RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRJ-208ENST00000615445 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM161AQ3B820 660 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRJ-208ENST00000615445 HECW1Q76N89 1606 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRJ-208ENST00000615445 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
PTPRJ-208ENST00000615445 PSME1Q06323 249 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRJ-208ENST00000615445 HMOX1P09601 288 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRJ-208ENST00000615445 MTHFSP49914 203 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRJ-208ENST00000615445 DAPK1P53355 1430 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRJ-208ENST00000615445 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
PTPRJ-208ENST00000615445 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
PTPRJ-208ENST00000615445 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
PTPRJ-208ENST00000615445 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
PTPRJ-208ENST00000615445 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.75■■□□□ 1.71
PTPRJ-208ENST00000615445 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.75■■□□□ 1.71
PTPRJ-208ENST00000615445 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
PTPRJ-208ENST00000615445 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
PTPRJ-208ENST00000615445 FOXD4L1Q9NU39 408 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRJ-208ENST00000615445 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
PTPRJ-208ENST00000615445 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.73■■□□□ 1.71
PTPRJ-208ENST00000615445 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRJ-208ENST00000615445 NAIPQ13075 1403 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRJ-208ENST00000615445 NECTIN2Q92692 538 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRJ-208ENST00000615445 NRDCO43847 1150 aa25.7■■□□□ 1.71
PTPRJ-208ENST00000615445 RAPGEF3O95398 923 aa25.7■■□□□ 1.71
PTPRJ-208ENST00000615445 PPP2R1AP30153 589 aa25.7■■□□□ 1.71
PTPRJ-208ENST00000615445 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.71
PTPRJ-208ENST00000615445 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
PTPRJ-208ENST00000615445 CDCA7LQ96GN5 454 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRJ-208ENST00000615445 RILPL2Q969X0 211 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRJ-208ENST00000615445 PTMSP20962 102 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRJ-208ENST00000615445 TCP11L2Q8N4U5 519 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRJ-208ENST00000615445 GNAI1P63096 354 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRJ-208ENST00000615445 PRAM1Q96QH2 718 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRJ-208ENST00000615445 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC4A3P48751 1232 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRJ-208ENST00000615445 EVA1CP58658 441 aa25.66■■□□□ 1.7
PTPRJ-208ENST00000615445 ST18O60284 1047 aa25.66■■□□□ 1.7
PTPRJ-208ENST00000615445 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRJ-208ENST00000615445 NUTM2GQ5VZR2 741 aa25.64■■□□□ 1.7
PTPRJ-208ENST00000615445 NLRP6P59044 892 aa25.64■■□□□ 1.7
PTPRJ-208ENST00000615445 IQGAP2Q13576 1575 aa25.64■■□□□ 1.7
PTPRJ-208ENST00000615445 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.64■■□□□ 1.69
PTPRJ-208ENST00000615445 TTC5Q8N0Z6 440 aa25.64■■□□□ 1.69
PTPRJ-208ENST00000615445 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
PTPRJ-208ENST00000615445 MSNP26038 577 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
PTPRJ-208ENST00000615445 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
PTPRJ-208ENST00000615445 KIF16BQ96L93 1317 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRJ-208ENST00000615445 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
PTPRJ-208ENST00000615445 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRJ-208ENST00000615445 PANK1Q8TE04 598 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRJ-208ENST00000615445 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.61■■□□□ 1.69
PTPRJ-208ENST00000615445 DRC7Q8IY82 874 aa25.61■■□□□ 1.69
PTPRJ-208ENST00000615445 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
PTPRJ-208ENST00000615445 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
PTPRJ-208ENST00000615445 ROCK1Q13464 1354 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRJ-208ENST00000615445 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
PTPRJ-208ENST00000615445 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRJ-208ENST00000615445 ARHGEF11O15085 1522 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRJ-208ENST00000615445 WDR97A6NE52 1622 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRJ-208ENST00000615445 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
PTPRJ-208ENST00000615445 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
PTPRJ-208ENST00000615445 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
PTPRJ-208ENST00000615445 ATF3P18847 181 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRJ-208ENST00000615445 PRKAR2BP31323 418 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC184Q52MB2 194 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRJ-208ENST00000615445 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRJ-208ENST00000615445 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PTPRJ-208ENST00000615445 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PTPRJ-208ENST00000615445 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PTPRJ-208ENST00000615445 LNPKQ9C0E8 428 aa25.53■■□□□ 1.68
PTPRJ-208ENST00000615445 CABP1Q9NZU7 370 aa25.53■■□□□ 1.68
PTPRJ-208ENST00000615445 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRJ-208ENST00000615445 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRJ-208ENST00000615445 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
PTPRJ-208ENST00000615445 TOMM22Q9NS69 142 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRJ-208ENST00000615445 CDK19Q9BWU1 502 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRJ-208ENST00000615445 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
PTPRJ-208ENST00000615445 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
PTPRJ-208ENST00000615445 NLRP2Q9NX02 1062 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRJ-208ENST00000615445 CUL7Q14999 1698 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRJ-208ENST00000615445 ERBINQ96RT1 1412 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRJ-208ENST00000615445 ABTB2Q8N961 1025 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRJ-208ENST00000615445 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRJ-208ENST00000615445 GRIN2AQ12879 1464 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRJ-208ENST00000615445 ABCC5O15440 1437 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRJ-208ENST00000615445 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
PTPRJ-208ENST00000615445 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRJ-208ENST00000615445 REC8O95072 547 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRJ-208ENST00000615445 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
PTPRJ-208ENST00000615445 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
PTPRJ-208ENST00000615445 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRJ-208ENST00000615445 AAMPQ13685 434 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRJ-208ENST00000615445 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRJ-208ENST00000615445 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRJ-208ENST00000615445 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
PTPRJ-208ENST00000615445 MAP3K1Q13233 1512 aa25.45■■□□□ 1.66
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