RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614051.1

CCL3-206, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3, Length 1,494 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3-206ENST00000614051 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.38■■□□□ 1.17
CCL3-206ENST00000614051 IFT172Q9UG01 1749 aa22.37■■□□□ 1.17
CCL3-206ENST00000614051 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.37■■□□□ 1.17
CCL3-206ENST00000614051 PPLO60437 1756 aa22.36■■□□□ 1.17
CCL3-206ENST00000614051 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CCL3-206ENST00000614051 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CCL3-206ENST00000614051 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CCL3-206ENST00000614051 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
CCL3-206ENST00000614051 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.32■■□□□ 1.16
CCL3-206ENST00000614051 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CCL3-206ENST00000614051 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.3■■□□□ 1.16
CCL3-206ENST00000614051 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.3■■□□□ 1.16
CCL3-206ENST00000614051 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.28■■□□□ 1.16
CCL3-206ENST00000614051 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.28■■□□□ 1.16
CCL3-206ENST00000614051 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.28■■□□□ 1.16
CCL3-206ENST00000614051 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.27■■□□□ 1.16
CCL3-206ENST00000614051 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.27■■□□□ 1.16
CCL3-206ENST00000614051 MYOM2P54296 1465 aa22.25■■□□□ 1.15
CCL3-206ENST00000614051 ZFYVE9O95405 1425 aa22.25■■□□□ 1.15
CCL3-206ENST00000614051 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.24■■□□□ 1.15
CCL3-206ENST00000614051 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.24■■□□□ 1.15
CCL3-206ENST00000614051 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CCL3-206ENST00000614051 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CCL3-206ENST00000614051 SLIT1O75093 1534 aa22.22■■□□□ 1.15
CCL3-206ENST00000614051 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.21■■□□□ 1.15
CCL3-206ENST00000614051 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.21■■□□□ 1.15
CCL3-206ENST00000614051 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CCL3-206ENST00000614051 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.2■■□□□ 1.14
CCL3-206ENST00000614051 CERKQ8TCT0 537 aa22.2■■□□□ 1.14
CCL3-206ENST00000614051 STAC3Q96MF2 364 aa22.2■■□□□ 1.14
CCL3-206ENST00000614051 LTKP29376 864 aa22.19■■□□□ 1.14
CCL3-206ENST00000614051 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.17■■□□□ 1.14
CCL3-206ENST00000614051 PIK3C2GO75747 1445 aa22.17■■□□□ 1.14
CCL3-206ENST00000614051 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
CCL3-206ENST00000614051 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CCL3-206ENST00000614051 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.14■■□□□ 1.13
CCL3-206ENST00000614051 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.14■■□□□ 1.13
CCL3-206ENST00000614051 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.14■■□□□ 1.13
CCL3-206ENST00000614051 EID1Q9Y6B2 187 aa22.14■■□□□ 1.13
CCL3-206ENST00000614051 IQGAP1P46940 1657 aa22.13■■□□□ 1.13
CCL3-206ENST00000614051 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.13■■□□□ 1.13
CCL3-206ENST00000614051 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CCL3-206ENST00000614051 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.12■■□□□ 1.13
CCL3-206ENST00000614051 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CCL3-206ENST00000614051 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CCL3-206ENST00000614051 ALKQ9UM73 1620 aa22.1■■□□□ 1.13
CCL3-206ENST00000614051 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.09■■□□□ 1.13
CCL3-206ENST00000614051 BCANQ96GW7 911 aa22.09■■□□□ 1.13
CCL3-206ENST00000614051 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CCL3-206ENST00000614051 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.09■■□□□ 1.13
CCL3-206ENST00000614051 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CCL3-206ENST00000614051 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.08■■□□□ 1.13
CCL3-206ENST00000614051 LAMC1P11047 1609 aa22.08■■□□□ 1.13
CCL3-206ENST00000614051 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CCL3-206ENST00000614051 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.08■■□□□ 1.12
CCL3-206ENST00000614051 STRCQ7RTU9 1775 aa22.06■■□□□ 1.12
CCL3-206ENST00000614051 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.06■■□□□ 1.12
CCL3-206ENST00000614051 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.05■■□□□ 1.12
CCL3-206ENST00000614051 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.04■■□□□ 1.12
CCL3-206ENST00000614051 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.04■■□□□ 1.12
CCL3-206ENST00000614051 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.04■■□□□ 1.12
CCL3-206ENST00000614051 ADGRB1O14514 1584 aa22.04■■□□□ 1.12
CCL3-206ENST00000614051 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.03■■□□□ 1.12
CCL3-206ENST00000614051 MED14O60244 1454 aa22.01■■□□□ 1.11
CCL3-206ENST00000614051 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CCL3-206ENST00000614051 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CCL3-206ENST00000614051 METP08581 1390 aa21.99■■□□□ 1.11
CCL3-206ENST00000614051 USP47Q96K76 1375 aa21.98■■□□□ 1.11
CCL3-206ENST00000614051 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CCL3-206ENST00000614051 STK26Q9P289 416 aa21.96■■□□□ 1.11
CCL3-206ENST00000614051 DIP2AQ14689 1571 aa21.96■■□□□ 1.11
CCL3-206ENST00000614051 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
CCL3-206ENST00000614051 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.95■■□□□ 1.1
CCL3-206ENST00000614051 TBX22Q9Y458 520 aa21.95■■□□□ 1.1
CCL3-206ENST00000614051 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CCL3-206ENST00000614051 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
CCL3-206ENST00000614051 PTPRUQ92729 1446 aa21.92■■□□□ 1.1
CCL3-206ENST00000614051 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
CCL3-206ENST00000614051 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.9■■□□□ 1.1
CCL3-206ENST00000614051 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
CCL3-206ENST00000614051 KNDC1Q76NI1 1749 aa21.88■■□□□ 1.09
CCL3-206ENST00000614051 IQSEC2Q5JU85 1478 aa21.87■■□□□ 1.09
CCL3-206ENST00000614051 ABCC11Q96J66 1382 aa21.86■■□□□ 1.09
CCL3-206ENST00000614051 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CCL3-206ENST00000614051 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa21.85■■□□□ 1.09
CCL3-206ENST00000614051 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CCL3-206ENST00000614051 LTBP4Q8N2S1 1624 aa21.85■■□□□ 1.09
CCL3-206ENST00000614051 QRICH2Q9H0J4 1663 aa21.85■■□□□ 1.09
CCL3-206ENST00000614051 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
CCL3-206ENST00000614051 PIK3R4Q99570 1358 aa21.83■■□□□ 1.09
CCL3-206ENST00000614051 CPS1P31327 1500 aa21.83■■□□□ 1.09
CCL3-206ENST00000614051 DLC1Q96QB1 1528 aa21.83■■□□□ 1.09
CCL3-206ENST00000614051 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.08
CCL3-206ENST00000614051 WAPLQ7Z5K2 1190 aa21.83■■□□□ 1.08
CCL3-206ENST00000614051 PRAM1Q96QH2 718 aa21.83■■□□□ 1.08
CCL3-206ENST00000614051 TECPR2O15040 1411 aa21.82■■□□□ 1.08
CCL3-206ENST00000614051 ROBO2Q9HCK4 1378 aa21.82■■□□□ 1.08
CCL3-206ENST00000614051 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa21.82■■□□□ 1.08
CCL3-206ENST00000614051 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CCL3-206ENST00000614051 KCNA6P17658 529 aa21.81■■□□□ 1.08
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