RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601358.5

TIMM50-216, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TIMM50, Length 1,481 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-216ENST00000601358 TRIM52Q96A61 297 aa31.82■■■□□ 2.68
TIMM50-216ENST00000601358 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa31.8■■■□□ 2.68
TIMM50-216ENST00000601358 RIMS2Q9UQ26 1411 aa31.8■■■□□ 2.68
TIMM50-216ENST00000601358 LRRC7Q96NW7 1537 aa31.79■■■□□ 2.68
TIMM50-216ENST00000601358 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP31.78■■■□□ 2.68
TIMM50-216ENST00000601358 HFM1A2PYH4 1435 aa31.77■■■□□ 2.68
TIMM50-216ENST00000601358 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
TIMM50-216ENST00000601358 ZFYVE9O95405 1425 aa31.75■■■□□ 2.67
TIMM50-216ENST00000601358 KCNA6P17658 529 aa31.73■■■□□ 2.67
TIMM50-216ENST00000601358 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa31.71■■■□□ 2.67
TIMM50-216ENST00000601358 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa31.71■■■□□ 2.67
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TIMM50-216ENST00000601358 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP31.67■■■□□ 2.66
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TIMM50-216ENST00000601358 TBX22Q9Y458 520 aa31.62■■■□□ 2.65
TIMM50-216ENST00000601358 TMEM94Q12767 1356 aa31.61■■■□□ 2.65
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TIMM50-216ENST00000601358 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
TIMM50-216ENST00000601358 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa31.52■■■□□ 2.64
TIMM50-216ENST00000601358 NWD1Q149M9 1564 aa31.52■■■□□ 2.64
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TIMM50-216ENST00000601358 C14orf37Q86TY3 774 aa31.46■■■□□ 2.63
TIMM50-216ENST00000601358 MPHOSPH9Q99550 1183 aa31.46■■■□□ 2.63
TIMM50-216ENST00000601358 MSH6P52701 1360 aa31.46■■■□□ 2.63
TIMM50-216ENST00000601358 PIK3R4Q99570 1358 aa31.46■■■□□ 2.63
TIMM50-216ENST00000601358 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa31.44■■■□□ 2.62
TIMM50-216ENST00000601358 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.42■■■□□ 2.62
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TIMM50-216ENST00000601358 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa31.38■■■□□ 2.61
TIMM50-216ENST00000601358 FAM135BQ49AJ0 1406 aa31.36■■■□□ 2.61
TIMM50-216ENST00000601358 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa31.36■■■□□ 2.61
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TIMM50-216ENST00000601358 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa31.36■■■□□ 2.61
TIMM50-216ENST00000601358 CCDC144AA2RUR9 1427 aa31.35■■■□□ 2.61
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TIMM50-216ENST00000601358 C19orf44Q9H6X5 657 aa31.32■■■□□ 2.6
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TIMM50-216ENST00000601358 RGL3Q3MIN7 710 aa31.31■■■□□ 2.6
TIMM50-216ENST00000601358 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa31.3■■■□□ 2.6
TIMM50-216ENST00000601358 ILDR2Q71H61 639 aa31.29■■■□□ 2.6
TIMM50-216ENST00000601358 CADPS2Q86UW7 1296 aa31.28■■■□□ 2.6
TIMM50-216ENST00000601358 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa31.28■■■□□ 2.6
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TIMM50-216ENST00000601358 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
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TIMM50-216ENST00000601358 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa31.17■■■□□ 2.58
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TIMM50-216ENST00000601358 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa31.14■■■□□ 2.58
TIMM50-216ENST00000601358 PHLPP1O60346 1717 aa31.11■■■□□ 2.57
TIMM50-216ENST00000601358 DCCP43146 1447 aa31.11■■■□□ 2.57
TIMM50-216ENST00000601358 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
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TIMM50-216ENST00000601358 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa31.07■■■□□ 2.56
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TIMM50-216ENST00000601358 PTCH1Q13635 1447 aa31.05■■■□□ 2.56
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TIMM50-216ENST00000601358 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.53
TIMM50-216ENST00000601358 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa30.88■■■□□ 2.53
TIMM50-216ENST00000601358 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
TIMM50-216ENST00000601358 TECPR2O15040 1411 aa30.86■■■□□ 2.53
TIMM50-216ENST00000601358 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
TIMM50-216ENST00000601358 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
TIMM50-216ENST00000601358 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
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