RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262605.8

TTPAL-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-201ENST00000262605 RCCD1A6NED2 376 aa10.94□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 PGK1P00558 417 aa10.94□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 NCKAP1LP55160 1127 aa10.94□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 CDH8P55286 799 aa10.94□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 CISHQ9NSE2 258 aa10.94□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 UVRAGQ9P2Y5 699 aa10.94□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 YY1P25490 414 aa10.94□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 SULT1E1P49888 294 aa10.94□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 CHADLQ6NUI6 762 aa10.94□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 WHAMMQ8TF30 809 aa10.94□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 FAF2Q96CS3 445 aa10.94□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 SAYSD1Q9NPB0 183 aa10.94□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 GRIK1P39086 918 aa10.94□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa10.94□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 RNF180Q86T96 592 aa10.94□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 PNKPQ96T60 521 aa10.94□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 HES2Q9Y543 173 aa10.94□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 GJB6O95452 261 aa10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 PDGFRAP16234 1089 aa10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 RGMBQ6NW40 437 aa10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 GPR20Q99678 358 aa10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 AIPL1Q9NZN9 384 aa10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP10.93□□□□□ -0.667e-10■■■■□ 24.2
TTPAL-201ENST00000262605 MAFO75444 373 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 SLC4A1P02730 911 aa10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 PSEN2P49810 448 aa10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 SARNPP82979 210 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 FSTL1Q12841 308 aa10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 P3H4Q92791 437 aa10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 LTBP3Q9NS15 1303 aa10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 STX2P32856 288 aa10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 KCNJ1P48048 391 aa10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 GPS1Q13098 491 aa10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 GANQ9H2C0 597 aa10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 ZBBXA8MT70 800 aa10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 CPB1P15086 417 aa10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 RBPJLQ9UBG7 517 aa10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 PPFIA4O75335 1185 aa10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 CD4P01730 458 aa10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 KRT14P02533 472 aa10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 RRM1P23921 792 aa10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 TNIP3Q96KP6 325 aa10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 SIK2Q9H0K1 926 aa10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 IFT122Q9HBG6 1241 aa10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 NDC80O14777 642 aa10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 GBP1P32455 592 aa10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 PBX1P40424 430 aa10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 OR1G1P47890 313 aa10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 MXRA7P84157 204 aa10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 SP2Q02086 613 aa10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 SPIRE1Q08AE8 756 aa10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 MEA1Q16626 185 aa10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 CXCL17Q6UXB2 119 aa10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 USP38Q8NB14 1042 aa10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 ARHGEF26Q96DR7 871 aa10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 ZBED2Q9BTP6 218 aa10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 TXNRD2Q9NNW7 524 aa10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 HOMER3Q9NSC5 361 aa10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 CASTOR2A6NHX0 329 aa10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 CHRNA3P32297 505 aa10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 MTM1Q13496 603 aa10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 PSMD6Q15008 389 aa10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 SV2CQ496J9 727 aa10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 MTHFD1LQ6UB35 978 aa10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 BAP1Q92560 729 aa10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 MAST2Q6P0Q8 1798 aa10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 ACKR2O00590 384 aa10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 PODXLO00592 558 aa10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 SART1O43290 800 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 CPP00450 1065 aa10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 MYBPC2Q14324 1141 aa10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 EMBQ6PCB8 327 aa10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 CCDC33Q8N5R6 958 aa10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 FEZF2Q8TBJ5 459 aa10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 RNPEPQ9H4A4 650 aa10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 ATP8B1O43520 1251 aa10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF862O60290 1169 aa10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 SRGAP2BP0DMP2 458 aa10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 ARL13BQ3SXY8 428 aa10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-201ENST00000262605 KCNT1Q5JUK3 1230 aa10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms