RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617444.4

SLC35E2B-205, Transcript of solute carrier family 35 member E2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC35E2B, Length 6,283 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E2B-205ENST00000617444 TEX35Q5T0J7 233 aa16.65■□□□□ 0.26
SLC35E2B-205ENST00000617444 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
SLC35E2B-205ENST00000617444 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
SLC35E2B-205ENST00000617444 PDE4AP27815 886 aa16.65■□□□□ 0.26
SLC35E2B-205ENST00000617444 PSME1Q06323 249 aa16.65■□□□□ 0.26
SLC35E2B-205ENST00000617444 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
SLC35E2B-205ENST00000617444 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa16.65■□□□□ 0.26
SLC35E2B-205ENST00000617444 CALRP27797 417 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
SLC35E2B-205ENST00000617444 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
SLC35E2B-205ENST00000617444 SLC4A3P48751 1232 aa16.64■□□□□ 0.25
SLC35E2B-205ENST00000617444 HOMER1Q86YM7 354 aa16.63■□□□□ 0.25
SLC35E2B-205ENST00000617444 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
SLC35E2B-205ENST00000617444 RUFY2Q8WXA3 655 aa16.63■□□□□ 0.25
SLC35E2B-205ENST00000617444 FYB1O15117 783 aa16.62■□□□□ 0.25
SLC35E2B-205ENST00000617444 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
SLC35E2B-205ENST00000617444 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
SLC35E2B-205ENST00000617444 CYB5RLQ6IPT4 315 aa16.61■□□□□ 0.25
SLC35E2B-205ENST00000617444 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa16.61■□□□□ 0.25
SLC35E2B-205ENST00000617444 REC8O95072 547 aa16.61■□□□□ 0.25
SLC35E2B-205ENST00000617444 NFXL1Q6ZNB6 911 aa16.61■□□□□ 0.25
SLC35E2B-205ENST00000617444 CPLX1O14810 134 aa16.6■□□□□ 0.25
SLC35E2B-205ENST00000617444 BCL2L13Q9BXK5 485 aa16.6■□□□□ 0.25
SLC35E2B-205ENST00000617444 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
SLC35E2B-205ENST00000617444 BICD2Q8TD16 824 aa16.59■□□□□ 0.25
SLC35E2B-205ENST00000617444 FAM13BQ9NYF5 915 aa16.59■□□□□ 0.25
SLC35E2B-205ENST00000617444 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
SLC35E2B-205ENST00000617444 CDR1P51861 262 aa16.59■□□□□ 0.25
SLC35E2B-205ENST00000617444 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa16.59■□□□□ 0.25
SLC35E2B-205ENST00000617444 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
SLC35E2B-205ENST00000617444 L3MBTL2Q969R5 705 aa16.58■□□□□ 0.25
SLC35E2B-205ENST00000617444 ERICH2A1L162 156 aa16.58■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 MTMR7Q9Y216 660 aa16.58■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 CGNL1Q0VF96 1302 aa16.57■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 CCDC27Q2M243 656 aa16.57■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 ATF3P18847 181 aa16.57■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 ANO2Q9NQ90 1003 aa16.57■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 RUFY1Q96T51 708 aa16.57■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 E9PSI1 815 aa16.56■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 IKQ13123 557 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 TMEM132AQ24JP5 1023 aa16.56■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 TRDNQ13061 729 aa16.56■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 KIF15Q9NS87 1388 aa16.56■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 FOSBP53539 338 aa16.55■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 ODF2Q5BJF6 829 aa16.55■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 PAF1Q8N7H5 531 aa16.55■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 ACBD3Q9H3P7 528 aa16.55■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 CHMP5Q9NZZ3 219 aa16.55■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 PLIN1O60240 522 aa16.54■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 COG6Q9Y2V7 657 aa16.54■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 AK7Q96M32 723 aa16.54■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 DDX58O95786 925 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 RNF20Q5VTR2 975 aa16.54■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 FMN1Q68DA7 1419 aa16.53■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 MNS1Q8NEH6 495 aa16.53■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 EXOC6Q8TAG9 804 aa16.53■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 VPS8Q8N3P4 1428 aa16.53■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 SASS6Q6UVJ0 657 aa16.53■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 PDS5BQ9NTI5 1447 aa16.52■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 RRP1P56182 461 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 HSP90B2PQ58FF3 399 aa16.52■□□□□ 0.23
SLC35E2B-205ENST00000617444 CRBNQ96SW2 442 aa16.52■□□□□ 0.23
SLC35E2B-205ENST00000617444 SOGA1O94964 1423 aa16.52■□□□□ 0.23
SLC35E2B-205ENST00000617444 FAM177BA6PVY3 158 aa16.52■□□□□ 0.23
SLC35E2B-205ENST00000617444 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
SLC35E2B-205ENST00000617444 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa16.51■□□□□ 0.23
SLC35E2B-205ENST00000617444 FAM43AQ8N2R8 423 aa16.51■□□□□ 0.23
SLC35E2B-205ENST00000617444 DDX19BQ9UMR2 479 aa16.51■□□□□ 0.23
SLC35E2B-205ENST00000617444 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
SLC35E2B-205ENST00000617444 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
SLC35E2B-205ENST00000617444 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP16.51■□□□□ 0.23
SLC35E2B-205ENST00000617444 EVC2Q86UK5 1308 aa16.5■□□□□ 0.23
SLC35E2B-205ENST00000617444 PANK3Q9H999 370 aa16.5■□□□□ 0.23
SLC35E2B-205ENST00000617444 IFT57Q9NWB7 429 aa16.5■□□□□ 0.23
SLC35E2B-205ENST00000617444 WWC2Q6AWC2 1192 aa16.5■□□□□ 0.23
SLC35E2B-205ENST00000617444 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa16.5■□□□□ 0.23
SLC35E2B-205ENST00000617444 SMC3Q9UQE7 1217 aa16.5■□□□□ 0.23
SLC35E2B-205ENST00000617444 NUCB2P80303 420 aa16.49■□□□□ 0.23
SLC35E2B-205ENST00000617444 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa16.49■□□□□ 0.23
SLC35E2B-205ENST00000617444 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
SLC35E2B-205ENST00000617444 KDM4AO75164 1064 aa16.49■□□□□ 0.23
SLC35E2B-205ENST00000617444 VGFO15240 615 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SLC35E2B-205ENST00000617444 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP16.48■□□□□ 0.23
SLC35E2B-205ENST00000617444 NUTM2GQ5VZR2 741 aa16.48■□□□□ 0.23
SLC35E2B-205ENST00000617444 NEUROD6Q96NK8 337 aa16.48■□□□□ 0.23
SLC35E2B-205ENST00000617444 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SLC35E2B-205ENST00000617444 NLRP2Q9NX02 1062 aa16.47■□□□□ 0.23
SLC35E2B-205ENST00000617444 RIC3Q7Z5B4 369 aa16.47■□□□□ 0.23
SLC35E2B-205ENST00000617444 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa16.47■□□□□ 0.23
SLC35E2B-205ENST00000617444 EPS15P42566 896 aa16.46■□□□□ 0.23
SLC35E2B-205ENST00000617444 WASHC4Q2M389 1173 aa16.46■□□□□ 0.23
SLC35E2B-205ENST00000617444 WASHC2AQ641Q2 1341 aa16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms