RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 CHRDQ9H2X0 955 aa18.53■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa18.53■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 PPP4R2Q9NY27 417 aa18.53■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 USP18Q9UMW8 372 aa18.53■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 CEP250Q9BV73 2442 aa18.52■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 CXCL8P10145 99 aa18.52■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 PLS3P13797 630 aa18.52■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 PRPHP41219 470 aa18.52■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 EPHA5P54756 1037 aa18.52■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 MFSD6LQ8IWD5 586 aa18.52■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa18.52■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 KIF12Q96FN5 646 aa18.52■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 PLIN2Q99541 437 aa18.52■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 GPR88Q9GZN0 384 aa18.52■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 TRPV5Q9NQA5 729 aa18.52■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 GMEB2Q9UKD1 530 aa18.52■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 YIPF1Q9Y548 306 aa18.52■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa18.51■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 HEPACAM2A8MVW5 462 aa18.51■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa18.51■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 M0QZQ0 153 aa18.51■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 OR4Q2P0C623 313 aa18.51■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 MAPTP10636 758 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 CCNE1P24864 410 aa18.51■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 CCR3P51677 355 aa18.51■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 ARHGAP8P85298 464 aa18.51■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 MCL1Q07820 350 aa18.51■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 ZPBP2Q6X784 338 aa18.51■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 DSTYKQ6XUX3 929 aa18.51■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 USP37Q86T82 979 aa18.51■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 YAF2Q8IY57 180 aa18.51■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 SHKBP1Q8TBC3 707 aa18.51■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa18.51■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 BICD1Q96G01 975 aa18.51■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 IER2Q9BTL4 223 aa18.51■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa18.51■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 TRPV4Q9HBA0 871 aa18.51■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 RAB23Q9ULC3 237 aa18.51■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 A0A1W2PRU2 124 aa18.5■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 OAZ2O95190 189 aa18.5■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 CLTAP09496 248 aa18.5■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 LRPAP1P30533 357 aa18.5■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 EPHB3P54753 998 aa18.5■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 LMNB2Q03252 620 aa18.5■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 DUSP4Q13115 394 aa18.5■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 PLD1Q13393 1074 aa18.5■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 LPAL2Q16609 132 aa18.5■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 MAMSTRQ6ZN01 415 aa18.5■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 BEST2Q8NFU1 509 aa18.5■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 E2F7Q96AV8 911 aa18.5■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 PNMA5Q96PV4 448 aa18.5■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 HAPLN2Q9GZV7 340 aa18.5■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 MYH11P35749 1972 aa18.5■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 NCANO14594 1321 aa18.49■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 F5P12259 2224 aa18.49■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 TDGF1P13385 188 aa18.49■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 TNFSF9P41273 254 aa18.49■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 ALDH1A3P47895 512 aa18.49■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 PPP2R3AQ06190 1150 aa18.49■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 MCTP1Q6DN14 999 aa18.49■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 GPIHBP1Q8IV16 184 aa18.49■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa18.49■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 COL4A2P08572 1712 aa18.49■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa18.48■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 TTC26A0AVF1 554 aa18.48■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 OR6C75A6NL08 312 aa18.48■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 LACTBL1A8MY62 500 aa18.48■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 H0YCG3 227 aa18.48■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 XPOTO43592 962 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 VNN2O95498 520 aa18.48■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 PLA2G4BP0C869 781 aa18.48■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 CHRNB1P11230 501 aa18.48■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 CYP3A5P20815 502 aa18.48■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 TGM1P22735 817 aa18.48■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 CXCL12P48061 93 aa18.48■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 SLC12A3P55017 1021 aa18.48■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 SATB1Q01826 763 aa18.48■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 SPEM2Q0P670 501 aa18.48■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 GPR17Q13304 367 aa18.48■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 ZBTB6Q15916 424 aa18.48■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 HYIQ5T013 277 aa18.48■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 PRR23BQ6ZRT6 265 aa18.48■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 TMC8Q8IU68 726 aa18.48■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 RSPRY1Q96DX4 576 aa18.48■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 LRRC3Q9BY71 257 aa18.48■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 DNAJC25Q9H1X3 360 aa18.48■□□□□ 0.55
CS-214ENST00000548849 CRISPLD1Q9H336 500 aa18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms