RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572010.5

SLC12A4-208, Transcript of solute carrier family 12 member 4, human

TSL 1 (best)

Gene SLC12A4, Length 1,016 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC12A4-208	ENST00000572010	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
SLC12A4-208	ENST00000572010	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
SLC12A4-208	ENST00000572010	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	32.64	■■■□□ 2.82
SLC12A4-208	ENST00000572010	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	32.59	■■■□□ 2.81
SLC12A4-208	ENST00000572010	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		32.59	■■■□□ 2.81
SLC12A4-208	ENST00000572010	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		32.58	■■■□□ 2.81
SLC12A4-208	ENST00000572010	MSH6	P52701	1360 aa		32.58	■■■□□ 2.81
SLC12A4-208	ENST00000572010	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.8
SLC12A4-208	ENST00000572010	ZFYVE9	O95405	1425 aa		32.56	■■■□□ 2.8
SLC12A4-208	ENST00000572010	ROCK1	Q13464	1354 aa		32.56	■■■□□ 2.8
SLC12A4-208	ENST00000572010	TBX22	Q9Y458	520 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SLC12A4-208	ENST00000572010	ITGAE	P38570	1179 aa		32.54	■■■□□ 2.8
SLC12A4-208	ENST00000572010	SLAIN2	Q9P270	581 aa		32.53	■■■□□ 2.8
SLC12A4-208	ENST00000572010	NWD1	Q149M9	1564 aa		32.51	■■■□□ 2.79
SLC12A4-208	ENST00000572010	UNC13B	O14795	1591 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SLC12A4-208	ENST00000572010	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SLC12A4-208	ENST00000572010	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SLC12A4-208	ENST00000572010	NUP155	O75694	1391 aa		32.49	■■■□□ 2.79
SLC12A4-208	ENST00000572010	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
SLC12A4-208	ENST00000572010	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
SLC12A4-208	ENST00000572010	C14orf37	Q86TY3	774 aa		32.48	■■■□□ 2.79
SLC12A4-208	ENST00000572010	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		32.46	■■■□□ 2.79
SLC12A4-208	ENST00000572010	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		32.45	■■■□□ 2.79
SLC12A4-208	ENST00000572010	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
SLC12A4-208	ENST00000572010		E9PCH4	1651 aa		32.42	■■■□□ 2.78
SLC12A4-208	ENST00000572010	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
SLC12A4-208	ENST00000572010	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		32.41	■■■□□ 2.78
SLC12A4-208	ENST00000572010	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		32.39	■■■□□ 2.78
SLC12A4-208	ENST00000572010	PIK3R4	Q99570	1358 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SLC12A4-208	ENST00000572010	ATF3	P18847	181 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SLC12A4-208	ENST00000572010	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SLC12A4-208	ENST00000572010	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SLC12A4-208	ENST00000572010	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SLC12A4-208	ENST00000572010	POTEA	Q6S8J7	498 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SLC12A4-208	ENST00000572010	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SLC12A4-208	ENST00000572010	JCAD	Q9P266	1359 aa		32.32	■■■□□ 2.77
SLC12A4-208	ENST00000572010	DIP2A	Q14689	1571 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SLC12A4-208	ENST00000572010	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	32.3	■■■□□ 2.76
SLC12A4-208	ENST00000572010	PHLPP1	O60346	1717 aa		32.29	■■■□□ 2.76
SLC12A4-208	ENST00000572010	TRPM2	O94759	1503 aa		32.26	■■■□□ 2.75
SLC12A4-208	ENST00000572010	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	32.19	■■■□□ 2.74
SLC12A4-208	ENST00000572010	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		32.19	■■■□□ 2.74
SLC12A4-208	ENST00000572010	PTPRU	Q92729	1446 aa		32.18	■■■□□ 2.74
SLC12A4-208	ENST00000572010	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
SLC12A4-208	ENST00000572010	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	32.15	■■■□□ 2.74
SLC12A4-208	ENST00000572010	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		32.13	■■■□□ 2.73
SLC12A4-208	ENST00000572010	BRINP3	Q76B58	766 aa		32.13	■■■□□ 2.73
SLC12A4-208	ENST00000572010	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		32.11	■■■□□ 2.73
SLC12A4-208	ENST00000572010	MET	P08581	1390 aa		32.09	■■■□□ 2.73
SLC12A4-208	ENST00000572010	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	32.09	■■■□□ 2.73
SLC12A4-208	ENST00000572010	TRIM52	Q96A61	297 aa		32.09	■■■□□ 2.73
SLC12A4-208	ENST00000572010	DCC	P43146	1447 aa		32.09	■■■□□ 2.73
SLC12A4-208	ENST00000572010	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	32.08	■■■□□ 2.73
SLC12A4-208	ENST00000572010	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
SLC12A4-208	ENST00000572010	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		32.05	■■■□□ 2.72
SLC12A4-208	ENST00000572010	NAIP	Q13075	1403 aa		32.04	■■■□□ 2.72
SLC12A4-208	ENST00000572010	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	32.04	■■■□□ 2.72
SLC12A4-208	ENST00000572010	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	32.04	■■■□□ 2.72
SLC12A4-208	ENST00000572010	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	32.04	■■■□□ 2.72
SLC12A4-208	ENST00000572010	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	32.03	■■■□□ 2.72
SLC12A4-208	ENST00000572010	LRP6	O75581	1613 aa		32.02	■■■□□ 2.72
SLC12A4-208	ENST00000572010	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.72
SLC12A4-208	ENST00000572010	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	32	■■■□□ 2.71
SLC12A4-208	ENST00000572010	CLTCL1	P53675	1640 aa		32	■■■□□ 2.71
SLC12A4-208	ENST00000572010	MST1R	Q04912	1400 aa		31.99	■■■□□ 2.71
SLC12A4-208	ENST00000572010	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		31.98	■■■□□ 2.71
SLC12A4-208	ENST00000572010	SHPRH	Q149N8	1683 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SLC12A4-208	ENST00000572010	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	31.97	■■■□□ 2.71
SLC12A4-208	ENST00000572010	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		31.96	■■■□□ 2.71
SLC12A4-208	ENST00000572010	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		31.95	■■■□□ 2.71
SLC12A4-208	ENST00000572010	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		31.95	■■■□□ 2.7
SLC12A4-208	ENST00000572010	KIF1B	O60333	1816 aa		31.94	■■■□□ 2.7
SLC12A4-208	ENST00000572010	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		31.93	■■■□□ 2.7
SLC12A4-208	ENST00000572010	RXRB	P28702	533 aa		31.93	■■■□□ 2.7
SLC12A4-208	ENST00000572010	HFM1	A2PYH4	1435 aa		31.9	■■■□□ 2.7
SLC12A4-208	ENST00000572010	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	31.89	■■■□□ 2.7
SLC12A4-208	ENST00000572010	AFF2	P51816	1311 aa		31.86	■■■□□ 2.69
SLC12A4-208	ENST00000572010	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	31.86	■■■□□ 2.69
SLC12A4-208	ENST00000572010	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SLC12A4-208	ENST00000572010	C8orf37	Q96NL8	207 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SLC12A4-208	ENST00000572010	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SLC12A4-208	ENST00000572010	PTCH1	Q13635	1447 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SLC12A4-208	ENST00000572010	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SLC12A4-208	ENST00000572010	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	31.8	■■■□□ 2.68
SLC12A4-208	ENST00000572010	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		31.8	■■■□□ 2.68
SLC12A4-208	ENST00000572010	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		31.8	■■■□□ 2.68
SLC12A4-208	ENST00000572010	ORAI2	Q96SN7	254 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SLC12A4-208	ENST00000572010	FOXD1	Q16676	465 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SLC12A4-208	ENST00000572010	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
SLC12A4-208	ENST00000572010	NGLY1	Q96IV0	654 aa		31.76	■■■□□ 2.67
SLC12A4-208	ENST00000572010	ADAMTS2	O95450	1211 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SLC12A4-208	ENST00000572010	RGL3	Q3MIN7	710 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SLC12A4-208	ENST00000572010	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	31.73	■■■□□ 2.67
SLC12A4-208	ENST00000572010	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	31.72	■■■□□ 2.67
SLC12A4-208	ENST00000572010	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	31.72	■■■□□ 2.67
SLC12A4-208	ENST00000572010	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SLC12A4-208	ENST00000572010	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SLC12A4-208	ENST00000572010	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		31.68	■■■□□ 2.66
SLC12A4-208	ENST00000572010	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		31.68	■■■□□ 2.66
SLC12A4-208	ENST00000572010	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		31.68	■■■□□ 2.66

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