RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578431.1

EPB41L3-210, Transcript of erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3, humanhuman

TSL 2

Gene EPB41L3, Length 570 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L3-210ENST00000578431 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa42.31■■■■■ 4.36
EPB41L3-210ENST00000578431 TXNDC2Q86VQ3 553 aa42.31■■■■■ 4.36
EPB41L3-210ENST00000578431 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa42.25■■■■■ 4.35
EPB41L3-210ENST00000578431 HDGFP51858 240 aaKnown RBP42.25■■■■■ 4.35
EPB41L3-210ENST00000578431 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa42.24■■■■■ 4.35
EPB41L3-210ENST00000578431 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP42.24■■■■■ 4.35
EPB41L3-210ENST00000578431 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa42.19■■■■■ 4.34
EPB41L3-210ENST00000578431 PPLO60437 1756 aa42.17■■■■■ 4.34
EPB41L3-210ENST00000578431 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP42.16■■■■■ 4.34
EPB41L3-210ENST00000578431 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa42.15■■■■■ 4.34
EPB41L3-210ENST00000578431 IFT172Q9UG01 1749 aa42.15■■■■■ 4.34
EPB41L3-210ENST00000578431 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
EPB41L3-210ENST00000578431 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP42.12■■■■■ 4.33
EPB41L3-210ENST00000578431 PCGF6Q9BYE7 350 aa42.11■■■■■ 4.33
EPB41L3-210ENST00000578431 DIP2AQ14689 1571 aa42.08■■■■■ 4.33
EPB41L3-210ENST00000578431 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa42.08■■■■■ 4.33
EPB41L3-210ENST00000578431 LTBP4Q8N2S1 1624 aa42.07■■■■■ 4.33
EPB41L3-210ENST00000578431 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa42.05■■■■■ 4.32
EPB41L3-210ENST00000578431 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP42.01■■■■■ 4.32
EPB41L3-210ENST00000578431 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa42■■■■■ 4.31
EPB41L3-210ENST00000578431 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP41.99■■■■■ 4.31
EPB41L3-210ENST00000578431 VGFO15240 615 aaPredicted RBP41.98■■■■■ 4.31
EPB41L3-210ENST00000578431 RGL3Q3MIN7 710 aa41.96■■■■■ 4.31
EPB41L3-210ENST00000578431 CPS1P31327 1500 aa41.95■■■■■ 4.31
EPB41L3-210ENST00000578431 STRCP1A6NGW2 1772 aa41.93■■■■■ 4.3
EPB41L3-210ENST00000578431 MYOM2P54296 1465 aa41.93■■■■■ 4.3
EPB41L3-210ENST00000578431 SLC26A8Q96RN1 970 aa41.93■■■■■ 4.3
EPB41L3-210ENST00000578431 NWD1Q149M9 1564 aa41.93■■■■■ 4.3
EPB41L3-210ENST00000578431 BCANQ96GW7 911 aa41.92■■■■■ 4.3
EPB41L3-210ENST00000578431 TBX22Q9Y458 520 aa41.92■■■■■ 4.3
EPB41L3-210ENST00000578431 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP41.89■■■■■ 4.3
EPB41L3-210ENST00000578431 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP41.88■■■■■ 4.3
EPB41L3-210ENST00000578431 PIK3R4Q99570 1358 aa41.88■■■■■ 4.29
EPB41L3-210ENST00000578431 NRXN1Q9ULB1 1477 aa41.86■■■■■ 4.29
EPB41L3-210ENST00000578431 IQSEC2Q5JU85 1478 aa41.84■■■■■ 4.29
EPB41L3-210ENST00000578431 PIK3C2GO75747 1445 aa41.83■■■■■ 4.29
EPB41L3-210ENST00000578431 ALKQ9UM73 1620 aa41.81■■■■■ 4.28
EPB41L3-210ENST00000578431 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
EPB41L3-210ENST00000578431 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa41.8■■■■■ 4.28
EPB41L3-210ENST00000578431 STAC3Q96MF2 364 aa41.79■■■■■ 4.28
EPB41L3-210ENST00000578431 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
EPB41L3-210ENST00000578431 KCNA6P17658 529 aa41.78■■■■■ 4.28
EPB41L3-210ENST00000578431 CERKQ8TCT0 537 aa41.78■■■■■ 4.28
EPB41L3-210ENST00000578431 LAMC1P11047 1609 aa41.77■■■■■ 4.28
EPB41L3-210ENST00000578431 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP41.75■■■■■ 4.27
EPB41L3-210ENST00000578431 LRRC7Q96NW7 1537 aa41.73■■■■■ 4.27
EPB41L3-210ENST00000578431 METP08581 1390 aa41.71■■■■■ 4.27
EPB41L3-210ENST00000578431 SIN3AQ96ST3 1273 aa41.7■■■■■ 4.27
EPB41L3-210ENST00000578431 PTPRUQ92729 1446 aa41.69■■■■■ 4.26
EPB41L3-210ENST00000578431 DCAF11Q8TEB1 546 aa41.68■■■■■ 4.26
EPB41L3-210ENST00000578431 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
EPB41L3-210ENST00000578431 PRAG1Q86YV5 1406 aa41.65■■■■■ 4.26
EPB41L3-210ENST00000578431 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa41.62■■■■■ 4.25
EPB41L3-210ENST00000578431 CLSPNQ9HAW4 1339 aa41.62■■■■■ 4.25
EPB41L3-210ENST00000578431 NEUROD1Q13562 356 aa41.58■■■■■ 4.25
EPB41L3-210ENST00000578431 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
EPB41L3-210ENST00000578431 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa41.58■■■■■ 4.25
EPB41L3-210ENST00000578431 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa41.56■■■■■ 4.24
EPB41L3-210ENST00000578431 KNDC1Q76NI1 1749 aa41.55■■■■■ 4.24
EPB41L3-210ENST00000578431 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa41.55■■■■■ 4.24
EPB41L3-210ENST00000578431 PTCH1Q13635 1447 aa41.54■■■■■ 4.24
EPB41L3-210ENST00000578431 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa41.53■■■■■ 4.24
EPB41L3-210ENST00000578431 TMEM94Q12767 1356 aa41.53■■■■■ 4.24
EPB41L3-210ENST00000578431 L3MBTL2Q969R5 705 aa41.53■■■■■ 4.24
EPB41L3-210ENST00000578431 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
EPB41L3-210ENST00000578431 TECPR2O15040 1411 aa41.5■■■■■ 4.23
EPB41L3-210ENST00000578431 ADGRB1O14514 1584 aa41.5■■■■■ 4.23
EPB41L3-210ENST00000578431 CFAP70Q5T0N1 1121 aa41.48■■■■■ 4.23
EPB41L3-210ENST00000578431 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP41.47■■■■■ 4.23
EPB41L3-210ENST00000578431 TONSLQ96HA7 1378 aa41.46■■■■■ 4.23
EPB41L3-210ENST00000578431 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.23
EPB41L3-210ENST00000578431 ABCC11Q96J66 1382 aa41.43■■■■■ 4.22
EPB41L3-210ENST00000578431 TMEM132EQ6IEE7 984 aa41.39■■■■■ 4.22
EPB41L3-210ENST00000578431 FBXO41Q8TF61 875 aa41.39■■■■■ 4.22
EPB41L3-210ENST00000578431 ROBO2Q9HCK4 1378 aa41.38■■■■■ 4.22
EPB41L3-210ENST00000578431 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP41.36■■■■■ 4.21
EPB41L3-210ENST00000578431 DLC1Q96QB1 1528 aa41.35■■■■■ 4.21
EPB41L3-210ENST00000578431 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa41.35■■■■■ 4.21
EPB41L3-210ENST00000578431 NALCNQ8IZF0 1738 aa41.34■■■■■ 4.21
EPB41L3-210ENST00000578431 MSH6P52701 1360 aa41.34■■■■■ 4.21
EPB41L3-210ENST00000578431 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
EPB41L3-210ENST00000578431 FAM135BQ49AJ0 1406 aa41.32■■■■■ 4.21
EPB41L3-210ENST00000578431 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.2
EPB41L3-210ENST00000578431 DCCP43146 1447 aa41.3■■■■■ 4.2
EPB41L3-210ENST00000578431 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa41.3■■■■■ 4.2
EPB41L3-210ENST00000578431 SIRT1Q96EB6 747 aa41.29■■■■■ 4.2
EPB41L3-210ENST00000578431 TOM1O60784 492 aa41.28■■■■■ 4.2
EPB41L3-210ENST00000578431 UBAP1LF5GYI3 381 aa41.27■■■■■ 4.2
EPB41L3-210ENST00000578431 STK26Q9P289 416 aa41.27■■■■■ 4.2
EPB41L3-210ENST00000578431 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa41.27■■■■■ 4.2
EPB41L3-210ENST00000578431 C19orf44Q9H6X5 657 aa41.24■■■■■ 4.19
EPB41L3-210ENST00000578431 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
EPB41L3-210ENST00000578431 C14orf37Q86TY3 774 aa41.22■■■■■ 4.19
EPB41L3-210ENST00000578431 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa41.17■■■■■ 4.18
EPB41L3-210ENST00000578431 RALGAPBQ86X10 1494 aa41.16■■■■■ 4.18
EPB41L3-210ENST00000578431 NBPF1Q3BBV0 1214 aa41.16■■■■■ 4.18
EPB41L3-210ENST00000578431 NBPF8Q3BBV2 869 aa41.16■■■■■ 4.18
EPB41L3-210ENST00000578431 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa41.15■■■■■ 4.18
EPB41L3-210ENST00000578431 CADPS2Q86UW7 1296 aa41.15■■■■■ 4.18
EPB41L3-210ENST00000578431 GPRASP1Q5JY77 1395 aa41.13■■■■■ 4.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms