RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 ADH1CP00326 375 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 ABL1P00519 1130 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 HMGCRP04035 888 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 IQCF3P0C7M6 154 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
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HDAC8-211ENST00000415409 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
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HDAC8-211ENST00000415409 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
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HDAC8-211ENST00000415409 YARSP54577 528 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
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HDAC8-211ENST00000415409 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
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HDAC8-211ENST00000415409 NOTUMQ6P988 496 aa7.12□□□□□ -1.27
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HDAC8-211ENST00000415409 RUFY4Q6ZNE9 571 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa7.12□□□□□ -1.27
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HDAC8-211ENST00000415409 OR5B17Q8NGF7 314 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 CD99L2Q8TCZ2 262 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 RAET1EQ8TD07 263 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 DNAJB3Q8WWF6 145 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 TAF4BQ92750 862 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 IRF7Q92985 503 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 KAT5Q92993 513 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 ERO1AQ96HE7 468 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 CPB2Q96IY4 423 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 KREMEN1Q96MU8 473 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 ACAP3Q96P50 834 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 PI4K2AQ9BTU6 479 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 ASB7Q9H672 318 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 SAGE1Q9NXZ1 904 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 HDAC6Q9UBN7 1215 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 TRIM10Q9UDY6 481 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 NAGPAQ9UK23 515 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 TFR2Q9UP52 801 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 JRKLQ9Y4A0 524 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 PTPRJQ12913 1337 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 LRRC37A2A6NM11 1700 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 FAM181BA6NEQ2 426 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 LACTBL1A8MY62 500 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 CFAP99D6REC4 459 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 DYNC1I1O14576 645 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 CYP26A1O43174 497 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 TREHO43280 583 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 FKTNO75072 461 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 CABYRO75952 493 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 MOCS3O95396 460 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 SGPL1O95470 568 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 NPTXRO95502 500 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 PGK1P00558 417 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM253P0C7T8 217 aa7.11□□□□□ -1.27
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HDAC8-211ENST00000415409 ELNP15502 786 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 HOXC8P31273 242 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 GRM5P41594 1212 aa7.11□□□□□ -1.27
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HDAC8-211ENST00000415409 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa7.11□□□□□ -1.27
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HDAC8-211ENST00000415409 CXCL17Q6UXB2 119 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 RNF180Q86T96 592 aa7.11□□□□□ -1.27
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HDAC8-211ENST00000415409 ZNF677Q86XU0 584 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 NT5DC4Q86YG4 428 aa7.11□□□□□ -1.27
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HDAC8-211ENST00000415409 CEP112Q8N8E3 955 aa7.11□□□□□ -1.27
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HDAC8-211ENST00000415409 SYT11Q9BT88 431 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 MTMR12Q9C0I1 747 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 PDCL3Q9H2J4 239 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 MAP10Q9P2G4 905 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 CDC23Q9UJX2 597 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 NENFQ9UMX5 172 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 DERAQ9Y315 318 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 DUSP10Q9Y6W6 482 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 MROH7Q68CQ1 1323 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
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