RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604081.1

HOXC-AS2-202, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXC-AS2, Length 2,090 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RAPGEF3O95398 923 aa25.13■■□□□ 1.61
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 ADGRB3O60242 1522 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ABCC3O15438 1527 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IFT172Q9UG01 1749 aa25.08■■□□□ 1.61
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NUDCQ9Y266 331 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GLI2P10070 1586 aa25.08■■□□□ 1.61
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MROH2AA6NES4 1674 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 SYNMO15061 1565 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NOS1P29475 1434 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RICTORQ6R327 1708 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXC-AS2-202ENST00000604081 INSRP06213 1382 aa25.02■■□□□ 1.6
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25■■□□□ 1.59
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.97■■□□□ 1.59
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PIK3C2GO75747 1445 aa24.97■■□□□ 1.59
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXC-AS2-202ENST00000604081 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.59
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PPLO60437 1756 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXC-AS2-202ENST00000604081 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PDE3BQ13370 1112 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ERVK-7P63135 1459 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 PIK3C2BO00750 1634 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
HOXC-AS2-202ENST00000604081 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DIP2BQ9P265 1576 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ADGRB1O14514 1584 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IDI1Q13907 227 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXC-AS2-202ENST00000604081 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.81■■□□□ 1.56
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZFYVE9O95405 1425 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXC-AS2-202ENST00000604081 REREQ9P2R6 1566 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXC-AS2-202ENST00000604081 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXC-AS2-202ENST00000604081 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXC-AS2-202ENST00000604081 AGLP35573 1532 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EVC2Q86UK5 1308 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TSPOAP1O95153 1857 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.65■■□□□ 1.54
HOXC-AS2-202ENST00000604081 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MORC1Q86VD1 984 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXC-AS2-202ENST00000604081 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CGNL1Q0VF96 1302 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXC-AS2-202ENST00000604081 USP32Q8NFA0 1604 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NGEFQ8N5V2 710 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF521Q96K83 1311 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXC-AS2-202ENST00000604081 STK26Q9P289 416 aa24.58■■□□□ 1.53
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