RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567264.1

UBFD1-208, Transcript of ubiquitin family domain containing 1, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene UBFD1, Length 642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBFD1-208	ENST00000567264	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		32.89	■■■□□ 2.86
UBFD1-208	ENST00000567264	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		32.88	■■■□□ 2.85
UBFD1-208	ENST00000567264	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	32.87	■■■□□ 2.85
UBFD1-208	ENST00000567264	ZFYVE9	O95405	1425 aa		32.86	■■■□□ 2.85
UBFD1-208	ENST00000567264	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		32.86	■■■□□ 2.85
UBFD1-208	ENST00000567264	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		32.84	■■■□□ 2.85
UBFD1-208	ENST00000567264	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	32.84	■■■□□ 2.85
UBFD1-208	ENST00000567264	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
UBFD1-208	ENST00000567264	LTK	P29376	864 aa		32.81	■■■□□ 2.84
UBFD1-208	ENST00000567264	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	32.81	■■■□□ 2.84
UBFD1-208	ENST00000567264	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		32.8	■■■□□ 2.84
UBFD1-208	ENST00000567264	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	32.8	■■■□□ 2.84
UBFD1-208	ENST00000567264	TONSL	Q96HA7	1378 aa		32.8	■■■□□ 2.84
UBFD1-208	ENST00000567264	PPL	O60437	1756 aa		32.79	■■■□□ 2.84
UBFD1-208	ENST00000567264	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
UBFD1-208	ENST00000567264	IFT172	Q9UG01	1749 aa		32.77	■■■□□ 2.84
UBFD1-208	ENST00000567264	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		32.76	■■■□□ 2.83
UBFD1-208	ENST00000567264	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		32.74	■■■□□ 2.83
UBFD1-208	ENST00000567264	STRC	Q7RTU9	1775 aa		32.73	■■■□□ 2.83
UBFD1-208	ENST00000567264	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	32.72	■■■□□ 2.83
UBFD1-208	ENST00000567264	BCAN	Q96GW7	911 aa		32.72	■■■□□ 2.83
UBFD1-208	ENST00000567264	STAC3	Q96MF2	364 aa		32.72	■■■□□ 2.83
UBFD1-208	ENST00000567264	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		32.72	■■■□□ 2.83
UBFD1-208	ENST00000567264	MYOM2	P54296	1465 aa		32.72	■■■□□ 2.83
UBFD1-208	ENST00000567264	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		32.71	■■■□□ 2.83
UBFD1-208	ENST00000567264	MED14	O60244	1454 aa		32.71	■■■□□ 2.83
UBFD1-208	ENST00000567264	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	32.67	■■■□□ 2.82
UBFD1-208	ENST00000567264	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		32.67	■■■□□ 2.82
UBFD1-208	ENST00000567264	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		32.67	■■■□□ 2.82
UBFD1-208	ENST00000567264	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		32.67	■■■□□ 2.82
UBFD1-208	ENST00000567264	IQGAP1	P46940	1657 aa		32.66	■■■□□ 2.82
UBFD1-208	ENST00000567264	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		32.62	■■■□□ 2.81
UBFD1-208	ENST00000567264	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		32.61	■■■□□ 2.81
UBFD1-208	ENST00000567264	PIK3C2G	O75747	1445 aa		32.6	■■■□□ 2.81
UBFD1-208	ENST00000567264	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		32.58	■■■□□ 2.81
UBFD1-208	ENST00000567264	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		32.57	■■■□□ 2.8
UBFD1-208	ENST00000567264	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		32.56	■■■□□ 2.8
UBFD1-208	ENST00000567264	DIP2A	Q14689	1571 aa		32.55	■■■□□ 2.8
UBFD1-208	ENST00000567264	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		32.55	■■■□□ 2.8
UBFD1-208	ENST00000567264	TBX22	Q9Y458	520 aa		32.54	■■■□□ 2.8
UBFD1-208	ENST00000567264	ALK	Q9UM73	1620 aa		32.51	■■■□□ 2.8
UBFD1-208	ENST00000567264	LAMC1	P11047	1609 aa		32.5	■■■□□ 2.79
UBFD1-208	ENST00000567264	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
UBFD1-208	ENST00000567264	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		32.48	■■■□□ 2.79
UBFD1-208	ENST00000567264	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.78
UBFD1-208	ENST00000567264	PIK3R4	Q99570	1358 aa		32.44	■■■□□ 2.78
UBFD1-208	ENST00000567264	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		32.43	■■■□□ 2.78
UBFD1-208	ENST00000567264	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		32.43	■■■□□ 2.78
UBFD1-208	ENST00000567264	MET	P08581	1390 aa		32.42	■■■□□ 2.78
UBFD1-208	ENST00000567264	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		32.38	■■■□□ 2.77
UBFD1-208	ENST00000567264	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		32.38	■■■□□ 2.77
UBFD1-208	ENST00000567264	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		32.36	■■■□□ 2.77
UBFD1-208	ENST00000567264	KCNA6	P17658	529 aa		32.35	■■■□□ 2.77
UBFD1-208	ENST00000567264	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	32.34	■■■□□ 2.77
UBFD1-208	ENST00000567264	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
UBFD1-208	ENST00000567264	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		32.34	■■■□□ 2.77
UBFD1-208	ENST00000567264	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
UBFD1-208	ENST00000567264	ADGRB1	O14514	1584 aa		32.33	■■■□□ 2.77
UBFD1-208	ENST00000567264	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		32.33	■■■□□ 2.77
UBFD1-208	ENST00000567264	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		32.33	■■■□□ 2.77
UBFD1-208	ENST00000567264	PTPRU	Q92729	1446 aa		32.33	■■■□□ 2.77
UBFD1-208	ENST00000567264	NWD1	Q149M9	1564 aa		32.32	■■■□□ 2.76
UBFD1-208	ENST00000567264	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
UBFD1-208	ENST00000567264	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
UBFD1-208	ENST00000567264	STK26	Q9P289	416 aa		32.3	■■■□□ 2.76
UBFD1-208	ENST00000567264	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
UBFD1-208	ENST00000567264	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	32.28	■■■□□ 2.76
UBFD1-208	ENST00000567264	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.75
UBFD1-208	ENST00000567264	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		32.25	■■■□□ 2.75
UBFD1-208	ENST00000567264	ABCC11	Q96J66	1382 aa		32.25	■■■□□ 2.75
UBFD1-208	ENST00000567264	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		32.24	■■■□□ 2.75
UBFD1-208	ENST00000567264	CPS1	P31327	1500 aa		32.24	■■■□□ 2.75
UBFD1-208	ENST00000567264	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		32.23	■■■□□ 2.75
UBFD1-208	ENST00000567264	TECPR2	O15040	1411 aa		32.23	■■■□□ 2.75
UBFD1-208	ENST00000567264	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		32.23	■■■□□ 2.75
UBFD1-208	ENST00000567264	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		32.22	■■■□□ 2.75
UBFD1-208	ENST00000567264	PTCH1	Q13635	1447 aa		32.21	■■■□□ 2.75
UBFD1-208	ENST00000567264	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		32.19	■■■□□ 2.74
UBFD1-208	ENST00000567264	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	32.19	■■■□□ 2.74
UBFD1-208	ENST00000567264	DLC1	Q96QB1	1528 aa		32.18	■■■□□ 2.74
UBFD1-208	ENST00000567264	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		32.18	■■■□□ 2.74
UBFD1-208	ENST00000567264	SIRT1	Q96EB6	747 aa		32.15	■■■□□ 2.74
UBFD1-208	ENST00000567264	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		32.14	■■■□□ 2.74
UBFD1-208	ENST00000567264	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		32.13	■■■□□ 2.73
UBFD1-208	ENST00000567264	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
UBFD1-208	ENST00000567264	POGK	Q9P215	609 aa		32.12	■■■□□ 2.73
UBFD1-208	ENST00000567264	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
UBFD1-208	ENST00000567264	TMEM94	Q12767	1356 aa		32.11	■■■□□ 2.73
UBFD1-208	ENST00000567264	PRAM1	Q96QH2	718 aa		32.11	■■■□□ 2.73
UBFD1-208	ENST00000567264	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		32.1	■■■□□ 2.73
UBFD1-208	ENST00000567264	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
UBFD1-208	ENST00000567264	C14orf37	Q86TY3	774 aa		32.08	■■■□□ 2.73
UBFD1-208	ENST00000567264	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		32.07	■■■□□ 2.73
UBFD1-208	ENST00000567264	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		32.06	■■■□□ 2.72
UBFD1-208	ENST00000567264	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	32.05	■■■□□ 2.72
UBFD1-208	ENST00000567264	USP47	Q96K76	1375 aa		32.05	■■■□□ 2.72
UBFD1-208	ENST00000567264	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	32.04	■■■□□ 2.72
UBFD1-208	ENST00000567264	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	32	■■■□□ 2.71
UBFD1-208	ENST00000567264	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		32	■■■□□ 2.71
UBFD1-208	ENST00000567264	MSH6	P52701	1360 aa		31.98	■■■□□ 2.71

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