RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295738.11

SLC23A3-201, Transcript of solute carrier family 23 member 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC23A3, Length 2,037 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A3-201ENST00000295738 ARFGAP3Q9NP61 516 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 ALDH1A1P00352 501 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 RAP1GAPP47736 663 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 NOMO3P69849 1222 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 WDR72Q3MJ13 1102 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 ACTRT1Q8TDG2 376 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 HINFPQ9BQA5 517 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 UVRAGQ9P2Y5 699 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 PGK1P00558 417 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 TUBBP07437 444 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 HOXC8P31273 242 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 GJA9P57773 515 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 SNX17Q15036 470 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 ZNF667Q5HYK9 610 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 DCAF12L1Q5VU92 463 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 SLC27A1Q6PCB7 646 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 TRIM72Q6ZMU5 477 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 ZSWIM1Q9BR11 485 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 SNTG2Q9NY99 539 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 COMTP21964 271 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 RRM1P23921 792 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 BRD2P25440 801 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 LLGL2Q6P1M3 1020 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 NOTUMQ6P988 496 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 MON1BQ7L1V2 547 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 CPNE8Q86YQ8 564 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 C2CD2Q9Y426 696 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 HES2Q9Y543 173 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 CDH8P55286 799 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 LONRF2Q1L5Z9 754 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 RASGEF1CQ8N431 466 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 ALG3Q92685 438 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 KIF12Q96FN5 646 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 BCO2Q9BYV7 579 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 SDCBP2Q9H190 292 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 DPP3Q9NY33 737 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 TMEM59LQ9UK28 342 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 DNAH12Q6ZR08 3092 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 SPDYE4A6NLX3 237 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 GNAT1P11488 350 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 SLC7A5Q01650 507 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 NOGQ13253 232 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 CCDC70Q6NSX1 233 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 CXCL17Q6UXB2 119 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 TFAP2BQ92481 460 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 RPS6KC1Q96S38 1066 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 C11orf70Q9BRQ4 267 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 SMYD3Q9H7B4 428 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 AGAP1Q9UPQ3 857 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 CITO14578 2027 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 MYBL1P10243 752 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 KRT35Q92764 455 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 TRIM11Q96F44 468 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 HPDLQ96IR7 371 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 ADAM22Q9P0K1 906 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 KPNA6O60684 536 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 ERLIN1O75477 346 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 ATICP31939 592 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 MARCKSL1P49006 195 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 C8orf74Q6P047 294 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 CD302Q8IX05 232 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 KRT12Q99456 494 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 AP1M1Q9BXS5 423 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 TRIM7Q9C029 511 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 ITGA11Q9UKX5 1188 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 SASH3O75995 380 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 PTP4A2Q12974 167 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 NBPF20Q3BBV1 942 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 NME8Q8N427 588 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 CD101Q93033 1021 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 SNX27Q96L92 541 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 CARD9Q9H257 536 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 VRTNQ9H8Y1 702 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 ANAPC7Q9UJX3 599 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 TRIP11Q15643 1979 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC23A3-201ENST00000295738 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms