RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576390.5

P4HB-223, Transcript of prolyl 4-hydroxylase subunit beta, human

TSL 4 BASIC

Gene P4HB, Length 439 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
P4HB-223	ENST00000576390	KCNA6	P17658	529 aa		29.17	■■■□□ 2.26
P4HB-223	ENST00000576390	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		29.15	■■■□□ 2.26
P4HB-223	ENST00000576390	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	29.13	■■■□□ 2.25
P4HB-223	ENST00000576390	TMEM94	Q12767	1356 aa		29.13	■■■□□ 2.25
P4HB-223	ENST00000576390	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	29.11	■■■□□ 2.25
P4HB-223	ENST00000576390	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		29.1	■■■□□ 2.25
P4HB-223	ENST00000576390	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		29.1	■■■□□ 2.25
P4HB-223	ENST00000576390	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		29.07	■■■□□ 2.24
P4HB-223	ENST00000576390	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
P4HB-223	ENST00000576390	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	29.03	■■■□□ 2.24
P4HB-223	ENST00000576390	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
P4HB-223	ENST00000576390	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		29.02	■■■□□ 2.24
P4HB-223	ENST00000576390	NUP155	O75694	1391 aa		29.02	■■■□□ 2.24
P4HB-223	ENST00000576390	BCAN	Q96GW7	911 aa		29	■■■□□ 2.23
P4HB-223	ENST00000576390	ITGAE	P38570	1179 aa		28.99	■■■□□ 2.23
P4HB-223	ENST00000576390	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
P4HB-223	ENST00000576390	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
P4HB-223	ENST00000576390	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		28.98	■■■□□ 2.23
P4HB-223	ENST00000576390	DIP2A	Q14689	1571 aa		28.98	■■■□□ 2.23
P4HB-223	ENST00000576390	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		28.98	■■■□□ 2.23
P4HB-223	ENST00000576390	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	28.98	■■■□□ 2.23
P4HB-223	ENST00000576390	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	28.98	■■■□□ 2.23
P4HB-223	ENST00000576390	TBX22	Q9Y458	520 aa		28.98	■■■□□ 2.23
P4HB-223	ENST00000576390	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	28.96	■■■□□ 2.23
P4HB-223	ENST00000576390	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	28.94	■■■□□ 2.22
P4HB-223	ENST00000576390	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
P4HB-223	ENST00000576390	MSH6	P52701	1360 aa		28.93	■■■□□ 2.22
P4HB-223	ENST00000576390	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		28.91	■■■□□ 2.22
P4HB-223	ENST00000576390	PIK3R4	Q99570	1358 aa		28.9	■■■□□ 2.22
P4HB-223	ENST00000576390	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
P4HB-223	ENST00000576390	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		28.87	■■■□□ 2.21
P4HB-223	ENST00000576390	TRPM2	O94759	1503 aa		28.86	■■■□□ 2.21
P4HB-223	ENST00000576390	PHLPP1	O60346	1717 aa		28.86	■■■□□ 2.21
P4HB-223	ENST00000576390	SLAIN2	Q9P270	581 aa		28.85	■■■□□ 2.21
P4HB-223	ENST00000576390	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
P4HB-223	ENST00000576390	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
P4HB-223	ENST00000576390	NAIP	Q13075	1403 aa		28.83	■■■□□ 2.21
P4HB-223	ENST00000576390	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		28.83	■■■□□ 2.21
P4HB-223	ENST00000576390	CLTCL1	P53675	1640 aa		28.82	■■■□□ 2.2
P4HB-223	ENST00000576390	PTPRU	Q92729	1446 aa		28.81	■■■□□ 2.2
P4HB-223	ENST00000576390	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
P4HB-223	ENST00000576390	KIF1B	O60333	1816 aa		28.79	■■■□□ 2.2
P4HB-223	ENST00000576390	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	28.77	■■■□□ 2.2
P4HB-223	ENST00000576390	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		28.75	■■■□□ 2.19
P4HB-223	ENST00000576390	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		28.75	■■■□□ 2.19
P4HB-223	ENST00000576390	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		28.74	■■■□□ 2.19
P4HB-223	ENST00000576390	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
P4HB-223	ENST00000576390	HFM1	A2PYH4	1435 aa		28.71	■■■□□ 2.19
P4HB-223	ENST00000576390	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		28.71	■■■□□ 2.19
P4HB-223	ENST00000576390	C14orf37	Q86TY3	774 aa		28.7	■■■□□ 2.18
P4HB-223	ENST00000576390	JCAD	Q9P266	1359 aa		28.7	■■■□□ 2.18
P4HB-223	ENST00000576390	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
P4HB-223	ENST00000576390	DCC	P43146	1447 aa		28.68	■■■□□ 2.18
P4HB-223	ENST00000576390	MET	P08581	1390 aa		28.67	■■■□□ 2.18
P4HB-223	ENST00000576390	ATF3	P18847	181 aa		28.66	■■■□□ 2.18
P4HB-223	ENST00000576390	SHPRH	Q149N8	1683 aa		28.64	■■■□□ 2.18
P4HB-223	ENST00000576390	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	28.64	■■■□□ 2.18
P4HB-223	ENST00000576390	POTEA	Q6S8J7	498 aa		28.63	■■■□□ 2.17
P4HB-223	ENST00000576390	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		28.6	■■■□□ 2.17
P4HB-223	ENST00000576390	PPL	O60437	1756 aa		28.59	■■■□□ 2.17
P4HB-223	ENST00000576390	BRINP3	Q76B58	766 aa		28.58	■■■□□ 2.17
P4HB-223	ENST00000576390	MST1R	Q04912	1400 aa		28.58	■■■□□ 2.17
P4HB-223	ENST00000576390	LRP6	O75581	1613 aa		28.58	■■■□□ 2.17
P4HB-223	ENST00000576390	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		28.58	■■■□□ 2.17
P4HB-223	ENST00000576390	TRIM52	Q96A61	297 aa		28.57	■■■□□ 2.16
P4HB-223	ENST00000576390	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		28.56	■■■□□ 2.16
P4HB-223	ENST00000576390	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		28.56	■■■□□ 2.16
P4HB-223	ENST00000576390	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		28.55	■■■□□ 2.16
P4HB-223	ENST00000576390	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	28.53	■■■□□ 2.16
P4HB-223	ENST00000576390	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		28.51	■■■□□ 2.15
P4HB-223	ENST00000576390	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	28.51	■■■□□ 2.15
P4HB-223	ENST00000576390	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		28.51	■■■□□ 2.15
P4HB-223	ENST00000576390	PTCH1	Q13635	1447 aa		28.5	■■■□□ 2.15
P4HB-223	ENST00000576390	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		28.48	■■■□□ 2.15
P4HB-223	ENST00000576390	LAMC1	P11047	1609 aa		28.44	■■■□□ 2.14
P4HB-223	ENST00000576390	IFT172	Q9UG01	1749 aa		28.43	■■■□□ 2.14
P4HB-223	ENST00000576390	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		28.43	■■■□□ 2.14
P4HB-223	ENST00000576390	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		28.4	■■■□□ 2.14
P4HB-223	ENST00000576390	FOXD1	Q16676	465 aa		28.4	■■■□□ 2.14
P4HB-223	ENST00000576390	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	28.38	■■■□□ 2.13
P4HB-223	ENST00000576390	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		28.37	■■■□□ 2.13
P4HB-223	ENST00000576390	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	28.37	■■■□□ 2.13
P4HB-223	ENST00000576390	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		28.36	■■■□□ 2.13
P4HB-223	ENST00000576390	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	28.36	■■■□□ 2.13
P4HB-223	ENST00000576390	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	28.34	■■■□□ 2.13
P4HB-223	ENST00000576390	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		28.34	■■■□□ 2.13
P4HB-223	ENST00000576390	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		28.33	■■■□□ 2.13
P4HB-223	ENST00000576390	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		28.32	■■■□□ 2.12
P4HB-223	ENST00000576390	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	28.31	■■■□□ 2.12
P4HB-223	ENST00000576390	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	28.31	■■■□□ 2.12
P4HB-223	ENST00000576390	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	28.31	■■■□□ 2.12
P4HB-223	ENST00000576390	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		28.3	■■■□□ 2.12
P4HB-223	ENST00000576390	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		28.3	■■■□□ 2.12
P4HB-223	ENST00000576390	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		28.28	■■■□□ 2.12
P4HB-223	ENST00000576390	TECPR2	O15040	1411 aa		28.27	■■■□□ 2.12
P4HB-223	ENST00000576390	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	28.27	■■■□□ 2.12
P4HB-223	ENST00000576390	ORAI2	Q96SN7	254 aa		28.27	■■■□□ 2.12
P4HB-223	ENST00000576390	RGL3	Q3MIN7	710 aa		28.25	■■■□□ 2.11
P4HB-223	ENST00000576390	PIK3C2G	O75747	1445 aa		28.25	■■■□□ 2.11
P4HB-223	ENST00000576390	AFF2	P51816	1311 aa		28.24	■■■□□ 2.11

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