RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 ITGB3P05106 788 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 SLC10A6Q3KNW5 377 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 IFT20Q8IY31 132 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 CD101Q93033 1021 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 GDF3Q9NR23 364 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 AMACRQ9UHK6 382 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 NFU1Q9UMS0 254 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 F2P00734 622 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 GUCY2FP51841 1108 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 BEX3Q00994 111 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 CDHR5Q9HBB8 845 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 ADAM22Q9P0K1 906 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 PEX5P50542 639 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 HIC1Q14526 733 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 WDR72Q3MJ13 1102 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 ERVK-5Q9HDB9 667 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 A0A1B0GUA9 196 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 CDH8P55286 799 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 ORC1Q13415 861 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 TRIM72Q6ZMU5 477 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 RUFY4Q6ZNE9 571 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 USP6NLQ92738 828 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 RRN3P2A6NIE6 340 aa24.72■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC188H7C350 402 aa24.72■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 GJB6O95452 261 aa24.72■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 PYGMP11217 842 aa24.72■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 LLGL1Q15334 1064 aa24.72■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF410Q86VK4 478 aa24.72■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 OSMRQ99650 979 aa24.72■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 WNT8AQ9H1J5 351 aa24.72■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 HPCAL4Q9UM19 191 aa24.72■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 CEP350Q5VT06 3117 aa24.72■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 MYBL1P10243 752 aa24.72■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 MFSD10Q14728 455 aa24.72■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 TFAP2BQ92481 460 aa24.72■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC102AQ96A19 550 aa24.72■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 TRIM11Q96F44 468 aa24.72■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 ADAMTS10Q9H324 1103 aa24.72■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 MYL3P08590 195 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 TNFRSF8P28908 595 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 EPHB4P54760 987 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 CRHR2Q13324 411 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF667Q5HYK9 610 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 ADPGKQ9BRR6 497 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 CXCL16Q9H2A7 254 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 NRCAMQ92823 1304 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 SLC10A3P09131 477 aa24.7■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 CYP2C9P11712 490 aa24.7■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 RGS2P41220 211 aa24.7■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 SMYD3Q9H7B4 428 aa24.7■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 GJD2Q9UKL4 321 aa24.7■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 TTI1O43156 1089 aa24.7■■□□□ 1.54
FAAP20-209ENST00000428120 FAM153BP0C7A2 387 aa24.7■■□□□ 1.54
FAAP20-209ENST00000428120 CTGFP29279 349 aa24.7■■□□□ 1.54
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM132DQ14C87 1099 aa24.7■■□□□ 1.54
FAAP20-209ENST00000428120 FAM153CQ494X1 144 aa24.7■■□□□ 1.54
FAAP20-209ENST00000428120 LIN9Q5TKA1 542 aa24.7■■□□□ 1.54
FAAP20-209ENST00000428120 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
FAAP20-209ENST00000428120 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
FAAP20-209ENST00000428120 CXorf38Q8TB03 319 aa24.7■■□□□ 1.54
FAAP20-209ENST00000428120 ACAP3Q96P50 834 aa24.7■■□□□ 1.54
FAAP20-209ENST00000428120 ZIC5Q96T25 663 aa24.7■■□□□ 1.54
FAAP20-209ENST00000428120 FAM153AQ9UHL3 310 aa24.7■■□□□ 1.54
FAAP20-209ENST00000428120 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa24.7■■□□□ 1.54
FAAP20-209ENST00000428120 MYO1FO00160 1098 aa24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-209ENST00000428120 GPR32O75388 356 aa24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-209ENST00000428120 NPTXRO95502 500 aa24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-209ENST00000428120 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-209ENST00000428120 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-209ENST00000428120 PTP4A2Q12974 167 aa24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-209ENST00000428120 MAMLD1Q13495 774 aa24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-209ENST00000428120 CATSPER4Q7RTX7 472 aa24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-209ENST00000428120 DNAJB3Q8WWF6 145 aa24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-209ENST00000428120 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-209ENST00000428120 SDCBP2Q9H190 292 aa24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-209ENST00000428120 ASB7Q9H672 318 aa24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC66A2RUB6 948 aa24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-209ENST00000428120 FAM193AP78312 1265 aa24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-209ENST00000428120 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-209ENST00000428120 CITO14578 2027 aa24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-209ENST00000428120 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa24.68■■□□□ 1.54
FAAP20-209ENST00000428120 CD19P15391 556 aa24.68■■□□□ 1.54
FAAP20-209ENST00000428120 PSEN2P49810 448 aa24.68■■□□□ 1.54
FAAP20-209ENST00000428120 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
FAAP20-209ENST00000428120 GPS2Q13227 327 aa24.68■■□□□ 1.54
FAAP20-209ENST00000428120 SEL1L2Q5TEA6 688 aa24.68■■□□□ 1.54
FAAP20-209ENST00000428120 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa24.68■■□□□ 1.54
FAAP20-209ENST00000428120 APBA2Q99767 749 aa24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms