RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428482.5

HDLBP-216, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-216ENST00000428482 CUEDC2Q9H467 287 aa11.09□□□□□ -0.63
HDLBP-216ENST00000428482 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP11.09□□□□□ -0.63
HDLBP-216ENST00000428482 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa11.09□□□□□ -0.63
HDLBP-216ENST00000428482 SIX4Q9UIU6 781 aa11.09□□□□□ -0.63
HDLBP-216ENST00000428482 FBXL5Q9UKA1 691 aa11.09□□□□□ -0.63
HDLBP-216ENST00000428482 PCDHB8Q9UN66 801 aa11.09□□□□□ -0.63
HDLBP-216ENST00000428482 PI4K2BG5E9Z4 385 aa11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 NARSO43776 548 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 ZMYND10O75800 440 aa11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 ITGB3P05106 788 aa11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 CMA1P23946 247 aa11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 MTHFRP42898 656 aa11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 CASP4P49662 377 aa11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 ITIH3Q06033 890 aa11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 STK4Q13043 487 aa11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 KMT5BQ4FZB7 885 aa11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF280DQ6N043 979 aa11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 CES5AQ6NT32 575 aa11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 CNNM4Q6P4Q7 775 aa11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 OSTM1Q86WC4 334 aa11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 SYCP3Q8IZU3 236 aa11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 LRFN3Q9BTN0 628 aa11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 MAGEF1Q9HAY2 307 aa11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 PDE11AQ9HCR9 933 aa11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 HSPBP1Q9NZL4 362 aa11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 UBE4BO95155 1302 aa11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 MUC6Q6W4X9 2439 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 ANO9A1A5B4 782 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 M0QZQ0 153 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 SYN3O14994 580 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP11.07□□□□□ -0.645e-6■□□□□ 8.9
HDLBP-216ENST00000428482 CPB1P15086 417 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 CEBPBP17676 345 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 PTPN21Q16825 1174 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 BMT2Q1RMZ1 405 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 CTXN3Q4LDR2 81 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 LIN9Q5TKA1 542 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 SLC8B1Q6J4K2 584 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 HFE2Q6ZVN8 426 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 CEP57L1Q8IYX8 460 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 BEST2Q8NFU1 509 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 ITFG1Q8TB96 612 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 RIPOR3Q96MK2 946 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 EXOC1Q9NV70 894 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 STK39Q9UEW8 545 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 POLIQ9UNA4 740 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 C2CD2Q9Y426 696 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 YIPF1Q9Y548 306 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 INSL5Q9Y5Q6 135 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 MIA3Q5JRA6 1907 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 MTMR11A4FU01 709 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 PIRO00625 290 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 EXTL3O43909 919 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 PAPLNO95428 1278 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 SLFN14P0C7P3 912 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 CYP3A5P20815 502 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 GARTP22102 1010 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 RPL9P32969 192 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 CCR2P41597 374 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 SYKP43405 635 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 GPR15P49685 360 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 CREMQ03060 361 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 DPYDQ12882 1025 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 BFSP1Q12934 665 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 PNOCQ13519 176 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 RAB33AQ14088 237 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 PPM1LQ5SGD2 360 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 DSTYKQ6XUX3 929 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 KRBA2Q6ZNG9 492 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 ANKS3Q6ZW76 656 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 GPD1LQ8N335 351 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 ENGASEQ8NFI3 743 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 GPT2Q8TD30 523 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 TCEAL4Q96EI5 215 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 ASIC4Q96FT7 647 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 SENP8Q96LD8 212 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 NECTIN4Q96NY8 510 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 DNAJC25Q9H1X3 360 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 DPP3Q9NY33 737 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 L1RE1Q9UN81 338 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 EXOC7Q9UPT5 735 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-216ENST00000428482 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa11.06□□□□□ -0.64
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