RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF341Q9BYN7 854 aa5.07□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM168Q9H0V1 697 aa5.07□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 L2HGDHQ9H9P8 463 aa5.07□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 CD248Q9HCU0 757 aa5.07□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 GPR108Q9NPR9 543 aa5.07□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 KCNH7Q9NS40 1196 aa5.07□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 RIC8BQ9NVN3 520 aa5.07□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 CXCL11O14625 94 aa5.06□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 GPR42O15529 346 aa5.06□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 HMMRO75330 724 aa5.06□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 GNAI2P04899 355 aa5.06□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 HMGA2P52926 109 aa5.06□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 EPHB4P54760 987 aa5.06□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 PPP2CBP62714 309 aa5.06□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 PPP2CAP67775 309 aa5.06□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 SP3Q02447 781 aa5.06□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 ATP2B3Q16720 1220 aa5.06□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 PHF19Q5T6S3 580 aa5.06□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 CRIP3Q6Q6R5 217 aa5.06□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 TEPPQ6URK8 271 aa5.06□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 G2E3Q7L622 706 aa5.06□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 NLGN4XQ8N0W4 816 aa5.06□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 VGLL2Q8N8G2 317 aa5.06□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 ZSWIM3Q96MP5 696 aa5.06□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 CLIC6Q96NY7 704 aa5.06□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 AMNQ9BXJ7 453 aa5.06□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 IDI2Q9BXS1 227 aa5.06□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 KLC2Q9H0B6 622 aa5.06□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 VEZTQ9HBM0 779 aa5.06□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 TOMM22Q9NS69 142 aa5.06□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 HSPBP1Q9NZL4 362 aa5.06□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 TRHDEQ9UKU6 1024 aa5.06□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 DOCK2Q92608 1830 aa5.05□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa5.05□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 K7ESF4 209 aa5.05□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 CYR61O00622 381 aa5.05□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 TLR2O60603 784 aa5.05□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 FGFR2P21802 821 aa5.05□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 AOAHP28039 575 aa5.05□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 ACVRL1P37023 503 aa5.05□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 PHC1P78364 1004 aa5.05□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC158Q5M9N0 1113 aa5.05□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 GORABQ5T7V8 394 aa5.05□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 CD276Q5ZPR3 534 aa5.05□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 LRSAM1Q6UWE0 723 aa5.05□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa5.05□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 NECAB2Q7Z6G3 386 aa5.05□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 ANKRD23Q86SG2 305 aa5.05□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 DNERQ8NFT8 737 aa5.05□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa5.05□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 SUCLG2Q96I99 432 aa5.05□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 WRNIP1Q96S55 665 aa5.05□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 USP44Q9H0E7 712 aa5.05□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 AS3MTQ9HBK9 375 aa5.05□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 SLC39A2Q9NP94 309 aa5.05□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 MAST2Q6P0Q8 1798 aa5.05□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 ATRNL1Q5VV63 1379 aa5.04□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 GAKO14976 1311 aa5.04□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa5.04□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 PRAMEF25A6NGN4 478 aa5.04□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 ALG1L2C9J202 215 aa5.04□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 UBE2Q2LH0YL09 131 aa5.04□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 GOLGA6L22H0YM25 854 aa5.04□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 FOXP2O15409 715 aa5.04□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 PLIN1O60240 522 aa5.04□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 PCDHGA12O60330 932 aa5.04□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 TAF5LO75529 589 aa5.04□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 IL18BPO95998 194 aa5.04□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 NT5C2P49902 561 aa5.04□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 UBXN2AP68543 259 aa5.04□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP5.04□□□□□ -1.62e-9■■■□□ 18.4
HDAC2-216ENST00000523628 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa5.04□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 GPR158Q5T848 1215 aa5.04□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa5.04□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF585AQ6P3V2 769 aa5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms