RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	CES5A	Q6NT32	575 aa		19.17	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		19.17	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	USP37	Q86T82	979 aa		19.17	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	19.17	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	CD320	Q9NPF0	282 aa		19.17	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		19.17	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	DPP7	Q9UHL4	492 aa		19.17	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		19.17	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		19.17	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	ADAM12	O43184	909 aa		19.16	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	TGM5	O43548	720 aa		19.16	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	PRCP	P42785	496 aa		19.16	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	TAF6	P49848	677 aa		19.16	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	PSMD6	Q15008	389 aa		19.16	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		19.16	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		19.16	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	WDR49	Q8IV35	697 aa		19.16	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		19.16	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		19.16	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		19.16	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	SENP8	Q96LD8	212 aa		19.16	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	ZNF560	Q96MR9	790 aa		19.16	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	19.16	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	19.16	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	INTS13	Q9NVM9	706 aa		19.16	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	MTRR	Q9UBK8	725 aa		19.16	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		19.16	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	19.16	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902		M0QZQ0	153 aa		19.15	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	BIN1	O00499	593 aa		19.15	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	SPTLC1	O15269	473 aa		19.15	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	ODC1	P11926	461 aa		19.15	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	NR2F2	P24468	414 aa		19.15	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	19.15	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	19.15	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	BFSP1	Q12934	665 aa		19.15	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	STIM1	Q13586	685 aa		19.15	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	SV2C	Q496J9	727 aa		19.15	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		19.15	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		19.15	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		19.15	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	GJD3	Q8N144	294 aa		19.15	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	SPATA20	Q8TB22	786 aa		19.15	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	DMAC2	Q9NW81	257 aa		19.15	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		19.15	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		19.15	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		19.15	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		19.15	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	PTPRJ	Q12913	1337 aa		19.15	■□□□□ 0.66
USP19-210	ENST00000465902	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		19.14	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		19.14	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	CYB561D2	O14569	222 aa		19.14	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	WEE2	P0C1S8	567 aa		19.14	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	PAX3	P23760	479 aa		19.14	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	PNPLA4	P41247	253 aa		19.14	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	19.14	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	CASP4	P49662	377 aa		19.14	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	RBP5	P82980	135 aa		19.14	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	ZNF280D	Q6N043	979 aa		19.14	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	19.14	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	METTL23	Q86XA0	190 aa		19.14	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		19.14	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		19.14	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	CGRRF1	Q99675	332 aa		19.14	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	TSG101	Q99816	390 aa		19.14	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		19.14	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	S1PR5	Q9H228	398 aa		19.14	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		19.14	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		19.14	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		19.13	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	KPNA7	A9QM74	516 aa		19.13	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	PHACTR2	O75167	634 aa		19.13	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	CLSTN1	O94985	981 aa		19.13	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	ITIH3	Q06033	890 aa		19.13	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	ADAM9	Q13443	819 aa		19.13	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	RAB33A	Q14088	237 aa		19.13	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	MYBPC2	Q14324	1141 aa		19.13	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	LIN9	Q5TKA1	542 aa		19.13	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		19.13	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	19.13	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		19.13	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		19.13	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		19.13	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		19.13	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		19.12	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	PSMA7	O14818	248 aa		19.12	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	RFPL2	O75678	378 aa		19.12	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	CPB1	P15086	417 aa		19.12	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	MYO1E	Q12965	1108 aa		19.12	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	19.12	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	19.12	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	19.12	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		19.12	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		19.12	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		19.12	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	LILRA6	Q6PI73	481 aa		19.12	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		19.12	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		19.12	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		19.12	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	SIX4	Q9UIU6	781 aa		19.12	■□□□□ 0.65

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