RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477197.1

WDR48-209, Transcript of WD repeat domain 48, humanhuman

TSL 4

Gene WDR48, Length 574 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR48-209ENST00000477197 DDCP20711 480 aa6.46□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 ALDH1A3P47895 512 aa6.46□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 MAP2K6P52564 334 aa6.46□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 ZNF131P52739 623 aa6.46□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 PRKG2Q13237 762 aa6.46□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 RAB39AQ14964 217 aa6.46□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 AGAP9Q5VTM2 703 aa6.46□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 TCTN3Q6NUS6 607 aa6.46□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 TAX1BP1Q86VP1 789 aa6.46□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa6.46□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 PPP1R35Q8TAP8 253 aa6.46□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 NELL2Q99435 816 aa6.46□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 TCF25Q9BQ70 676 aa6.46□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 LRFN3Q9BTN0 628 aa6.46□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 TMEM140Q9NV12 185 aa6.46□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 NCDNQ9UBB6 729 aa6.46□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 TPCN1Q9ULQ1 816 aa6.46□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 LRRC14BA6NHZ5 514 aa6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 SMTNL1A8MU46 457 aa6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 TUSC2O75896 110 aa6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 RAD17O75943 681 aa6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 UBXN7O94888 489 aa6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 IL2RBP14784 551 aa6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 CHKAP35790 457 aa6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 STT3AP46977 705 aa6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 HK3P52790 923 aa6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 USP14P54578 494 aa6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 APBA1Q02410 837 aa6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 NOGQ13253 232 aa6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 FAM214AQ32MH5 1076 aa6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 TUBB8Q3ZCM7 444 aa6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 FAM47AQ5JRC9 791 aa6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 AFMIDQ63HM1 303 aa6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 FAM111BQ6SJ93 734 aa6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 TBC1D20Q96BZ9 403 aa6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 GCC1Q96CN9 775 aa6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 TMX3Q96JJ7 454 aa6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 CLPTM1LQ96KA5 538 aa6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 CGRRF1Q99675 332 aa6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 CRB3Q9BUF7 120 aa6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 TMEM60Q9H2L4 133 aa6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 ACTL7AQ9Y615 435 aa6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 ITIH6Q6UXX5 1313 aa6.45□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 FAM227AF5H4B4 570 aa6.44□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 TLR5O60602 858 aa6.44□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 FTLP02792 175 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 SYN1P17600 705 aa6.44□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 PTPN7P35236 360 aa6.44□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 KRT20P35900 424 aa6.44□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 GRK6P43250 576 aa6.44□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 CTXN1P60606 82 aa6.44□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 GRM1Q13255 1194 aa6.44□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 VPS53Q5VIR6 699 aa6.44□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa6.44□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 DOK3Q7L591 496 aa6.44□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 PLXDC1Q8IUK5 500 aa6.44□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 FUKQ8N0W3 1084 aa6.44□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 DNERQ8NFT8 737 aa6.44□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 TBC1D31Q96DN5 1066 aa6.44□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 OR14A2Q96R54 314 aa6.44□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.44□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 SMYD2Q9NRG4 433 aa6.44□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 HELLSQ9NRZ9 838 aa6.44□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 PLA2G3Q9NZ20 509 aa6.44□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.44□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 PATE3B3GLJ2 98 aa6.43□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 B5MCH6 92 aa6.43□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa6.43□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 TEX33O43247 280 aa6.43□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 FOXS1O43638 330 aa6.43□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 IGHDP01880 384 aa6.43□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 INHBBP09529 407 aa6.43□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 MYBP10242 640 aa6.43□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 CAPN3P20807 821 aa6.43□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 HOXC13P31276 330 aa6.43□□□□□ -1.38
WDR48-209ENST00000477197 UBA7P41226 1012 aa6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms