RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592658.1

CTIF-211, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 952 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-211ENST00000592658 KANK1Q14678 1352 aa20.92■□□□□ 0.94
CTIF-211ENST00000592658 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
CTIF-211ENST00000592658 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.88■□□□□ 0.93
CTIF-211ENST00000592658 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa20.88■□□□□ 0.93
CTIF-211ENST00000592658 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.88■□□□□ 0.93
CTIF-211ENST00000592658 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.88■□□□□ 0.93
CTIF-211ENST00000592658 ZFYVE9O95405 1425 aa20.87■□□□□ 0.93
CTIF-211ENST00000592658 DAPK1P53355 1430 aa20.86■□□□□ 0.93
CTIF-211ENST00000592658 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa20.85■□□□□ 0.93
CTIF-211ENST00000592658 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
CTIF-211ENST00000592658 SLC52A1Q9NWF4 448 aa20.85■□□□□ 0.93
CTIF-211ENST00000592658 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa20.85■□□□□ 0.93
CTIF-211ENST00000592658 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
CTIF-211ENST00000592658 SHPRHQ149N8 1683 aa20.83■□□□□ 0.93
CTIF-211ENST00000592658 TRIM52Q96A61 297 aa20.82■□□□□ 0.92
CTIF-211ENST00000592658 BCANQ96GW7 911 aa20.82■□□□□ 0.92
CTIF-211ENST00000592658 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
CTIF-211ENST00000592658 MYO5BQ9ULV0 1848 aa20.8■□□□□ 0.92
CTIF-211ENST00000592658 RIMS2Q9UQ26 1411 aa20.79■□□□□ 0.92
CTIF-211ENST00000592658 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.79■□□□□ 0.92
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CTIF-211ENST00000592658 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
CTIF-211ENST00000592658 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
CTIF-211ENST00000592658 TBX22Q9Y458 520 aa20.78■□□□□ 0.92
CTIF-211ENST00000592658 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa20.78■□□□□ 0.92
CTIF-211ENST00000592658 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.77■□□□□ 0.92
CTIF-211ENST00000592658 DIP2AQ14689 1571 aa20.77■□□□□ 0.92
CTIF-211ENST00000592658 RXRBP28702 533 aa20.76■□□□□ 0.91
CTIF-211ENST00000592658 CADPS2Q86UW7 1296 aa20.75■□□□□ 0.91
CTIF-211ENST00000592658 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.75■□□□□ 0.91
CTIF-211ENST00000592658 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa20.75■□□□□ 0.91
CTIF-211ENST00000592658 C19orf44Q9H6X5 657 aa20.74■□□□□ 0.91
CTIF-211ENST00000592658 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
CTIF-211ENST00000592658 HDGFP51858 240 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
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CTIF-211ENST00000592658 PIK3R4Q99570 1358 aa20.72■□□□□ 0.91
CTIF-211ENST00000592658 ATF3P18847 181 aa20.71■□□□□ 0.91
CTIF-211ENST00000592658 C14orf37Q86TY3 774 aa20.71■□□□□ 0.91
CTIF-211ENST00000592658 BRINP3Q76B58 766 aa20.7■□□□□ 0.9
CTIF-211ENST00000592658 APLP2Q06481 763 aa20.68■□□□□ 0.9
CTIF-211ENST00000592658 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP20.68■□□□□ 0.9
CTIF-211ENST00000592658 AFF2P51816 1311 aa20.68■□□□□ 0.9
CTIF-211ENST00000592658 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.67■□□□□ 0.9
CTIF-211ENST00000592658 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
CTIF-211ENST00000592658 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
CTIF-211ENST00000592658 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
CTIF-211ENST00000592658 DCCP43146 1447 aa20.66■□□□□ 0.9
CTIF-211ENST00000592658 PTPRUQ92729 1446 aa20.66■□□□□ 0.9
CTIF-211ENST00000592658 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa20.66■□□□□ 0.9
CTIF-211ENST00000592658 RGS12O14924 1447 aa20.65■□□□□ 0.9
CTIF-211ENST00000592658 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.65■□□□□ 0.9
CTIF-211ENST00000592658 NHSL1Q5SYE7 1610 aa20.64■□□□□ 0.9
CTIF-211ENST00000592658 TRPM2O94759 1503 aa20.64■□□□□ 0.9
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CTIF-211ENST00000592658 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CTIF-211ENST00000592658 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CTIF-211ENST00000592658 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
CTIF-211ENST00000592658 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CTIF-211ENST00000592658 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa20.56■□□□□ 0.88
CTIF-211ENST00000592658 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
CTIF-211ENST00000592658 C8orf37Q96NL8 207 aa20.56■□□□□ 0.88
CTIF-211ENST00000592658 PNPLA6Q8IY17 1366 aa20.56■□□□□ 0.88
CTIF-211ENST00000592658 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa20.54■□□□□ 0.88
CTIF-211ENST00000592658 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CTIF-211ENST00000592658 IQGAP3Q86VI3 1631 aa20.51■□□□□ 0.87
CTIF-211ENST00000592658 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa20.49■□□□□ 0.87
CTIF-211ENST00000592658 METP08581 1390 aa20.48■□□□□ 0.87
CTIF-211ENST00000592658 ATAD2Q6PL18 1390 aa20.48■□□□□ 0.87
CTIF-211ENST00000592658 NGLY1Q96IV0 654 aa20.48■□□□□ 0.87
CTIF-211ENST00000592658 LAMC1P11047 1609 aa20.48■□□□□ 0.87
CTIF-211ENST00000592658 NALCNQ8IZF0 1738 aa20.47■□□□□ 0.87
CTIF-211ENST00000592658 ADAMTS2O95450 1211 aa20.44■□□□□ 0.86
CTIF-211ENST00000592658 C1orf167Q5SNV9 1468 aa20.43■□□□□ 0.86
CTIF-211ENST00000592658 ROCK1Q13464 1354 aa20.42■□□□□ 0.86
CTIF-211ENST00000592658 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CTIF-211ENST00000592658 ZRANB1Q9UGI0 708 aa20.41■□□□□ 0.86
CTIF-211ENST00000592658 USP21Q9UK80 565 aa20.41■□□□□ 0.86
CTIF-211ENST00000592658 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CTIF-211ENST00000592658 ATRNO75882 1429 aa20.41■□□□□ 0.86
CTIF-211ENST00000592658 NUP155O75694 1391 aa20.4■□□□□ 0.86
CTIF-211ENST00000592658 PTCH1Q13635 1447 aa20.4■□□□□ 0.86
CTIF-211ENST00000592658 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
CTIF-211ENST00000592658 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CTIF-211ENST00000592658 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa20.37■□□□□ 0.85
CTIF-211ENST00000592658 FOXD1Q16676 465 aa20.37■□□□□ 0.85
CTIF-211ENST00000592658 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa20.37■□□□□ 0.85
CTIF-211ENST00000592658 ORAI2Q96SN7 254 aa20.35■□□□□ 0.85
CTIF-211ENST00000592658 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CTIF-211ENST00000592658 CCDC125Q86Z20 511 aa20.34■□□□□ 0.85
CTIF-211ENST00000592658 MYOM2P54296 1465 aa20.33■□□□□ 0.85
CTIF-211ENST00000592658 BCL9LQ86UU0 1499 aa20.33■□□□□ 0.85
CTIF-211ENST00000592658 ROBO2Q9HCK4 1378 aa20.32■□□□□ 0.84
CTIF-211ENST00000592658 PRAG1Q86YV5 1406 aa20.31■□□□□ 0.84
CTIF-211ENST00000592658 CLTCL1P53675 1640 aa20.29■□□□□ 0.84
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