RNA–Protein interactions for RNA: YAL032C

PRP45, Transcript of Protein required for pre-mRNA splicing, yeastyeast

Gene PRP45, Length 1,140 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP45YAL032C PRP40P33203 583 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PRP45YAL032C BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data6.77□□□□□ -1.33not detected
PRP45YAL032C PAP2P53632 584 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PRP45YAL032C HAP5Q02516 242 aa6.77□□□□□ -1.33
PRP45YAL032C FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PRP45YAL032C YEF3P16521 1044 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PRP45YAL032C VRP1P37370 817 aa6.76□□□□□ -1.33
PRP45YAL032C NMA111P53920 997 aa6.76□□□□□ -1.33
PRP45YAL032C DMA2P53924 522 aa6.76□□□□□ -1.33
PRP45YAL032C CDC73Q06697 393 aa6.76□□□□□ -1.33
PRP45YAL032C SIR4P11978 1358 aa6.75□□□□□ -1.33
PRP45YAL032C TRK1P12685 1235 aa6.75□□□□□ -1.33
PRP45YAL032C RAD54P32863 898 aa6.75□□□□□ -1.33
PRP45YAL032C NPR2P39923 615 aa6.75□□□□□ -1.33
PRP45YAL032C YNR021WP53723 404 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PRP45YAL032C ADE16P54113 591 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PRP45YAL032C MEC3Q02574 474 aa6.75□□□□□ -1.33
PRP45YAL032C DPL1Q05567 589 aa6.75□□□□□ -1.33
PRP45YAL032C RPO41P13433 1351 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PRP45YAL032C YKR075CP36155 307 aa6.74□□□□□ -1.33
PRP45YAL032C LYS4P49367 693 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PRP45YAL032C MAM3Q12296 706 aa6.74□□□□□ -1.33
PRP45YAL032C SNF2P22082 1703 aa6.73□□□□□ -1.33
PRP45YAL032C SPT23P35210 1082 aa6.73□□□□□ -1.33
PRP45YAL032C YBL086CP38177 466 aa6.73□□□□□ -1.33
PRP45YAL032C YDR090CQ03193 310 aa6.73□□□□□ -1.33
PRP45YAL032C ATG13Q06628 738 aa6.73□□□□□ -1.33
PRP45YAL032C EDE1P34216 1381 aa6.72□□□□□ -1.33
PRP45YAL032C NOP2P40991 618 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PRP45YAL032C MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PRP45YAL032C HSP104P31539 908 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PRP45YAL032C KIC1P38692 1080 aa6.7□□□□□ -1.34
PRP45YAL032C NUP42P49686 430 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PRP45YAL032C DSD1P53095 428 aa6.7□□□□□ -1.34
PRP45YAL032C COX6P00427 148 aa6.69□□□□□ -1.34
PRP45YAL032C AKL1P38080 1108 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PRP45YAL032C PTC2P39966 464 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PRP45YAL032C BNI4P53858 892 aa6.69□□□□□ -1.34
PRP45YAL032C INP54Q08227 384 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PRP45YAL032C RIM15P43565 1770 aa6.69□□□□□ -1.34
PRP45YAL032C SSA2P10592 639 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PRP45YAL032C KIN1P13185 1064 aa6.68□□□□□ -1.34
PRP45YAL032C OSM1P21375 501 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PRP45YAL032C DIT2P21595 489 aa6.68□□□□□ -1.34
PRP45YAL032C UGA2P38067 497 aa6.68□□□□□ -1.34
PRP45YAL032C ALD2P47771 506 aa6.68□□□□□ -1.34
PRP45YAL032C AIM7Q12156 149 aa6.68□□□□□ -1.34
PRP45YAL032C ISU2Q12056 156 aa6.67□□□□□ -1.34
PRP45YAL032C GLC3P32775 704 aa6.66□□□□□ -1.34
PRP45YAL032C CTH1P47976 325 aa6.66□□□□□ -1.34
PRP45YAL032C YBP2P53169 641 aa6.66□□□□□ -1.34
PRP45YAL032C RRP46P53256 223 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PRP45YAL032C NUP145P49687 1317 aa6.66□□□□□ -1.34
PRP45YAL032C RTR1P40084 226 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PRP45YAL032C AOS1Q06624 347 aa6.65□□□□□ -1.34
PRP45YAL032C GRX1P25373 110 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PRP45YAL032C PDR1P12383 1068 aa6.63□□□□□ -1.35
PRP45YAL032C XDJ1P39102 459 aa6.63□□□□□ -1.35
PRP45YAL032C CTF4Q01454 927 aa6.63□□□□□ -1.35
PRP45YAL032C YML082WQ04533 649 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PRP45YAL032C ALE1Q08548 619 aa6.63□□□□□ -1.35
PRP45YAL032C BUG1Q12191 341 aa6.63□□□□□ -1.35
PRP45YAL032C KCC4P25389 1037 aa6.62□□□□□ -1.35
PRP45YAL032C PRS1P32895 427 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PRP45YAL032C NTH2P35172 780 aa6.62□□□□□ -1.35
PRP45YAL032C YPR015CQ12531 247 aa6.62□□□□□ -1.35
PRP45YAL032C RPP1BP10622 106 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PRP45YAL032C ALD3P54114 506 aa6.61□□□□□ -1.35
PRP45YAL032C RMT2Q03305 412 aa6.61□□□□□ -1.35
PRP45YAL032C TUM1Q08686 304 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PRP45YAL032C RAD4P14736 754 aa6.6□□□□□ -1.35
PRP45YAL032C MPP10P47083 593 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PRP45YAL032C PEX21P50091 288 aa6.6□□□□□ -1.35
PRP45YAL032C RAM1P22007 431 aa6.59□□□□□ -1.35
PRP45YAL032C PRD1P25375 712 aa6.59□□□□□ -1.35
PRP45YAL032C BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data6.59□□□□□ -1.35not detected
PRP45YAL032C HPC2Q01448 625 aa6.59□□□□□ -1.35
PRP45YAL032C IOC4Q04213 475 aa6.59□□□□□ -1.35
PRP45YAL032C YBR287WP38355 427 aa6.58□□□□□ -1.36
PRP45YAL032C YDL144CQ07589 356 aa6.58□□□□□ -1.36
PRP45YAL032C YRR1Q12172 810 aa6.58□□□□□ -1.36
PRP45YAL032C RPP0P05317 312 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PRP45YAL032C UGA3P26370 528 aa6.57□□□□□ -1.36
PRP45YAL032C ORC6P38826 435 aa6.57□□□□□ -1.36
PRP45YAL032C TEA1P47988 759 aa6.57□□□□□ -1.36
PRP45YAL032C YNL050CP53952 270 aa6.57□□□□□ -1.36
PRP45YAL032C NSE3Q05541 303 aa6.57□□□□□ -1.36
PRP45YAL032C THI22Q06490 572 aa6.57□□□□□ -1.36
PRP45YAL032C ZDS1P50111 915 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PRP45YAL032C UTP22P53254 1237 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PRP45YAL032C ATF2P53296 535 aa6.56□□□□□ -1.36
PRP45YAL032C RTT109Q07794 436 aa6.56□□□□□ -1.36
PRP45YAL032C RIX7Q07844 837 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PRP45YAL032C CTI6Q08923 506 aa6.56□□□□□ -1.36
PRP45YAL032C GAP1P19145 602 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PRP45YAL032C TPD3P31383 635 aa6.55□□□□□ -1.36
PRP45YAL032C SER1P33330 395 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PRP45YAL032C RRT14P40470 206 aa6.55□□□□□ -1.36
PRP45YAL032C RLF2Q12495 606 aa6.55□□□□□ -1.36
PRP45YAL032C COQ4O13525 335 aa6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 44.7 ms