RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361909.8

CMTM3-201, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM3, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-201ENST00000361909 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.823e-8■■■■■ 27.8
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CMTM3-201ENST00000361909 TARSP26639 723 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
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CMTM3-201ENST00000361909 SLC45A4Q5BKX6 768 aa20.2■□□□□ 0.82
CMTM3-201ENST00000361909 OR52E8Q6IFG1 317 aa20.2■□□□□ 0.82
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CMTM3-201ENST00000361909 FAM86B2P0C5J1 330 aa20.19■□□□□ 0.82
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CMTM3-201ENST00000361909 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa20.18■□□□□ 0.82
CMTM3-201ENST00000361909 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa20.18■□□□□ 0.82
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CMTM3-201ENST00000361909 TGFB1I1O43294 461 aa20.18■□□□□ 0.82
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CMTM3-201ENST00000361909 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CMTM3-201ENST00000361909 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa20.18■□□□□ 0.82
CMTM3-201ENST00000361909 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
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CMTM3-201ENST00000361909 LAMB3Q13751 1172 aa20.17■□□□□ 0.82
CMTM3-201ENST00000361909 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CMTM3-201ENST00000361909 C10orf82Q8WW14 230 aa20.17■□□□□ 0.82
CMTM3-201ENST00000361909 UVRAGQ9P2Y5 699 aa20.17■□□□□ 0.82
CMTM3-201ENST00000361909 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
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CMTM3-201ENST00000361909 MAGEA13PA6NCF6 341 aa20.17■□□□□ 0.82
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CMTM3-201ENST00000361909 EPHB2P29323 1055 aa20.17■□□□□ 0.82
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CMTM3-201ENST00000361909 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa20.17■□□□□ 0.82
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CMTM3-201ENST00000361909 FGD4Q96M96 766 aa20.17■□□□□ 0.82
CMTM3-201ENST00000361909 ELP3Q9H9T3 547 aa20.17■□□□□ 0.82
CMTM3-201ENST00000361909 SEL1LQ9UBV2 794 aa20.17■□□□□ 0.82
CMTM3-201ENST00000361909 KCNH4Q9UQ05 1017 aa20.17■□□□□ 0.82
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CMTM3-201ENST00000361909 WDR4P57081 412 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
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CMTM3-201ENST00000361909 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.821e-6■□□□□ 9.5
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