RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 GLYCTKQ8IVS8 523 aa7.28□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 GPR152Q8TDT2 470 aa7.28□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 RTP3Q9BQQ7 232 aa7.28□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 PAAF1Q9BRP4 392 aa7.28□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 APOL6Q9BWW8 343 aa7.28□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 NT5C3AQ9H0P0 336 aa7.28□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 CSRNP2Q9H175 543 aa7.28□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa7.28□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 WNT16Q9UBV4 365 aa7.28□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 R4GN57 208 aa7.28□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 SPTBN4Q9H254 2564 aa7.28□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 VPS13AQ96RL7 3174 aa7.28□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 ANHXE9PGG2 379 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 ASAP2O43150 1006 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 LRRN2O75325 713 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 DCNP07585 359 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 GLULP15104 373 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 GLRA2P23416 452 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 ARL2P36404 184 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 ID4P47928 161 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 NTHL1P78549 312 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 GALNT17Q6IS24 598 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 FUT10Q6P4F1 479 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 TBC1D17Q9HA65 648 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 KLK14Q9P0G3 267 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 STK39Q9UEW8 545 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 PPME1Q9Y570 386 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 CPLX1O14810 134 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 TBX3O15119 743 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 ADAM12O43184 909 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 GAS2O43903 313 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 ERLIN2O94905 339 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 NPTXRO95502 500 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 SRFP11831 508 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 LAMP2P13473 410 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 AXLP30530 894 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 RAC1P63000 192 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 HTR4Q13639 388 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 SPECC1Q5M775 1068 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 RTP2Q5QGT7 225 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 NOTUMQ6P988 496 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 CYP26C1Q6V0L0 522 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 TPH2Q8IWU9 490 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 CNNM3Q8NE01 707 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 TCP11Q8WWU5 503 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 RMDN1Q96DB5 314 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 HSD17B14Q9BPX1 270 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 FOXQ1Q9C009 403 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 UBN1Q9NPG3 1134 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 FNIP2Q9P278 1114 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 TPCN1Q9ULQ1 816 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 USP20Q9Y2K6 914 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 GIT1Q9Y2X7 761 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 NUMBLQ9Y6R0 609 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 LYPLA2O95372 231 aa7.26□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 EDN1P05305 212 aa7.26□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 SP9P0CG40 484 aa7.26□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 FDPSP14324 419 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 RARRES1P49788 294 aa7.26□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 GPC5P78333 572 aa7.26□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 POU5F1BQ06416 359 aa7.26□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 NAB2Q15742 525 aa7.26□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 PARM1Q6UWI2 310 aa7.26□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 OTUD6AQ7L8S5 288 aa7.26□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 EXOC8Q8IYI6 725 aa7.26□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 PIGOQ8TEQ8 1089 aa7.26□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 HASPINQ8TF76 798 aa7.26□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 HDAC7Q8WUI4 952 aa7.26□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 FGF14Q92915 247 aa7.26□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC51Q96ER9 411 aa7.26□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 CLSTN3Q9BQT9 956 aa7.26□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 COLEC11Q9BWP8 271 aa7.26□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 TM6SF1Q9BZW5 370 aa7.26□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa7.26□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 GPRC5CQ9NQ84 441 aa7.26□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 PDRG1Q9NUG6 133 aa7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms