RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 HEPACAM2A8MVW5 462 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 APBB3O95704 486 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF883P0CG24 379 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 SPECC1Q5M775 1068 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 CEP76Q8TAP6 659 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 YIPF1Q9Y548 306 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 CDY1Q9Y6F8 540 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 ANO9A1A5B4 782 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 STK25O00506 426 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 TNFRSF10BO14763 440 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 ADAM12O43184 909 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 VNN2O95498 520 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 TKTP29401 623 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 GAS6Q14393 721 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 INF2Q27J81 1249 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 WDR44Q5JSH3 913 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 LIMS2Q7Z4I7 341 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 SPPL2BQ8TCT7 592 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 PARP2Q9UGN5 583 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 STYXL1Q9Y6J8 313 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 EYSQ5T1H1 3165 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 NEMFO60524 1076 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 SEC24AO95486 1093 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF423Q2M1K9 1284 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 PLK5Q496M5 336 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 PMS2CLQ68D20 193 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 POTEDQ86YR6 584 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 DEPTORQ8TB45 409 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 TBC1D32Q96NH3 1257 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 LRRC2Q9BYS8 371 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 PCED1AQ9H1Q7 454 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 HEBP1Q9NRV9 189 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 SNTG2Q9NY99 539 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 RPP40O75818 363 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 CLTAP09496 248 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 SPEM2Q0P670 501 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 CENPPQ6IPU0 288 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 YAF2Q8IY57 180 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 IGSF22Q8N9C0 903 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 BPIFB1Q8TDL5 484 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 CDT1Q9H211 546 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 EHD2Q9NZN4 543 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 CEP72Q9P209 647 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 B4GALT5O43286 388 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 SP100P23497 879 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 GDI1P31150 447 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 MAGEA11P43364 429 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 NCKAP1LP55160 1127 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 NTHL1P78549 312 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 NCAPH2Q6IBW4 605 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 SLC23A3Q6PIS1 610 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 CCDC82Q8N4S0 544 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 OVCA2Q8WZ82 227 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 ACAP3Q96P50 834 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 P2RY13Q9BPV8 354 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 DNAJC25Q9H1X3 360 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 ODF2LQ9ULJ1 636 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM150BA6NC51 233 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 C2CD2LO14523 706 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 TOM1L1O75674 476 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 RPL17P18621 184 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 ALDH1A3P47895 512 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 FNTBP49356 437 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 CLCNKBP51801 687 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 CATSPER3Q86XQ3 398 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 CPA6Q8N4T0 437 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 SPATA17Q96L03 361 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 ASB7Q9H672 318 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 IL21Q9HBE4 155 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 C2CD2Q9Y426 696 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 TTC26A0AVF1 554 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 CAPN8A6NHC0 703 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 FAM189A1O60320 539 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 LRRN2O75325 713 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 AKAP5P24588 427 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4D-210ENST00000503258 CCR2P41597 374 aa8.42□□□□□ -1.06
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