RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000004097.15

Cux1-201, Transcript of Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cux1, Length 12,862 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1-201ENSMUST00000004097 Hcls1P49710 486 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Llgl1Q80Y17 1036 aa8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 TbcbQ9D1E6 244 aa8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Usp29Q9ES63 869 aa8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ubxn8Q9QZ49 277 aa8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 SftpdP50404 374 aa8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Far2Q7TNT2 515 aa8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 BroxQ8K2Q7 411 aa8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ndufs3Q9DCT2 263 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gpatch8A2A6A1 1505 aa8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Nxpe3B9EKK6 559 aa8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gm8267E9Q207 261 aa8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Kcnk16G5E845 292 aa8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Pla2g4cQ64GA5 597 aa8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Zfp418Q8BFS8 652 aa8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 BfarQ8R079 450 aa8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Cep72Q9D3R3 646 aa8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Iqcf1Q9D9K8 182 aa8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Asap1Q9QWY8 1147 aa8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 PcnaP17918 261 aa8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Trit1Q80UN9 467 aa8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Atpaf2Q91YY4 289 aa8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Foxp4Q9DBY0 795 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Pld1Q9Z280 1074 aa8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Krt78E9Q0F0 1068 aa8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Tcea3P23881 347 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gmeb2P58929 530 aa8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Arhgap17Q3UIA2 846 aa8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 FaxcQ3UMF9 409 aa8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Dyrk4Q8BI55 632 aa8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Nmrk1Q91W63 195 aa8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Aox2Q5SGK3 1345 aa8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Col17a1Q07563 1470 aa8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Il1rapl1P59823 695 aa8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Sgo2Q7TSY8 1164 aa8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Susd6Q8BGE4 302 aa8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Catsper1Q91ZR5 686 aa8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Slfn1Q9Z0I7 337 aa8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Irs2P81122 1321 aa8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Coq8aQ60936 645 aa8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Snx5Q9D8U8 404 aa8.6□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gm36028A0A0U1RPM1 299 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Tmem199Q5SYH2 208 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Wdr91Q7TMQ7 748 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Scara3Q8C850 606 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 ScaiQ8C8N2 606 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Snx8Q8CFD4 459 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Hist1h2aaQ8CGP4 129 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Cpa5Q8R4H4 436 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr694K7N641 315 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Aoc3O70423 765 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Dab2P98078 766 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Kcnb1Q03717 857 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Rbbp4Q60972 425 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 PmpcbQ9CXT8 489 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Cnot8Q9D8X5 292 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Frmpd1A2AKB4 1549 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Itpripl1A2ASA8 547 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gm14496K7N5U4 849 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Tp53P02340 387 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Zfp454Q80Y34 536 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Znf618Q80YY7 953 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 SpidrQ8BGX7 933 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 RbakQ8BQC8 711 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ccdc152E9PX14 254 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Lig3P97386 1015 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ccna1Q61456 421 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Usp8Q80U87 1080 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Arl8aQ8VEH3 186 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Casp8O89110 480 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Klra3Q64329 266 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Impg2Q80XH2 1243 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Acad11Q80XL6 779 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 BspryQ80YW5 473 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Pnma1Q8C1C8 353 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Nt5dc1Q8C5P5 467 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Aipl1Q924K1 328 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Taf1dQ9D4V4 322 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Pramef6A2A8M8 474 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Fam209A2APA5 170 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Atl2Q6PA06 583 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr301Q7TS04 311 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Wdr26Q8C6G8 641 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Wfs1P56695 890 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Nucb1Q02819 459 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Rasip1Q3U0S6 961 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Myo19Q5SV80 963 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gemin8Q8BHE1 238 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Neto2Q8BNJ6 525 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Taf2Q8C176 1104 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Afg3l2Q8JZQ2 802 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Far1Q922J9 515 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Mrps22Q9CXW2 359 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ccr4P51680 360 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Usp13Q5BKP2 858 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Asz1Q8VD46 475 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Cyp2c70Q91W64 489 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Rgs4O08899 205 aa8.59□□□□□ -1.03
Cux1-201ENSMUST00000004097 Cd3dP04235 173 aa8.59□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.9 ms