RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 FRYQ5TBA9 3013 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 LAMA1P25391 3075 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM208BQ5VWN6 2430 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 H7C4K7 107 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 K7ERI5 159 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 SYN3O14994 580 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 MYL4P12829 197 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 GJA1P17302 382 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 GRM5P41594 1212 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 CCR3P51677 355 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 NEK4P51957 841 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 SATB1Q01826 763 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 PKP1Q13835 747 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 ANKRD1Q15327 319 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF568Q3ZCX4 644 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 CTXN3Q4LDR2 81 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 IQCEQ6IPM2 695 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 KIFAP3Q92845 792 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 BHMT2Q9H2M3 363 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC38A7Q9NVC3 462 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 TNFSF13BQ9Y275 285 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 NUB1Q9Y5A7 615 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 CCDC169A6NNP5 214 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 MOSPD3O75425 235 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 MICAL2O94851 1124 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 OR52Z1P0C646 297 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 CCNE1P24864 410 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 GUCY1B3Q02153 619 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 TWF1Q12792 350 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF174Q15697 407 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 ECM1Q16610 540 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 XKR4Q5GH76 650 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 TPGS2Q68CL5 300 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 ALKAL1Q6UXT8 129 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 IER2Q9BTL4 223 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 ZMYND15Q9H091 742 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 CEP72Q9P209 647 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 NCANO14594 1321 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 IGF2RP11717 2491 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 ATRXP46100 2492 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF263O14978 683 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 RETP07949 1114 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 ADRB1P08588 477 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 HARSP12081 509 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 CXCL12P48061 93 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 PEX3P56589 373 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 DMWDQ09019 674 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 GAS6Q14393 721 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 TEAD2Q15562 447 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 PPM1JQ5JR12 505 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF280DQ6N043 979 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 MAMSTRQ6ZN01 415 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 TRPV5Q9NQA5 729 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 ASAH2Q9NR71 780 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 HEPACAM2A8MVW5 462 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC30A4O14863 429 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 CHRNB1P11230 501 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 CPB1P15086 417 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 KCNE1P15382 129 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 NPTX2P47972 431 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 FNTBP49356 437 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 CCDC183Q5T5S1 534 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 HAUS3Q68CZ6 603 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 MFSD6LQ8IWD5 586 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 NETO1Q8TDF5 533 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 SUSD3Q96L08 255 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 ACAP3Q96P50 834 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 TCHPQ9BT92 498 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 PTPRHQ9HD43 1115 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 KIAA1024Q9UPX6 916 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 ANK1P16157 1881 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 GREB1Q4ZG55 1949 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 SYCE3A1L190 88 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC38A8A6NNN8 435 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-207ENST00000484547 HRO43593 1189 aa12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms