RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568316.1

RBBP6-211, Transcript of RB binding protein 6, ubiquitin ligase, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP6, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6-211ENST00000568316 RGL3Q3MIN7 710 aa36.21■■■■□ 3.39
RBBP6-211ENST00000568316 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
RBBP6-211ENST00000568316 EID1Q9Y6B2 187 aa36.21■■■■□ 3.39
RBBP6-211ENST00000568316 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP36.19■■■■□ 3.38
RBBP6-211ENST00000568316 SIN3AQ96ST3 1273 aa36.18■■■■□ 3.38
RBBP6-211ENST00000568316 NEURL4Q96JN8 1562 aa36.17■■■■□ 3.38
RBBP6-211ENST00000568316 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa36.15■■■■□ 3.38
RBBP6-211ENST00000568316 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
RBBP6-211ENST00000568316 HDGFP51858 240 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
RBBP6-211ENST00000568316 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP36.13■■■■□ 3.37
RBBP6-211ENST00000568316 NEUROD1Q13562 356 aa36.12■■■■□ 3.37
RBBP6-211ENST00000568316 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
RBBP6-211ENST00000568316 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
RBBP6-211ENST00000568316 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa36.09■■■■□ 3.37
RBBP6-211ENST00000568316 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
RBBP6-211ENST00000568316 MED14O60244 1454 aa36.09■■■■□ 3.37
RBBP6-211ENST00000568316 PPLO60437 1756 aa36.07■■■■□ 3.36
RBBP6-211ENST00000568316 IQGAP1P46940 1657 aa36.06■■■■□ 3.36
RBBP6-211ENST00000568316 DMRT2Q9Y5R5 561 aa36.05■■■■□ 3.36
RBBP6-211ENST00000568316 BCANQ96GW7 911 aa36.04■■■■□ 3.36
RBBP6-211ENST00000568316 IFT172Q9UG01 1749 aa36.03■■■■□ 3.36
RBBP6-211ENST00000568316 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa36.02■■■■□ 3.36
RBBP6-211ENST00000568316 VGFO15240 615 aaPredicted RBP36■■■■□ 3.35
RBBP6-211ENST00000568316 DCAF11Q8TEB1 546 aa35.96■■■■□ 3.35
RBBP6-211ENST00000568316 CLSPNQ9HAW4 1339 aa35.96■■■■□ 3.35
RBBP6-211ENST00000568316 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa35.95■■■■□ 3.35
RBBP6-211ENST00000568316 SLC26A8Q96RN1 970 aa35.95■■■■□ 3.35
RBBP6-211ENST00000568316 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa35.95■■■■□ 3.35
RBBP6-211ENST00000568316 MYOM2P54296 1465 aa35.92■■■■□ 3.34
RBBP6-211ENST00000568316 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa35.9■■■■□ 3.34
RBBP6-211ENST00000568316 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa35.9■■■■□ 3.34
RBBP6-211ENST00000568316 L3MBTL2Q969R5 705 aa35.9■■■■□ 3.34
RBBP6-211ENST00000568316 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa35.9■■■■□ 3.34
RBBP6-211ENST00000568316 TONSLQ96HA7 1378 aa35.87■■■■□ 3.33
RBBP6-211ENST00000568316 NRXN1Q9ULB1 1477 aa35.84■■■■□ 3.33
RBBP6-211ENST00000568316 PIK3C2GO75747 1445 aa35.83■■■■□ 3.33
RBBP6-211ENST00000568316 DIP2AQ14689 1571 aa35.83■■■■□ 3.33
RBBP6-211ENST00000568316 TBX22Q9Y458 520 aa35.82■■■■□ 3.32
RBBP6-211ENST00000568316 FBXO41Q8TF61 875 aa35.81■■■■□ 3.32
RBBP6-211ENST00000568316 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.81■■■■□ 3.32
RBBP6-211ENST00000568316 STAC3Q96MF2 364 aa35.8■■■■□ 3.32
RBBP6-211ENST00000568316 ALKQ9UM73 1620 aa35.79■■■■□ 3.32
RBBP6-211ENST00000568316 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
RBBP6-211ENST00000568316 METP08581 1390 aa35.74■■■■□ 3.31
RBBP6-211ENST00000568316 CFAP70Q5T0N1 1121 aa35.72■■■■□ 3.31
RBBP6-211ENST00000568316 PRAG1Q86YV5 1406 aa35.72■■■■□ 3.31
RBBP6-211ENST00000568316 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
RBBP6-211ENST00000568316 PIK3R4Q99570 1358 aa35.68■■■■□ 3.3
RBBP6-211ENST00000568316 STRCP1A6NGW2 1772 aa35.68■■■■□ 3.3
RBBP6-211ENST00000568316 LAMC1P11047 1609 aa35.68■■■■□ 3.3
RBBP6-211ENST00000568316 KCNA6P17658 529 aa35.67■■■■□ 3.3
RBBP6-211ENST00000568316 PTPRUQ92729 1446 aa35.66■■■■□ 3.3
RBBP6-211ENST00000568316 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa35.66■■■■□ 3.3
RBBP6-211ENST00000568316 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.65■■■■□ 3.3
RBBP6-211ENST00000568316 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
RBBP6-211ENST00000568316 TMEM132EQ6IEE7 984 aa35.65■■■■□ 3.3
RBBP6-211ENST00000568316 NWD1Q149M9 1564 aa35.64■■■■□ 3.3
RBBP6-211ENST00000568316 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa35.61■■■■□ 3.29
RBBP6-211ENST00000568316 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa35.61■■■■□ 3.29
RBBP6-211ENST00000568316 NBPF8Q3BBV2 869 aa35.6■■■■□ 3.29
RBBP6-211ENST00000568316 CPS1P31327 1500 aa35.59■■■■□ 3.29
RBBP6-211ENST00000568316 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
RBBP6-211ENST00000568316 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
RBBP6-211ENST00000568316 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa35.56■■■■□ 3.28
RBBP6-211ENST00000568316 ADGRB1O14514 1584 aa35.55■■■■□ 3.28
RBBP6-211ENST00000568316 STK26Q9P289 416 aa35.55■■■■□ 3.28
RBBP6-211ENST00000568316 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
RBBP6-211ENST00000568316 NBPF1Q3BBV0 1214 aa35.53■■■■□ 3.28
RBBP6-211ENST00000568316 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
RBBP6-211ENST00000568316 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa35.53■■■■□ 3.28
RBBP6-211ENST00000568316 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP35.51■■■■□ 3.28
RBBP6-211ENST00000568316 LRRC7Q96NW7 1537 aa35.51■■■■□ 3.27
RBBP6-211ENST00000568316 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
RBBP6-211ENST00000568316 ABCC11Q96J66 1382 aa35.46■■■■□ 3.27
RBBP6-211ENST00000568316 ROBO2Q9HCK4 1378 aa35.46■■■■□ 3.27
RBBP6-211ENST00000568316 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP35.45■■■■□ 3.27
RBBP6-211ENST00000568316 TMEM94Q12767 1356 aa35.45■■■■□ 3.27
RBBP6-211ENST00000568316 KNDC1Q76NI1 1749 aa35.44■■■■□ 3.26
RBBP6-211ENST00000568316 TECPR2O15040 1411 aa35.44■■■■□ 3.26
RBBP6-211ENST00000568316 PTCH1Q13635 1447 aa35.44■■■■□ 3.26
RBBP6-211ENST00000568316 CERKQ8TCT0 537 aa35.44■■■■□ 3.26
RBBP6-211ENST00000568316 RALGAPBQ86X10 1494 aa35.43■■■■□ 3.26
RBBP6-211ENST00000568316 TRAK1Q9UPV9 953 aa35.42■■■■□ 3.26
RBBP6-211ENST00000568316 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
RBBP6-211ENST00000568316 WAPLQ7Z5K2 1190 aa35.36■■■■□ 3.25
RBBP6-211ENST00000568316 C14orf37Q86TY3 774 aa35.36■■■■□ 3.25
RBBP6-211ENST00000568316 DLC1Q96QB1 1528 aa35.35■■■■□ 3.25
RBBP6-211ENST00000568316 GPRASP1Q5JY77 1395 aa35.35■■■■□ 3.25
RBBP6-211ENST00000568316 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa35.35■■■■□ 3.25
RBBP6-211ENST00000568316 FAM135BQ49AJ0 1406 aa35.32■■■■□ 3.25
RBBP6-211ENST00000568316 PRAM1Q96QH2 718 aa35.32■■■■□ 3.24
RBBP6-211ENST00000568316 CARD11Q9BXL7 1154 aa35.32■■■■□ 3.24
RBBP6-211ENST00000568316 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
RBBP6-211ENST00000568316 IQSEC2Q5JU85 1478 aa35.3■■■■□ 3.24
RBBP6-211ENST00000568316 SIRT1Q96EB6 747 aa35.3■■■■□ 3.24
RBBP6-211ENST00000568316 POGKQ9P215 609 aa35.3■■■■□ 3.24
RBBP6-211ENST00000568316 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa35.3■■■■□ 3.24
RBBP6-211ENST00000568316 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP35.29■■■■□ 3.24
RBBP6-211ENST00000568316 MSH6P52701 1360 aa35.26■■■■□ 3.24
RBBP6-211ENST00000568316 NALCNQ8IZF0 1738 aa35.26■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.1 ms