RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAEAQ7L5Y9 396 aa18.16■□□□□ 0.5
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TTC8Q8TAM2 541 aa18.16■□□□□ 0.5
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM209Q96SK2 561 aa18.16■□□□□ 0.5
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PCDHA12Q9UN75 941 aa18.16■□□□□ 0.5
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NUB1Q9Y5A7 615 aa18.16■□□□□ 0.5
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPAG17Q6Q759 2223 aa18.16■□□□□ 0.5
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SDK1Q7Z5N4 2213 aa18.16■□□□□ 0.5
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PODXLO00592 558 aa18.15■□□□□ 0.5
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CPB1P15086 417 aa18.15■□□□□ 0.5
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATP2B1P20020 1258 aa18.15■□□□□ 0.5
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPS6KB1P23443 525 aa18.15■□□□□ 0.5
RFX3-AS1-201ENST00000423112 YARSP54577 528 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CREB5Q02930 508 aa18.15■□□□□ 0.5
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP18.15■□□□□ 0.5
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa18.15■□□□□ 0.5
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EEF1DP3Q658K8 133 aa18.15■□□□□ 0.5
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
RFX3-AS1-201ENST00000423112 APPL2Q8NEU8 664 aa18.15■□□□□ 0.5
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PIGOQ8TEQ8 1089 aa18.15■□□□□ 0.5
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIF12Q96FN5 646 aa18.15■□□□□ 0.5
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TAF4O00268 1085 aa18.14■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FGF19O95750 216 aa18.14■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LIG1P18858 919 aa18.14■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPL9P32969 192 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EPHB3P54753 998 aa18.14■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DEPTORQ8TB45 409 aa18.14■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KCNB2Q92953 911 aa18.14■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZFYVE19Q96K21 471 aa18.14■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LRRC3Q9BY71 257 aa18.14■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC113Q9H0I3 377 aa18.14■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM9BQ9NQ34 198 aa18.14■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KCNJ14Q9UNX9 436 aa18.14■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa18.14■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 YIPF1Q9Y548 306 aa18.14■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LAMA1P25391 3075 aa18.13■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LNP1A1A4G5 178 aa18.13■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 XBP1P17861 261 aa18.13■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NAMPTP43490 491 aa18.13■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EFNA5P52803 228 aa18.13■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPP2R5AQ15172 486 aa18.13■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 XKR4Q5GH76 650 aa18.13■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATF7IP2Q5U623 682 aa18.13■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PKN3Q6P5Z2 889 aa18.13■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa18.13■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa18.13■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMC8Q8IU68 726 aa18.13■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BPIFB1Q8TDL5 484 aa18.13■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SUSD3Q96L08 255 aa18.13■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DSPP15924 2871 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PSMA5P28066 241 aa18.12■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WEE1P30291 646 aa18.12■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa18.12■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM196Q5HYL7 178 aa18.12■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C11orf74Q86VG3 221 aa18.12■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BEST2Q8NFU1 509 aa18.12■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AIFM3Q96NN9 605 aa18.12■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LRRC3BQ96PB8 259 aa18.12■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 USP20Q9Y2K6 914 aa18.12■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ASB3Q9Y575 518 aa18.12■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MCM4P33991 863 aa18.11■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GRM5P41594 1212 aa18.11■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ALDH1A3P47895 512 aa18.11■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AMPD2Q01433 879 aa18.11■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TNK2Q07912 1038 aa18.11■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BMP2KLQ5H9B9 411 aa18.11■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STXBP5Q5T5C0 1151 aa18.11■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ALKAL1Q6UXT8 129 aa18.11■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DDX12PQ92771 950 aa18.11■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATXN3LQ9H3M9 355 aa18.11■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MSRB2Q9Y3D2 182 aa18.11■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SNX14Q9Y5W7 946 aa18.11■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EDN1P05305 212 aa18.1■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MCM2P49736 904 aa18.1■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CALCRLQ16602 461 aa18.1■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPR158Q5T848 1215 aa18.1■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPIHBP1Q8IV16 184 aa18.1■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BSNDQ8WZ55 320 aa18.1■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EXOC4Q96A65 974 aa18.1■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NACC1Q96RE7 527 aa18.1■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MKNK1Q9BUB5 465 aa18.1■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC32A1Q9H598 525 aa18.1■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EBF1Q9UH73 591 aa18.1■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PCDHB8Q9UN66 801 aa18.1■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TNFSF13BQ9Y275 285 aa18.1■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NBEAQ8NFP9 2946 aa18.09■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AKAP13Q12802 2813 aa18.09■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RNF40O75150 1001 aa18.09■□□□□ 0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 APBB3O95704 486 aa18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.3 ms