RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580667.5

PLXDC1-218, Transcript of plexin domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene PLXDC1, Length 565 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXDC1-218ENST00000580667 MED14O60244 1454 aa21.75■■□□□ 1.07
PLXDC1-218ENST00000580667 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa21.73■■□□□ 1.07
PLXDC1-218ENST00000580667 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa21.73■■□□□ 1.07
PLXDC1-218ENST00000580667 LTKP29376 864 aa21.72■■□□□ 1.07
PLXDC1-218ENST00000580667 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PLXDC1-218ENST00000580667 ANKLE2Q86XL3 938 aa21.7■■□□□ 1.06
PLXDC1-218ENST00000580667 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
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PLXDC1-218ENST00000580667 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa21.67■■□□□ 1.06
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PLXDC1-218ENST00000580667 MYOM2P54296 1465 aa21.64■■□□□ 1.06
PLXDC1-218ENST00000580667 STRCP1A6NGW2 1772 aa21.64■■□□□ 1.06
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PLXDC1-218ENST00000580667 LAMC1P11047 1609 aa21.59■■□□□ 1.05
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PLXDC1-218ENST00000580667 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.52■■□□□ 1.04
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PLXDC1-218ENST00000580667 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.48■■□□□ 1.03
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PLXDC1-218ENST00000580667 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.35■■□□□ 1.01
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PLXDC1-218ENST00000580667 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
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PLXDC1-218ENST00000580667 ROBO2Q9HCK4 1378 aa21.3■■□□□ 1
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PLXDC1-218ENST00000580667 IQSEC2Q5JU85 1478 aa21.29■■□□□ 1
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PLXDC1-218ENST00000580667 STK26Q9P289 416 aa21.25■□□□□ 0.99
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PLXDC1-218ENST00000580667 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
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