RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601247.5

FCHO1-235, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 458 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-235ENST00000601247 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
FCHO1-235ENST00000601247 RIMS2Q9UQ26 1411 aa21.8■■□□□ 1.08
FCHO1-235ENST00000601247 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
FCHO1-235ENST00000601247 EID1Q9Y6B2 187 aa21.79■■□□□ 1.08
FCHO1-235ENST00000601247 MYO5BQ9ULV0 1848 aa21.78■■□□□ 1.08
FCHO1-235ENST00000601247 MYOM2P54296 1465 aa21.77■■□□□ 1.08
FCHO1-235ENST00000601247 TMEM2Q9UHN6 1383 aa21.76■■□□□ 1.07
FCHO1-235ENST00000601247 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa21.76■■□□□ 1.07
FCHO1-235ENST00000601247 PPLO60437 1756 aa21.76■■□□□ 1.07
FCHO1-235ENST00000601247 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
FCHO1-235ENST00000601247 IFT172Q9UG01 1749 aa21.75■■□□□ 1.07
FCHO1-235ENST00000601247 BCANQ96GW7 911 aa21.74■■□□□ 1.07
FCHO1-235ENST00000601247 PRAG1Q86YV5 1406 aa21.72■■□□□ 1.07
FCHO1-235ENST00000601247 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.72■■□□□ 1.07
FCHO1-235ENST00000601247 ZFYVE9O95405 1425 aa21.72■■□□□ 1.07
FCHO1-235ENST00000601247 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa21.71■■□□□ 1.07
FCHO1-235ENST00000601247 SLIT1O75093 1534 aa21.7■■□□□ 1.07
FCHO1-235ENST00000601247 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.69■■□□□ 1.06
FCHO1-235ENST00000601247 ANKLE2Q86XL3 938 aa21.69■■□□□ 1.06
FCHO1-235ENST00000601247 ARHGAP23Q9P227 1491 aa21.69■■□□□ 1.06
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FCHO1-235ENST00000601247 NRXN1Q9ULB1 1477 aa21.66■■□□□ 1.06
FCHO1-235ENST00000601247 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
FCHO1-235ENST00000601247 RALGAPBQ86X10 1494 aa21.65■■□□□ 1.06
FCHO1-235ENST00000601247 PIK3C2GO75747 1445 aa21.65■■□□□ 1.06
FCHO1-235ENST00000601247 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
FCHO1-235ENST00000601247 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa21.63■■□□□ 1.05
FCHO1-235ENST00000601247 LTKP29376 864 aa21.63■■□□□ 1.05
FCHO1-235ENST00000601247 LAMC1P11047 1609 aa21.62■■□□□ 1.05
FCHO1-235ENST00000601247 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa21.62■■□□□ 1.05
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FCHO1-235ENST00000601247 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa21.6■■□□□ 1.05
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FCHO1-235ENST00000601247 HSPA2P54652 639 aa21.58■■□□□ 1.05
FCHO1-235ENST00000601247 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa21.57■■□□□ 1.04
FCHO1-235ENST00000601247 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
FCHO1-235ENST00000601247 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.56■■□□□ 1.04
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FCHO1-235ENST00000601247 ALKQ9UM73 1620 aa21.55■■□□□ 1.04
FCHO1-235ENST00000601247 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
FCHO1-235ENST00000601247 IQGAP1P46940 1657 aa21.54■■□□□ 1.04
FCHO1-235ENST00000601247 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.04
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FCHO1-235ENST00000601247 GPRASP1Q5JY77 1395 aa21.53■■□□□ 1.04
FCHO1-235ENST00000601247 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
FCHO1-235ENST00000601247 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.52■■□□□ 1.04
FCHO1-235ENST00000601247 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.51■■□□□ 1.03
FCHO1-235ENST00000601247 TBX22Q9Y458 520 aa21.51■■□□□ 1.03
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FCHO1-235ENST00000601247 PIK3R4Q99570 1358 aa21.44■■□□□ 1.02
FCHO1-235ENST00000601247 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa21.44■■□□□ 1.02
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FCHO1-235ENST00000601247 ABCC11Q96J66 1382 aa21.39■■□□□ 1.02
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FCHO1-235ENST00000601247 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.39■■□□□ 1.01
FCHO1-235ENST00000601247 SLC24A1O60721 1099 aa21.39■■□□□ 1.01
FCHO1-235ENST00000601247 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa21.39■■□□□ 1.01
FCHO1-235ENST00000601247 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
FCHO1-235ENST00000601247 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
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FCHO1-235ENST00000601247 SIRT1Q96EB6 747 aa21.34■■□□□ 1.01
FCHO1-235ENST00000601247 TECPR2O15040 1411 aa21.34■■□□□ 1.01
FCHO1-235ENST00000601247 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
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FCHO1-235ENST00000601247 CPS1P31327 1500 aa21.33■■□□□ 1
FCHO1-235ENST00000601247 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.32■■□□□ 1
FCHO1-235ENST00000601247 TMF1P82094 1093 aa21.32■■□□□ 1
FCHO1-235ENST00000601247 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.32■■□□□ 1
FCHO1-235ENST00000601247 PTCH1Q13635 1447 aa21.31■■□□□ 1
FCHO1-235ENST00000601247 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
FCHO1-235ENST00000601247 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
FCHO1-235ENST00000601247 QRICH2Q9H0J4 1663 aa21.29■■□□□ 1
FCHO1-235ENST00000601247 CDCA8Q53HL2 280 aa21.29■■□□□ 1
FCHO1-235ENST00000601247 ROBO2Q9HCK4 1378 aa21.28■■□□□ 1
FCHO1-235ENST00000601247 WAPLQ7Z5K2 1190 aa21.28■■□□□ 1
FCHO1-235ENST00000601247 NWD1Q149M9 1564 aa21.27■■□□□ 1
FCHO1-235ENST00000601247 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa21.27■■□□□ 1
FCHO1-235ENST00000601247 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.27■■□□□ 1
FCHO1-235ENST00000601247 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP21.27■□□□□ 0.99
FCHO1-235ENST00000601247 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
FCHO1-235ENST00000601247 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
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