RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 BBOX1O75936 387 aa23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 KRT10P13645 584 aa23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 RASSF2P50749 326 aa23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 CTC1Q2NKJ3 1217 aa23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 KAZNQ674X7 775 aa23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 KRT39Q6A163 491 aa23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 RGS9BPQ6ZS82 235 aa23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 CLNKQ7Z7G1 428 aa23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 PHC3Q8NDX5 983 aa23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 RFWD2Q8NHY2 731 aa23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 NRG4Q8WWG1 115 aa23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 GMCL1Q96IK5 515 aa23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 CYLDQ9NQC7 956 aa23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 PI4K2BG5E9Z4 385 aa23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 ABHD2P08910 425 aa23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 UNGP13051 313 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 SP100P23497 879 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM196AQ6ZSG2 479 aa23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF333Q96JL9 665 aa23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 DCLRE1BQ9H816 532 aa23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 NVLO15381 856 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIFAP3Q92845 792 aa23.6■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 NT5C1BQ96P26 610 aa23.6■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 DNPEPQ9ULA0 475 aa23.6■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa23.6■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 TYROBPO43914 113 aa23.6■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 PEX3P56589 373 aa23.6■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 NOP14P78316 857 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 ABCB5Q2M3G0 1257 aa23.6■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 BBOF1Q8ND07 529 aa23.6■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM136AQ96C01 138 aa23.6■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIFC3Q9BVG8 833 aa23.6■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 COA1Q9GZY4 146 aa23.6■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 PI4KBQ9UBF8 816 aa23.6■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM198AQ9UFP1 575 aa23.6■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 C2CD2Q9Y426 696 aa23.6■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 KRT36O76013 467 aa23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 GH2P01242 217 aa23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 CFHP08603 1231 aa23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 KRT4P19013 534 aa23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 ADRA1DP25100 572 aa23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC6Q16204 474 aa23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC45A4Q5BKX6 768 aa23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZBED8Q8IZ13 594 aa23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 RNF217Q8TC41 542 aa23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 TEKT3Q9BXF9 490 aa23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 UMODL1Q5DID0 1318 aa23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 CFAP69A5D8W1 941 aa23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 POLR2MP0CAP2 368 aa23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 CRKP46108 304 aa23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 NR1H3Q13133 447 aa23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 RCN1Q15293 331 aa23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMEM179Q6ZVK1 233 aa23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 C12orf56Q8IXR9 622 aa23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 POMGNT1Q8WZA1 660 aa23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 WDR11Q9BZH6 1224 aa23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARL8BQ9NVJ2 186 aa23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 RAB20Q9NX57 234 aa23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 SIGLEC16A6NMB1 481 aa23.58■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 GOLGA8SH3BPF8 625 aa23.58■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 GOLGA8MH3BSY2 632 aa23.58■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 C2CD2LO14523 706 aa23.58■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 NPTXRO95502 500 aa23.58■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 SERPINB2P05120 415 aa23.58■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 SNX30Q5VWJ9 437 aa23.58■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 B3GNT9Q6UX72 402 aa23.58■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANKMY2Q8IV38 441 aa23.58■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 DTX3LQ8TDB6 740 aa23.58■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 TLE6Q9H808 572 aa23.58■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 ASB3Q9Y575 518 aa23.58■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF831Q5JPB2 1677 aa23.58■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 A0A0G2JND7 137 aa23.58■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 PIK3CAP42336 1068 aa23.58■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP23.58■■□□□ 1.373e-7■■■■■ 63
GRAMD1A-201ENST00000317991 HHIPL2Q6UWX4 724 aa23.58■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 MYPNQ86TC9 1320 aa23.58■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 PASD1Q8IV76 773 aa23.58■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 FBXL13Q8NEE6 735 aa23.58■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa23.58■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZHX2Q9Y6X8 837 aa23.58■■□□□ 1.37
GRAMD1A-201ENST00000317991 GOLGA8RI6L899 631 aa23.57■■□□□ 1.36
GRAMD1A-201ENST00000317991 PROSCO94903 275 aa23.57■■□□□ 1.36
GRAMD1A-201ENST00000317991 TCF4P15884 667 aa23.57■■□□□ 1.36
GRAMD1A-201ENST00000317991 ECE1P42892 770 aa23.57■■□□□ 1.36
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC1A1P43005 524 aa23.57■■□□□ 1.36
GRAMD1A-201ENST00000317991 GPC3P51654 580 aa23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.4 ms