RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 VWA8A3KMH1 1905 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 TSC2P49815 1807 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 A0A1W2PQC6 194 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 TADA2AO75478 443 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 STAU1O95793 577 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 CA3P07451 260 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 PBX2P40425 430 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 MRE11P49959 708 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF75DP51815 510 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 VRTNQ9H8Y1 702 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 MARCH5Q9NX47 278 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 SIK3Q9Y2K2 1263 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 SNX9Q9Y5X1 595 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 LINC01553A4QN01 128 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 CARNS1A5YM72 827 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 KPNA7A9QM74 516 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 SPTLC1O15269 473 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 TNNC1P63316 161 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 APBA1Q02410 837 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 PBX4Q9BYU1 374 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 MSRAQ9UJ68 235 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 ADAM28Q9UKQ2 775 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 P4HA1P13674 534 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 BRCC3P46736 316 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 RAB30Q15771 203 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 LRIT3Q3SXY7 679 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 CD300LGQ6UXG3 332 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 DSTYKQ6XUX3 929 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 PPM1KQ8N3J5 372 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 TATDN2Q93075 761 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 NIF3L1Q9GZT8 377 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 APEX2Q9UBZ4 518 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 POLIQ9UNA4 740 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 I3L4J1 428 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 LINC00271P0C7V0 271 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 TIGD5Q53EQ6 642 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 ARHGEF19Q8IW93 802 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 NEK11Q8NG66 645 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 TMEM169Q96HH4 297 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 IGSF21Q96ID5 467 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 MMS19Q96T76 1030 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 SIX2Q9NPC8 291 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 RWDD3Q9Y3V2 267 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 ADCY5O95622 1261 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 PAX3P23760 479 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 CTNNB1P35222 781 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 PPM1AP35813 382 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 PBX1P40424 430 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 RRAGAQ7L523 313 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 SLC39A11Q8N1S5 342 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 SENP8Q96LD8 212 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 PLCB1Q9NQ66 1216 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 GDAP2Q9NXN4 497 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 SPG21Q9NZD8 308 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 LAMA3Q16787 3333 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 TRAPPC3O43617 180 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 ARHGEF15O94989 841 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 ASPAP45381 313 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 FUT10Q6P4F1 479 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 GJB7Q6PEY0 223 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 VSTM4Q8IW00 320 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 CYB561D2O14569 222 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 EPHB6O15197 1021 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 HUS1O60921 280 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 CUL2Q13617 745 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 APPL2Q8NEU8 664 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 SUSD3Q96L08 255 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 ARID3AQ99856 593 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 C17orf80Q9BSJ5 609 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 SMYD3Q9H7B4 428 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXA4-202ENST00000428284 ITIH6Q6UXX5 1313 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXA4-202ENST00000428284 NOL4O94818 638 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXA4-202ENST00000428284 ODC1P11926 461 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXA4-202ENST00000428284 UCHL3P15374 230 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXA4-202ENST00000428284 BMPR1AP36894 532 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXA4-202ENST00000428284 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.12
HOXA4-202ENST00000428284 GCNT1Q02742 428 aa22.08■■□□□ 1.12
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