RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 ERCC6Q03468 1493 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC3-212ENST00000597259 LCE2BO14633 110 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC3-212ENST00000597259 IL21Q9HBE4 155 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC3-212ENST00000597259 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
HERC3-212ENST00000597259 PPP1R18Q6NYC8 613 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC3-212ENST00000597259 TTC13Q8NBP0 860 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC3-212ENST00000597259 PRKD2Q9BZL6 878 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC3-212ENST00000597259 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
HERC3-212ENST00000597259 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
HERC3-212ENST00000597259 NKX2-3Q8TAU0 364 aa10.2□□□□□ -0.78
HERC3-212ENST00000597259 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa10.2□□□□□ -0.78
HERC3-212ENST00000597259 GFRA3O60609 400 aa10.19□□□□□ -0.78
HERC3-212ENST00000597259 HDGFP51858 240 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
HERC3-212ENST00000597259 CADPSQ9ULU8 1353 aa10.16□□□□□ -0.78
HERC3-212ENST00000597259 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
HERC3-212ENST00000597259 COPS2P61201 443 aa10.16□□□□□ -0.78
HERC3-212ENST00000597259 LAPTM4AQ15012 233 aa10.16□□□□□ -0.78
HERC3-212ENST00000597259 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
HERC3-212ENST00000597259 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
HERC3-212ENST00000597259 EYA1Q99502 592 aa10.14□□□□□ -0.79
HERC3-212ENST00000597259 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
HERC3-212ENST00000597259 SLF2Q8IX21 1173 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC3-212ENST00000597259 V9GY48 417 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
HERC3-212ENST00000597259 PDS5BQ9NTI5 1447 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-212ENST00000597259 TRAF7Q6Q0C0 670 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-212ENST00000597259 KCNV2Q8TDN2 545 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-212ENST00000597259 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
HERC3-212ENST00000597259 WDR62O43379 1518 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC3-212ENST00000597259 CFTRP13569 1480 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC3-212ENST00000597259 ZPR1O75312 459 aa10.08□□□□□ -0.8
HERC3-212ENST00000597259 NECTIN2Q92692 538 aa10.08□□□□□ -0.8
HERC3-212ENST00000597259 MRC2Q9UBG0 1479 aa10.08□□□□□ -0.8
HERC3-212ENST00000597259 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
HERC3-212ENST00000597259 PTGDRQ13258 359 aa10.06□□□□□ -0.8
HERC3-212ENST00000597259 FAM161AQ3B820 660 aa10.06□□□□□ -0.8
HERC3-212ENST00000597259 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa10.06□□□□□ -0.8
HERC3-212ENST00000597259 FANCD2Q9BXW9 1451 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-212ENST00000597259 PRDM2Q13029 1718 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-212ENST00000597259 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-212ENST00000597259 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-212ENST00000597259 CCDC88BA6NC98 1476 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-212ENST00000597259 TLL1O43897 1013 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-212ENST00000597259 SLC4A3P48751 1232 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-212ENST00000597259 CEP164Q9UPV0 1460 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-212ENST00000597259 DNAJB2P25686 324 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-212ENST00000597259 GGCXP38435 758 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-212ENST00000597259 ADGRG1Q9Y653 693 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-212ENST00000597259 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.8
HERC3-212ENST00000597259 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
HERC3-212ENST00000597259 TMEM134Q9H6X4 195 aa10.02□□□□□ -0.81
HERC3-212ENST00000597259 RNF223E7ERA6 249 aa10.01□□□□□ -0.81
HERC3-212ENST00000597259 TMUB1Q9BVT8 246 aa10.01□□□□□ -0.81
HERC3-212ENST00000597259 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa10.01□□□□□ -0.81
HERC3-212ENST00000597259 NUTM2FA1L443 756 aa10□□□□□ -0.81
HERC3-212ENST00000597259 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
HERC3-212ENST00000597259 PRR14Q9BWN1 585 aa10□□□□□ -0.81
HERC3-212ENST00000597259 RCCD1A6NED2 376 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC3-212ENST00000597259 TRIM67Q6ZTA4 783 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-212ENST00000597259 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
HERC3-212ENST00000597259 CFHP08603 1231 aa9.97□□□□□ -0.81
HERC3-212ENST00000597259 SLC10A3P09131 477 aa9.96□□□□□ -0.82
HERC3-212ENST00000597259 SLC19A1P41440 591 aa9.96□□□□□ -0.82
HERC3-212ENST00000597259 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
HERC3-212ENST00000597259 S1PR4O95977 384 aa9.95□□□□□ -0.82
HERC3-212ENST00000597259 SEMA3EO15041 775 aa9.94□□□□□ -0.82
HERC3-212ENST00000597259 KMT5BQ4FZB7 885 aa9.94□□□□□ -0.82
HERC3-212ENST00000597259 FCHSD2O94868 740 aa9.92□□□□□ -0.82
HERC3-212ENST00000597259 ZNF787Q6DD87 383 aa9.92□□□□□ -0.82
HERC3-212ENST00000597259 SPRYD7Q5W111 196 aa9.91□□□□□ -0.82
HERC3-212ENST00000597259 LIAT1Q6ZQX7 453 aa9.91□□□□□ -0.82
HERC3-212ENST00000597259 ANKLE1Q8NAG6 615 aa9.91□□□□□ -0.82
HERC3-212ENST00000597259 PXYLP1Q8TE99 480 aa9.9□□□□□ -0.82
HERC3-212ENST00000597259 TOPBP1Q92547 1522 aa9.9□□□□□ -0.82
HERC3-212ENST00000597259 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
HERC3-212ENST00000597259 ADH1BP00325 375 aa9.89□□□□□ -0.83
HERC3-212ENST00000597259 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
HERC3-212ENST00000597259 PLA2G2CQ5R387 149 aa9.88□□□□□ -0.83
HERC3-212ENST00000597259 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
HERC3-212ENST00000597259 VSIG10Q8N0Z9 540 aa9.88□□□□□ -0.83
HERC3-212ENST00000597259 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
HERC3-212ENST00000597259 ZNF697Q5TEC3 545 aa9.87□□□□□ -0.83
HERC3-212ENST00000597259 P3H3Q8IVL6 736 aa9.87□□□□□ -0.83
HERC3-212ENST00000597259 DNMBPQ6XZF7 1577 aa9.87□□□□□ -0.83
HERC3-212ENST00000597259 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
HERC3-212ENST00000597259 SLC24A1O60721 1099 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-212ENST00000597259 NR1I2O75469 434 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-212ENST00000597259 TNFRSF10AO00220 468 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-212ENST00000597259 FECHP22830 423 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-212ENST00000597259 MYT1Q01538 1121 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-212ENST00000597259 PKDCCQ504Y2 493 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-212ENST00000597259 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
HERC3-212ENST00000597259 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
HERC3-212ENST00000597259 SLC6A16Q9GZN6 736 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-212ENST00000597259 OATP04181 439 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-212ENST00000597259 PRR20EP86478 221 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-212ENST00000597259 PRR20CP86479 221 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-212ENST00000597259 PRR20DP86480 221 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-212ENST00000597259 PRR20BP86481 221 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-212ENST00000597259 PRR20AP86496 221 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-212ENST00000597259 SCUBE3Q8IX30 993 aa9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms