RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598128.5

LINC00854-208, Long intergenic non-protein coding RNA 854, human

TSL 5

Gene LINC00854, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00854-208	ENST00000598128	MCM4	P33991	863 aa		10.46	□□□□□ -0.73
LINC00854-208	ENST00000598128	GOLGA2	Q08379	1002 aa		10.46	□□□□□ -0.73
LINC00854-208	ENST00000598128	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		10.46	□□□□□ -0.73
LINC00854-208	ENST00000598128	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	10.46	□□□□□ -0.73
LINC00854-208	ENST00000598128	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
LINC00854-208	ENST00000598128	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		10.46	□□□□□ -0.73
LINC00854-208	ENST00000598128	ATP10A	O60312	1499 aa		10.46	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	UNC13B	O14795	1591 aa		10.46	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	ADAMTS12	P58397	1594 aa		10.46	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		10.46	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	IQGAP1	P46940	1657 aa		10.45	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	KIAA0556	O60303	1618 aa		10.45	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	SYNJ2	O15056	1496 aa		10.45	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		10.45	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		10.45	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	CDCA8	Q53HL2	280 aa		10.45	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	CFAP44	Q96MT7	982 aa		10.45	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		10.45	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		10.45	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		10.44	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		10.44	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		10.44	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	GBP4	Q96PP9	640 aa		10.44	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		10.44	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	POGK	Q9P215	609 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	USP19	O94966	1318 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	KIF16B	Q96L93	1317 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128		E9PSI1	815 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	TAF3	Q5VWG9	929 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	OFD1	O75665	1012 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		10.4	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	DYNC1I1	O14576	645 aa		10.4	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		10.4	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	P3H3	Q8IVL6	736 aa		10.4	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	SNX21	Q969T3	373 aa		10.4	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		10.4	□□□□□ -0.74
LINC00854-208	ENST00000598128	KANK1	Q14678	1352 aa		10.39	□□□□□ -0.75
LINC00854-208	ENST00000598128	TRAK2	O60296	914 aa		10.39	□□□□□ -0.75
LINC00854-208	ENST00000598128	SLFN5	Q08AF3	891 aa		10.39	□□□□□ -0.75
LINC00854-208	ENST00000598128	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		10.39	□□□□□ -0.75
LINC00854-208	ENST00000598128	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		10.39	□□□□□ -0.75
LINC00854-208	ENST00000598128	ADGRL1	O94910	1474 aa		10.38	□□□□□ -0.75
LINC00854-208	ENST00000598128	GRIN2A	Q12879	1464 aa		10.38	□□□□□ -0.75
LINC00854-208	ENST00000598128	USP32	Q8NFA0	1604 aa		10.38	□□□□□ -0.75
LINC00854-208	ENST00000598128	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
LINC00854-208	ENST00000598128	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
LINC00854-208	ENST00000598128	TMF1	P82094	1093 aa		10.38	□□□□□ -0.75
LINC00854-208	ENST00000598128	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	10.38	□□□□□ -0.75
LINC00854-208	ENST00000598128	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		10.38	□□□□□ -0.75
LINC00854-208	ENST00000598128	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		10.38	□□□□□ -0.75
LINC00854-208	ENST00000598128	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
LINC00854-208	ENST00000598128	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		10.37	□□□□□ -0.75
LINC00854-208	ENST00000598128	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		10.37	□□□□□ -0.75
LINC00854-208	ENST00000598128	MYOM1	P52179	1685 aa		10.37	□□□□□ -0.75
LINC00854-208	ENST00000598128	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
LINC00854-208	ENST00000598128	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
LINC00854-208	ENST00000598128	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		10.36	□□□□□ -0.75
LINC00854-208	ENST00000598128	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		10.36	□□□□□ -0.75
LINC00854-208	ENST00000598128	KIF20A	O95235	890 aa		10.36	□□□□□ -0.75
LINC00854-208	ENST00000598128	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		10.36	□□□□□ -0.75
LINC00854-208	ENST00000598128	PKD2	Q13563	968 aa		10.35	□□□□□ -0.75
LINC00854-208	ENST00000598128	HSCB	Q8IWL3	235 aa		10.35	□□□□□ -0.75
LINC00854-208	ENST00000598128	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		10.35	□□□□□ -0.75
LINC00854-208	ENST00000598128	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
LINC00854-208	ENST00000598128	CEP152	O94986	1710 aa		10.35	□□□□□ -0.75
LINC00854-208	ENST00000598128	SLC4A3	P48751	1232 aa		10.34	□□□□□ -0.75
LINC00854-208	ENST00000598128	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
LINC00854-208	ENST00000598128	SMC5	Q8IY18	1101 aa		10.34	□□□□□ -0.75
LINC00854-208	ENST00000598128	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		10.34	□□□□□ -0.75
LINC00854-208	ENST00000598128	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LINC00854-208	ENST00000598128	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LINC00854-208	ENST00000598128	DDIT3	P35638	169 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LINC00854-208	ENST00000598128	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LINC00854-208	ENST00000598128	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LINC00854-208	ENST00000598128	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
LINC00854-208	ENST00000598128	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LINC00854-208	ENST00000598128	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
LINC00854-208	ENST00000598128	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LINC00854-208	ENST00000598128	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
LINC00854-208	ENST00000598128	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
LINC00854-208	ENST00000598128	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LINC00854-208	ENST00000598128	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LINC00854-208	ENST00000598128	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LINC00854-208	ENST00000598128	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
LINC00854-208	ENST00000598128	RGS3	P49796	1198 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LINC00854-208	ENST00000598128	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		10.31	□□□□□ -0.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms