RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 JchainP01592 159 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rhox3aQ4TU90 215 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Foxn1Q61575 648 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Jade1Q6ZPI0 834 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hsdl1Q8BTX9 330 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ttc16Q8C1F5 767 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dennd2aQ8C4S8 1000 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Leg1Q8C6C9 337 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cabcoco1Q8CDT7 208 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Acvr1cQ8K348 493 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cox18Q8VC74 331 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cep83Q9D5R3 692 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 EloblA6PWE0 161 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atp9aO70228 1047 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 EpoP07321 192 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Eno1P17182 434 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Smad1P70340 465 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klra5Q60652 266 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nlrp4eQ66X19 978 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slain1Q68FF7 579 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem130Q6NXM3 419 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nav1Q8CH77 1875 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Usp26Q99MX1 835 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm9774A0A0A6YVU8 407 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Serpinb3cA2RSF9 386 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm3460E9QAI8 215 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmigd3G3X8R9 209 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Abi2P62484 446 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Serpina5P70458 405 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arl14Q3SXC5 192 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lrrc55Q3UY51 311 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klra6Q60653 266 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tgoln2Q62314 363 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mindy1Q76LS9 468 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Plppr4Q7TME0 766 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Clasp2Q8BRT1 1286 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam118bQ8C569 351 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NemfQ8CCP0 1064 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r203Q8R273 311 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Me2Q99KE1 589 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam111aQ9D2L9 613 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tbx20Q9ES03 445 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tll2Q9WVM6 1012 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cep85lA0A1W2P884 806 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cav1P49817 178 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdca2Q14B71 982 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmtc1Q3UV71 942 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MtbpQ8BJS8 894 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cog4Q8R1U1 785 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr393Q8VGR6 312 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Csde1Q91W50 798 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q9D1F3 157 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stx12Q9ER00 274 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rab27aQ9ERI2 221 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Maged1Q9QYH6 775 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc194A0A140LIT1 234 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gap43P06837 227 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rnpc3Q3UZ01 514 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp512bQ6PHP4 879 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ssxb10Q6XAR7 170 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TwistnbQ78WZ7 330 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Igdcc3Q8BQC3 813 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rint1Q8BZ36 792 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Celf3Q8CIN6 465 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mtss1Q8R1S4 759 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fbxw7Q8VBV4 629 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Agap3Q8VHH5 910 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tjap1Q9DCD5 539 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sfmbt1Q9JMD1 863 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm28036V9GXJ1 658 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Osbpl9A2A8Z1 736 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm2237E9Q501 211 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm3591K7N6X2 186 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Itgb3O54890 787 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Msx3P70354 204 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mical2Q8BML1 960 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc8a2Q8K596 921 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Eef1akmt2Q9D853 244 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trpc7Q9WVC5 862 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cntnap5cQ0V8T7 1305 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ttc17E9PVB5 1198 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PpargP37238 505 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vps4bP46467 444 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Micall2Q3TN34 1009 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q3UK37 420 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Serpinb1cQ5SV42 375 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ankrd24Q80VM7 985 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prr33Q8C494 260 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tlr9Q9EQU3 1032 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc22a3Q9WTW5 551 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atp6v0a1Q9Z1G4 839 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Crlf3Q9Z2L7 442 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NalcnQ8BXR5 1738 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ric1Q69ZJ7 1422 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wnt7aP24383 349 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdc25cP48967 447 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyfip2Q5SQX6 1253 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kcnj11Q61743 390 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ptger2Q62053 362 aa13.48□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 GmipQ6PGG2 971 aa13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 48.7 ms