RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619939.4

LHX1-204, Transcript of LIM homeobox 1, humanhuman

TSL 2

Gene LHX1, Length 1,840 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1-204ENST00000619939 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
LHX1-204ENST00000619939 IQGAP1P46940 1657 aa21.69■■□□□ 1.06
LHX1-204ENST00000619939 EID1Q9Y6B2 187 aa21.68■■□□□ 1.06
LHX1-204ENST00000619939 UBR1Q8IWV7 1749 aa21.65■■□□□ 1.06
LHX1-204ENST00000619939 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
LHX1-204ENST00000619939 CLTCL1P53675 1640 aa21.65■■□□□ 1.06
LHX1-204ENST00000619939 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.64■■□□□ 1.06
LHX1-204ENST00000619939 SLIT1O75093 1534 aa21.64■■□□□ 1.05
LHX1-204ENST00000619939 ARHGAP23Q9P227 1491 aa21.64■■□□□ 1.05
LHX1-204ENST00000619939 RGL3Q3MIN7 710 aa21.63■■□□□ 1.05
LHX1-204ENST00000619939 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.63■■□□□ 1.05
LHX1-204ENST00000619939 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
LHX1-204ENST00000619939 SOCS7O14512 581 aa21.62■■□□□ 1.05
LHX1-204ENST00000619939 NOS1P29475 1434 aa21.61■■□□□ 1.05
LHX1-204ENST00000619939 PIP4K2BP78356 416 aa21.61■■□□□ 1.05
LHX1-204ENST00000619939 ILDR2Q71H61 639 aa21.6■■□□□ 1.05
LHX1-204ENST00000619939 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
LHX1-204ENST00000619939 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.59■■□□□ 1.05
LHX1-204ENST00000619939 SLC52A1Q9NWF4 448 aa21.59■■□□□ 1.05
LHX1-204ENST00000619939 TMEM2Q9UHN6 1383 aa21.59■■□□□ 1.05
LHX1-204ENST00000619939 KIF1BO60333 1816 aa21.58■■□□□ 1.05
LHX1-204ENST00000619939 SYNMO15061 1565 aa21.58■■□□□ 1.05
LHX1-204ENST00000619939 LTKP29376 864 aa21.58■■□□□ 1.05
LHX1-204ENST00000619939 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.57■■□□□ 1.04
LHX1-204ENST00000619939 HSPA1LP34931 641 aa21.57■■□□□ 1.04
LHX1-204ENST00000619939 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.57■■□□□ 1.04
LHX1-204ENST00000619939 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.57■■□□□ 1.04
LHX1-204ENST00000619939 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
LHX1-204ENST00000619939 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
LHX1-204ENST00000619939 IDI1Q13907 227 aa21.55■■□□□ 1.04
LHX1-204ENST00000619939 PIK3C2BO00750 1634 aa21.54■■□□□ 1.04
LHX1-204ENST00000619939 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.53■■□□□ 1.04
LHX1-204ENST00000619939 HDGFP51858 240 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
LHX1-204ENST00000619939 STRCP1A6NGW2 1772 aa21.5■■□□□ 1.03
LHX1-204ENST00000619939 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
LHX1-204ENST00000619939 ADGRB3O60242 1522 aa21.48■■□□□ 1.03
LHX1-204ENST00000619939 KCNA6P17658 529 aa21.47■■□□□ 1.03
LHX1-204ENST00000619939 STAC3Q96MF2 364 aa21.47■■□□□ 1.03
LHX1-204ENST00000619939 ALKQ9UM73 1620 aa21.45■■□□□ 1.03
LHX1-204ENST00000619939 PRAG1Q86YV5 1406 aa21.44■■□□□ 1.02
LHX1-204ENST00000619939 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
LHX1-204ENST00000619939 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa21.41■■□□□ 1.02
LHX1-204ENST00000619939 RALGAPBQ86X10 1494 aa21.41■■□□□ 1.02
LHX1-204ENST00000619939 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
LHX1-204ENST00000619939 IFT172Q9UG01 1749 aa21.4■■□□□ 1.02
LHX1-204ENST00000619939 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa21.39■■□□□ 1.02
LHX1-204ENST00000619939 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
LHX1-204ENST00000619939 BCANQ96GW7 911 aa21.39■■□□□ 1.02
LHX1-204ENST00000619939 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.39■■□□□ 1.01
LHX1-204ENST00000619939 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.38■■□□□ 1.01
LHX1-204ENST00000619939 MYOM2P54296 1465 aa21.38■■□□□ 1.01
LHX1-204ENST00000619939 MYO5BQ9ULV0 1848 aa21.38■■□□□ 1.01
LHX1-204ENST00000619939 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
LHX1-204ENST00000619939 PPLO60437 1756 aa21.37■■□□□ 1.01
LHX1-204ENST00000619939 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa21.37■■□□□ 1.01
LHX1-204ENST00000619939 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
LHX1-204ENST00000619939 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa21.37■■□□□ 1.01
LHX1-204ENST00000619939 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
LHX1-204ENST00000619939 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
LHX1-204ENST00000619939 TMEM94Q12767 1356 aa21.37■■□□□ 1.01
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LHX1-204ENST00000619939 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
LHX1-204ENST00000619939 ZFYVE9O95405 1425 aa21.35■■□□□ 1.01
LHX1-204ENST00000619939 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa21.34■■□□□ 1.01
LHX1-204ENST00000619939 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
LHX1-204ENST00000619939 TBX22Q9Y458 520 aa21.34■■□□□ 1.01
LHX1-204ENST00000619939 RIMS2Q9UQ26 1411 aa21.34■■□□□ 1.01
LHX1-204ENST00000619939 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
LHX1-204ENST00000619939 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa21.33■■□□□ 1.01
LHX1-204ENST00000619939 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
LHX1-204ENST00000619939 NWD1Q149M9 1564 aa21.32■■□□□ 1
LHX1-204ENST00000619939 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.32■■□□□ 1
LHX1-204ENST00000619939 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
LHX1-204ENST00000619939 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa21.31■■□□□ 1
LHX1-204ENST00000619939 MSH6P52701 1360 aa21.31■■□□□ 1
LHX1-204ENST00000619939 USP47Q96K76 1375 aa21.29■■□□□ 1
LHX1-204ENST00000619939 NRXN1Q9ULB1 1477 aa21.29■■□□□ 1
LHX1-204ENST00000619939 PIK3R4Q99570 1358 aa21.29■■□□□ 1
LHX1-204ENST00000619939 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa21.27■■□□□ 1
LHX1-204ENST00000619939 GPRASP1Q5JY77 1395 aa21.27■■□□□ 1
LHX1-204ENST00000619939 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.26■□□□□ 0.99
LHX1-204ENST00000619939 PIK3C2GO75747 1445 aa21.26■□□□□ 0.99
LHX1-204ENST00000619939 LAMC1P11047 1609 aa21.25■□□□□ 0.99
LHX1-204ENST00000619939 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
LHX1-204ENST00000619939 DIP2AQ14689 1571 aa21.25■□□□□ 0.99
LHX1-204ENST00000619939 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
LHX1-204ENST00000619939 SLAIN2Q9P270 581 aa21.24■□□□□ 0.99
LHX1-204ENST00000619939 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
LHX1-204ENST00000619939 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
LHX1-204ENST00000619939 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa21.19■□□□□ 0.98
LHX1-204ENST00000619939 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa21.19■□□□□ 0.98
LHX1-204ENST00000619939 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.18■□□□□ 0.98
LHX1-204ENST00000619939 CADPS2Q86UW7 1296 aa21.18■□□□□ 0.98
LHX1-204ENST00000619939 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
LHX1-204ENST00000619939 C19orf44Q9H6X5 657 aa21.18■□□□□ 0.98
LHX1-204ENST00000619939 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa21.17■□□□□ 0.98
LHX1-204ENST00000619939 C14orf37Q86TY3 774 aa21.17■□□□□ 0.98
LHX1-204ENST00000619939 ATF3P18847 181 aa21.15■□□□□ 0.98
LHX1-204ENST00000619939 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
LHX1-204ENST00000619939 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.13■□□□□ 0.97
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