RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561293.5

MEIS3-212, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene MEIS3, Length 1,918 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-212ENST00000561293 ZFYVE9O95405 1425 aa30.83■■■□□ 2.53
MEIS3-212ENST00000561293 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa30.83■■■□□ 2.53
MEIS3-212ENST00000561293 ARHGAP23Q9P227 1491 aa30.82■■■□□ 2.52
MEIS3-212ENST00000561293 STRCQ7RTU9 1775 aa30.82■■■□□ 2.52
MEIS3-212ENST00000561293 SLIT1O75093 1534 aa30.81■■■□□ 2.52
MEIS3-212ENST00000561293 EID1Q9Y6B2 187 aa30.81■■■□□ 2.52
MEIS3-212ENST00000561293 BCANQ96GW7 911 aa30.8■■■□□ 2.52
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MEIS3-212ENST00000561293 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa30.78■■■□□ 2.52
MEIS3-212ENST00000561293 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
MEIS3-212ENST00000561293 DCAF11Q8TEB1 546 aa30.78■■■□□ 2.52
MEIS3-212ENST00000561293 NEURL4Q96JN8 1562 aa30.77■■■□□ 2.52
MEIS3-212ENST00000561293 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa30.76■■■□□ 2.52
MEIS3-212ENST00000561293 SLC26A8Q96RN1 970 aa30.75■■■□□ 2.51
MEIS3-212ENST00000561293 L3MBTL2Q969R5 705 aa30.74■■■□□ 2.51
MEIS3-212ENST00000561293 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.51
MEIS3-212ENST00000561293 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.51
MEIS3-212ENST00000561293 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP30.68■■■□□ 2.5
MEIS3-212ENST00000561293 PPLO60437 1756 aa30.67■■■□□ 2.5
MEIS3-212ENST00000561293 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa30.66■■■□□ 2.5
MEIS3-212ENST00000561293 VGFO15240 615 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
MEIS3-212ENST00000561293 HDGFP51858 240 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
MEIS3-212ENST00000561293 TONSLQ96HA7 1378 aa30.64■■■□□ 2.5
MEIS3-212ENST00000561293 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa30.63■■■□□ 2.49
MEIS3-212ENST00000561293 IFT172Q9UG01 1749 aa30.62■■■□□ 2.49
MEIS3-212ENST00000561293 MED14O60244 1454 aa30.62■■■□□ 2.49
MEIS3-212ENST00000561293 IQGAP1P46940 1657 aa30.62■■■□□ 2.49
MEIS3-212ENST00000561293 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa30.59■■■□□ 2.49
MEIS3-212ENST00000561293 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
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MEIS3-212ENST00000561293 CFAP70Q5T0N1 1121 aa30.57■■■□□ 2.48
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MEIS3-212ENST00000561293 TMEM132EQ6IEE7 984 aa30.55■■■□□ 2.48
MEIS3-212ENST00000561293 PIK3C2GO75747 1445 aa30.54■■■□□ 2.48
MEIS3-212ENST00000561293 METP08581 1390 aa30.54■■■□□ 2.48
MEIS3-212ENST00000561293 DMRT2Q9Y5R5 561 aa30.53■■■□□ 2.48
MEIS3-212ENST00000561293 MYOM2P54296 1465 aa30.53■■■□□ 2.48
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MEIS3-212ENST00000561293 NRXN1Q9ULB1 1477 aa30.49■■■□□ 2.47
MEIS3-212ENST00000561293 ALKQ9UM73 1620 aa30.48■■■□□ 2.47
MEIS3-212ENST00000561293 NBPF1Q3BBV0 1214 aa30.47■■■□□ 2.47
MEIS3-212ENST00000561293 PRAG1Q86YV5 1406 aa30.47■■■□□ 2.47
MEIS3-212ENST00000561293 STK26Q9P289 416 aa30.45■■■□□ 2.47
MEIS3-212ENST00000561293 TBX22Q9Y458 520 aa30.45■■■□□ 2.47
MEIS3-212ENST00000561293 PTPRUQ92729 1446 aa30.45■■■□□ 2.46
MEIS3-212ENST00000561293 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
MEIS3-212ENST00000561293 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa30.42■■■□□ 2.46
MEIS3-212ENST00000561293 KCNA6P17658 529 aa30.41■■■□□ 2.46
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MEIS3-212ENST00000561293 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa30.4■■■□□ 2.46
MEIS3-212ENST00000561293 STRCP1A6NGW2 1772 aa30.39■■■□□ 2.46
MEIS3-212ENST00000561293 DIP2AQ14689 1571 aa30.34■■■□□ 2.45
MEIS3-212ENST00000561293 STAC3Q96MF2 364 aa30.33■■■□□ 2.45
MEIS3-212ENST00000561293 TRAK1Q9UPV9 953 aa30.32■■■□□ 2.44
MEIS3-212ENST00000561293 ADGRB1O14514 1584 aa30.3■■■□□ 2.44
MEIS3-212ENST00000561293 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP30.3■■■□□ 2.44
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MEIS3-212ENST00000561293 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
MEIS3-212ENST00000561293 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
MEIS3-212ENST00000561293 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
MEIS3-212ENST00000561293 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa30.27■■■□□ 2.44
MEIS3-212ENST00000561293 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa30.26■■■□□ 2.43
MEIS3-212ENST00000561293 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa30.25■■■□□ 2.43
MEIS3-212ENST00000561293 PIK3R4Q99570 1358 aa30.24■■■□□ 2.43
MEIS3-212ENST00000561293 LAMC1P11047 1609 aa30.24■■■□□ 2.43
MEIS3-212ENST00000561293 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
MEIS3-212ENST00000561293 TMEM94Q12767 1356 aa30.23■■■□□ 2.43
MEIS3-212ENST00000561293 NWD1Q149M9 1564 aa30.22■■■□□ 2.43
MEIS3-212ENST00000561293 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
MEIS3-212ENST00000561293 LRRC7Q96NW7 1537 aa30.21■■■□□ 2.43
MEIS3-212ENST00000561293 CARD11Q9BXL7 1154 aa30.21■■■□□ 2.43
MEIS3-212ENST00000561293 PRAM1Q96QH2 718 aa30.2■■■□□ 2.42
MEIS3-212ENST00000561293 RALGAPBQ86X10 1494 aa30.18■■■□□ 2.42
MEIS3-212ENST00000561293 C14orf37Q86TY3 774 aa30.18■■■□□ 2.42
MEIS3-212ENST00000561293 ABCC11Q96J66 1382 aa30.17■■■□□ 2.42
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MEIS3-212ENST00000561293 CPS1P31327 1500 aa30.14■■■□□ 2.41
MEIS3-212ENST00000561293 CERKQ8TCT0 537 aa30.13■■■□□ 2.41
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MEIS3-212ENST00000561293 TECPR2O15040 1411 aa30.11■■■□□ 2.41
MEIS3-212ENST00000561293 PTCH1Q13635 1447 aa30.11■■■□□ 2.41
MEIS3-212ENST00000561293 GPRASP1Q5JY77 1395 aa30.1■■■□□ 2.41
MEIS3-212ENST00000561293 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
MEIS3-212ENST00000561293 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
MEIS3-212ENST00000561293 NUTM2FA1L443 756 aa30.07■■■□□ 2.4
MEIS3-212ENST00000561293 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
MEIS3-212ENST00000561293 KNDC1Q76NI1 1749 aa30.05■■■□□ 2.4
MEIS3-212ENST00000561293 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
MEIS3-212ENST00000561293 NALCNQ8IZF0 1738 aa30.01■■■□□ 2.4
MEIS3-212ENST00000561293 FAM135BQ49AJ0 1406 aa30.01■■■□□ 2.39
MEIS3-212ENST00000561293 USP47Q96K76 1375 aa30.01■■■□□ 2.39
MEIS3-212ENST00000561293 DLC1Q96QB1 1528 aa30.01■■■□□ 2.39
MEIS3-212ENST00000561293 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa30■■■□□ 2.39
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