RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543473.1

SUDS3-204, Transcript of SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUDS3, Length 4,897 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3-204ENST00000543473 EXT2Q93063 718 aa20.35■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 RAB6BQ9NRW1 208 aa20.35■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 SNX5Q9Y5X3 404 aa20.35■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 DSG1Q02413 1049 aa20.35■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 DNAAF5Q86Y56 855 aa20.35■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 MAD2L2Q9UI95 211 aa20.35■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa20.35■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 CHEK2O96017 543 aa20.35■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa20.35■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 EME1Q96AY2 570 aa20.35■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 SH2D3AQ9BRG2 576 aa20.35■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 HOXC10Q9NYD6 342 aa20.35■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 WEE2P0C1S8 567 aa20.35■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 E2F7Q96AV8 911 aa20.35■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 CMTM5Q96DZ9 223 aa20.35■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 WHRNQ9P202 907 aa20.35■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 LOC100653049A0A140TA62 436 aa20.34■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 KRT34O76011 436 aa20.34■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 SFNP31947 248 aa20.34■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa20.34■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 DEFB132Q7Z7B7 95 aa20.34■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 GIPC2Q8TF65 315 aa20.34■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 MIEF2Q96C03 454 aa20.34■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 PCMTD2Q9NV79 361 aa20.34■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa20.34■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 M0QYV0 167 aa20.34■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 PJA2O43164 708 aa20.34■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 POTEAQ6S8J7 498 aa20.34■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 MICALL2Q8IY33 904 aa20.34■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 CASP7P55210 303 aa20.34■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 CATSPER3Q86XQ3 398 aa20.34■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 KIAA0895Q8NCT3 520 aa20.34■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 ATP8B4Q8TF62 1192 aa20.34■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 RNF146Q9NTX7 359 aa20.34■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 S100BP04271 92 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 INPP1P49441 399 aa20.33■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 MAPK6Q16659 721 aa20.33■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 CCDC134Q9H6E4 229 aa20.33■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 GABBR1Q9UBS5 961 aa20.33■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 FAM205AQ6ZU69 1335 aa20.33■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 SYCE1LA8MT33 242 aa20.33■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 P4HA2O15460 535 aa20.33■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 BTKQ06187 659 aa20.33■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 STYK1Q6J9G0 422 aa20.33■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 KCNN4O15554 427 aa20.33■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 PRAMEP78395 509 aa20.33■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 POU5F1BQ06416 359 aa20.33■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa20.33■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 GALNT4Q8N4A0 578 aa20.33■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 OR6B3Q8NGW1 331 aa20.33■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 ARHGEF26Q96DR7 871 aa20.33■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 CCDC90BQ9GZT6 254 aa20.33■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 SPON1Q9HCB6 807 aa20.33■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 AIPL1Q9NZN9 384 aa20.33■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 MYO5BQ9ULV0 1848 aa20.33■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 PIK3R2O00459 728 aa20.32■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 ATP6V1B1P15313 513 aa20.32■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 PTPN4P29074 926 aa20.32■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa20.32■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 KIFC3Q9BVG8 833 aa20.32■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 GGA2Q9UJY4 613 aa20.32■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa20.32■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 SPAG6O75602 509 aa20.32■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 DPEP1P16444 411 aa20.32■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 EPC2Q52LR7 807 aa20.32■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 TXNRD3Q86VQ6 643 aa20.32■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 KCND2Q9NZV8 630 aa20.32■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 GOLGA8CPA6NN73 597 aa20.32■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 CES2O00748 559 aa20.32■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 CASP4P49662 377 aa20.32■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 C16orf86Q6ZW13 317 aa20.32■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 CD302Q8IX05 232 aa20.32■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 TATDN2Q93075 761 aa20.32■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 FAM111AQ96PZ2 611 aa20.32■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 AIM2O14862 343 aa20.32■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 LAMB3Q13751 1172 aa20.32■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 ZNF507Q8TCN5 953 aa20.32■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 PGM2Q96G03 612 aa20.32■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 MCEEQ96PE7 176 aa20.32■□□□□ 0.84
SUDS3-204ENST00000543473 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms