RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490444.2

PUM3-204, Transcript of pumilio RNA binding family member 3, human

TSL 5

Gene PUM3, Length 340 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM3-204	ENST00000490444	KCNAB3	O43448	404 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	IL33	O95760	270 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	ALDH1A3	P47895	512 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	USP14	P54578	494 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	CDC42EP1	Q00587	391 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	TLE1	Q04724	770 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	BRD3	Q15059	726 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	MAP9	Q49MG5	647 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	AFMID	Q63HM1	303 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	NXN	Q6DKJ4	435 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	RINL	Q6ZS11	566 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	XYLT1	Q86Y38	959 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	MIER2	Q8N344	545 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	PAF1	Q8N7H5	531 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	HPS3	Q969F9	1004 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	AIFM3	Q96NN9	605 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	MYOC	Q99972	504 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	RNF7	Q9UBF6	113 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444		B5MCH6	92 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	NPHP1	O15259	732 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	CAND2	O75155	1236 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	GPR32	O75388	356 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	IL2RB	P14784	551 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	VCAM1	P19320	739 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	CD53	P19397	219 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	DDC	P20711	480 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	SLC6A4	P31645	630 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	CYP2C19	P33261	490 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	PTPN7	P35236	360 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	GNAL	P38405	381 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	CTXN1	P60606	82 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	POU5F1B	Q06416	359 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	FOXF2	Q12947	444 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	PPP2R5A	Q15172	486 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	DACT2	Q5SW24	774 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	PCGF5	Q86SE9	256 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	FAM83A	Q86UY5	434 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	CHPF	Q8IZ52	775 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	LCORL	Q8N3X6	602 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	PDILT	Q8N807	584 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	RUNDC1	Q96C34	613 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	MVB12A	Q96EY5	273 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	TAAR9	Q96RI9	348 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	NEU1	Q99519	415 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	MRI1	Q9BV20	369 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	KIF3B	O15066	747 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	SBK3	P0C264	359 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	MAN1A1	P33908	653 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	AVPR1B	P47901	424 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	MAP2K6	P52564	334 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	HK3	P52790	923 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	PER3	P56645	1201 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	CLRN1	P58418	232 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	SNAPC2	Q13487	334 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	GTF2H3	Q13889	308 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	RAB39A	Q14964	217 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PUM3-204	ENST00000490444	VPS72	Q15906	364 aa		3.1	□□□□□ -1.91

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