST00000551931	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LETMD1-231	ENST00000551931	USP18	Q9UMW8	372 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LETMD1-231	ENST00000551931	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM189A1	O60320	539 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LETMD1-231	ENST00000551931	CLTA	P09496	248 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LETMD1-231	ENST00000551931	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	13.69	□□□□□ -0.22

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