RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636169.1

EFHC1-215, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

Gene EFHC1, Length 4,308 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-215	ENST00000636169	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		6.31	□□□□□ -1.4
EFHC1-215	ENST00000636169	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	6.31	□□□□□ -1.4
EFHC1-215	ENST00000636169	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		6.31	□□□□□ -1.4
EFHC1-215	ENST00000636169	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
EFHC1-215	ENST00000636169	CCDC7	Q96M83	1385 aa		6.31	□□□□□ -1.4
EFHC1-215	ENST00000636169	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
EFHC1-215	ENST00000636169	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		6.31	□□□□□ -1.4
EFHC1-215	ENST00000636169	FKBP8	Q14318	412 aa		6.3	□□□□□ -1.4
EFHC1-215	ENST00000636169	RALBP1	Q15311	655 aa		6.3	□□□□□ -1.4
EFHC1-215	ENST00000636169	ADGRL2	O95490	1459 aa		6.3	□□□□□ -1.4
EFHC1-215	ENST00000636169	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		6.3	□□□□□ -1.4
EFHC1-215	ENST00000636169	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		6.3	□□□□□ -1.4
EFHC1-215	ENST00000636169	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		6.3	□□□□□ -1.4
EFHC1-215	ENST00000636169	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		6.3	□□□□□ -1.4
EFHC1-215	ENST00000636169	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
EFHC1-215	ENST00000636169	SHROOM2	Q13796	1616 aa		6.3	□□□□□ -1.4
EFHC1-215	ENST00000636169	ATP10A	O60312	1499 aa		6.29	□□□□□ -1.4
EFHC1-215	ENST00000636169	PREX2	Q70Z35	1606 aa		6.29	□□□□□ -1.4
EFHC1-215	ENST00000636169	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
EFHC1-215	ENST00000636169	NOS1	P29475	1434 aa		6.29	□□□□□ -1.4
EFHC1-215	ENST00000636169	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		6.29	□□□□□ -1.4
EFHC1-215	ENST00000636169	PZP	P20742	1482 aa		6.29	□□□□□ -1.4
EFHC1-215	ENST00000636169	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
EFHC1-215	ENST00000636169	TNR	Q92752	1358 aa		6.29	□□□□□ -1.4
EFHC1-215	ENST00000636169	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		6.29	□□□□□ -1.4
EFHC1-215	ENST00000636169	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
EFHC1-215	ENST00000636169	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
EFHC1-215	ENST00000636169	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	6.29	□□□□□ -1.4
EFHC1-215	ENST00000636169	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
EFHC1-215	ENST00000636169	ABCC1	P33527	1531 aa		6.28	□□□□□ -1.4
EFHC1-215	ENST00000636169	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		6.28	□□□□□ -1.4
EFHC1-215	ENST00000636169	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		6.28	□□□□□ -1.4
EFHC1-215	ENST00000636169	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		6.28	□□□□□ -1.4
EFHC1-215	ENST00000636169	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
EFHC1-215	ENST00000636169	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		6.28	□□□□□ -1.4
EFHC1-215	ENST00000636169	ZMYM3	Q14202	1370 aa		6.28	□□□□□ -1.4
EFHC1-215	ENST00000636169	NLRP13	Q86W25	1043 aa		6.28	□□□□□ -1.4
EFHC1-215	ENST00000636169	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		6.27	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		6.27	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		6.27	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	CDK19	Q9BWU1	502 aa		6.27	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		6.27	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	ATF3	P18847	181 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	PSME1	Q06323	249 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	AMPH	P49418	695 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	COG3	Q96JB2	828 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	MYT1	Q01538	1121 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	CABP1	Q9NZU7	370 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	HSPA2	P54652	639 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	NLRP6	P59044	892 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	NPAT	Q14207	1427 aa		6.22	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		6.22	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		6.22	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		6.21	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		6.21	□□□□□ -1.41
EFHC1-215	ENST00000636169	ABTB2	Q8N961	1025 aa		6.21	□□□□□ -1.42
EFHC1-215	ENST00000636169	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
EFHC1-215	ENST00000636169	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
EFHC1-215	ENST00000636169	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		6.21	□□□□□ -1.42
EFHC1-215	ENST00000636169	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
EFHC1-215	ENST00000636169	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		6.21	□□□□□ -1.42
EFHC1-215	ENST00000636169	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
EFHC1-215	ENST00000636169	MTHFS	P49914	203 aa		6.21	□□□□□ -1.42
EFHC1-215	ENST00000636169	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		6.21	□□□□□ -1.42
EFHC1-215	ENST00000636169	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		6.2	□□□□□ -1.42
EFHC1-215	ENST00000636169	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		6.2	□□□□□ -1.42
EFHC1-215	ENST00000636169	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		6.2	□□□□□ -1.42
EFHC1-215	ENST00000636169	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		6.2	□□□□□ -1.42
EFHC1-215	ENST00000636169	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
EFHC1-215	ENST00000636169	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		6.19	□□□□□ -1.42
EFHC1-215	ENST00000636169	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		6.19	□□□□□ -1.42
EFHC1-215	ENST00000636169	CCDC184	Q52MB2	194 aa		6.19	□□□□□ -1.42
EFHC1-215	ENST00000636169	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
EFHC1-215	ENST00000636169	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		6.19	□□□□□ -1.42

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