RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429160.1

UBXN7-205, Transcript of UBX domain protein 7, human

TSL 2

Gene UBXN7, Length 3,158 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN7-205	ENST00000429160	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	HASPIN	Q8TF76	798 aa		11.89	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		11.89	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		11.89	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	MYO9B	Q13459	2157 aa		11.89	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	ABLIM3	O94929	683 aa		11.88	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	BRCC3	P46736	316 aa		11.88	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		11.88	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		11.88	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		11.88	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		11.88	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		11.88	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		11.88	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	LEMD2	Q8NC56	503 aa		11.88	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	SAAL1	Q96ER3	474 aa		11.88	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	DMAC2	Q9NW81	257 aa		11.88	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		11.88	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	LILRA4	P59901	499 aa		11.88	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	CYP24A1	Q07973	514 aa		11.88	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	MYO1E	Q12965	1108 aa		11.88	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	DPH6	Q7L8W6	267 aa		11.88	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		11.88	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		11.88	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		11.88	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	TMC2	Q8TDI7	906 aa		11.88	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	NXPE3	Q969Y0	559 aa		11.88	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		11.88	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		11.88	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	INTS13	Q9NVM9	706 aa		11.88	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		11.88	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	TISP43	B9A030	160 aa		11.87	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		11.87	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	MICAL2	O94851	1124 aa		11.87	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	CLUL1	Q15846	466 aa		11.87	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		11.87	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		11.87	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		11.87	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		11.87	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		11.87	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	FNBP1	Q96RU3	617 aa		11.87	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	CLUH	O75153	1309 aa		11.87	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	FGF19	O95750	216 aa		11.87	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	ATIC	P31939	592 aa		11.87	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	ELF1	P32519	619 aa		11.87	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	SENP8	Q96LD8	212 aa		11.87	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		11.87	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	OR1D2	P34982	312 aa		11.87	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	UBE2H	P62256	183 aa		11.87	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	SPATA20	Q8TB22	786 aa		11.87	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	RABGGTA	Q92696	567 aa		11.87	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	SMARCE1	Q969G3	411 aa		11.87	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		11.87	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		11.87	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		11.87	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		11.87	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		11.86	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	STX10	O60499	249 aa		11.86	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	CLDN10	P78369	228 aa		11.86	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	STK4	Q13043	487 aa		11.86	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	STIM1	Q13586	685 aa		11.86	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		11.86	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		11.86	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	ELMOD1	Q8N336	334 aa		11.86	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	HPS3	Q969F9	1004 aa		11.86	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	TSG101	Q99816	390 aa		11.86	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		11.86	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	KPNA7	A9QM74	516 aa		11.86	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	EXOC3	O60645	756 aa		11.86	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	PRR29	P0C7W0	189 aa		11.86	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	ATF2	P15336	505 aa		11.86	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	PALB2	Q86YC2	1186 aa		11.86	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	TAF4B	Q92750	862 aa		11.86	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		11.86	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	NR3C1	P04150	777 aa		11.85	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	C8A	P07357	584 aa		11.85	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	CASP1	P29466	404 aa		11.85	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	ROR1	Q01973	937 aa		11.85	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	GPR17	Q13304	367 aa		11.85	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		11.85	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	B3GALT6	Q96L58	329 aa		11.85	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		11.85	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	PIDD1	Q9HB75	910 aa		11.85	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		11.85	□□□□□ -0.51
UBXN7-205	ENST00000429160	ASB3	Q9Y575	518 aa		11.85	□□□□□ -0.51

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