RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 CDC42EP1Q00587 391 aa24.29■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 WDR72Q3MJ13 1102 aa24.29■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 C8orf74Q6P047 294 aa24.29■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 TRIB2Q92519 343 aa24.29■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 FUT8Q9BYC5 575 aa24.29■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 DARSP14868 501 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM132DQ14C87 1099 aa24.29■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM72Q6ZMU5 477 aa24.29■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 MON1BQ7L1V2 547 aa24.29■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM40Q8WWA1 233 aa24.29■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 ALG3Q92685 438 aa24.29■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 KRT12Q99456 494 aa24.29■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 AP1M1Q9BXS5 423 aa24.29■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 CXCL16Q9H2A7 254 aa24.29■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 FAM53CQ9NYF3 392 aa24.29■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 OGFRQ9NZT2 677 aa24.29■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 BRD2P25440 801 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 GRM5P41594 1212 aa24.28■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF667Q5HYK9 610 aa24.28■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 KRT35Q92764 455 aa24.28■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 ZSWIM1Q9BR11 485 aa24.28■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 KATNAL1Q9BW62 490 aa24.28■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 C17orf102A2RUQ5 167 aa24.27■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 KIF3CO14782 793 aa24.27■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 MCM3P25205 808 aa24.27■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 MARCKSL1P49006 195 aa24.27■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 CDH8P55286 799 aa24.27■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 RPS6KC1Q96S38 1066 aa24.27■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 C11orf70Q9BRQ4 267 aa24.27■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 FLT3LGP49771 235 aa24.27■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa24.27■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 SMC1BQ8NDV3 1235 aa24.27■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM7Q9C029 511 aa24.27■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 SDCBP2Q9H190 292 aa24.27■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa24.27■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 SNTG2Q9NY99 539 aa24.27■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 L1RE1Q9UN81 338 aa24.27■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 ATP8B1O43520 1251 aa24.26■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 MYBL1P10243 752 aa24.26■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 MYBL2P10244 700 aa24.26■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 CYBAP13498 195 aa24.26■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 CBX1P83916 185 aa24.26■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 SLC27A1Q6PCB7 646 aa24.26■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 KLHL7Q8IXQ5 586 aa24.26■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 C7orf31Q8N865 590 aa24.26■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM11Q96F44 468 aa24.26■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 BCO2Q9BYV7 579 aa24.26■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 CARD9Q9H257 536 aa24.26■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 ANAPC7Q9UJX3 599 aa24.26■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 HES2Q9Y543 173 aa24.26■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 TFAP2BQ92481 460 aa24.26■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 HHIPL1Q96JK4 782 aa24.26■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 SMYD3Q9H7B4 428 aa24.26■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 ADAM22Q9P0K1 906 aa24.26■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 STIM2Q9P246 746 aa24.26■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 AGAP1Q9UPQ3 857 aa24.26■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 C2CD2Q9Y426 696 aa24.26■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 CAP1Q01518 475 aa24.25■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM32Q13049 653 aa24.25■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 SNX17Q15036 470 aa24.25■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 NOTUMQ6P988 496 aa24.25■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa24.25■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 CD101Q93033 1021 aa24.25■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 KIF12Q96FN5 646 aa24.25■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 KRIT1O00522 736 aa24.25■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 FGGP02679 453 aa24.25■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 ITGA4P13612 1032 aa24.25■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 TNNC1P63316 161 aa24.25■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 PRKCZQ05513 592 aa24.25■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 PTP4A2Q12974 167 aa24.25■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 GNASQ5JWF2 1037 aa24.25■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 MFSD14CQ5VZR4 134 aa24.25■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 AADACL2Q6P093 401 aa24.25■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 DPP3Q9NY33 737 aa24.25■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 SPOPO43791 374 aa24.24■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 PGK1P00558 417 aa24.24■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 UBL4BQ8N7F7 174 aa24.24■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 HPDLQ96IR7 371 aa24.24■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 AOC2O75106 756 aa24.23■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 GLI1P08151 1106 aa24.23■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 HOXC8P31273 242 aa24.23■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 ATICP31939 592 aa24.23■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 PEX5P50542 639 aa24.23■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 GJA9P57773 515 aa24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms