RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560650.1

CPEB1-AS1-201, CPEB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CPEB1-AS1, Length 2,138 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.83■■■□□ 2.21
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.83■■■□□ 2.21
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.8■■■□□ 2.2
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.8■■■□□ 2.2
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.78■■■□□ 2.2
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SYNMO15061 1565 aa28.77■■■□□ 2.2
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 REREQ9P2R6 1566 aa28.77■■■□□ 2.2
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 PIK3C2BO00750 1634 aa28.76■■■□□ 2.19
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP28.75■■■□□ 2.19
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 AGLP35573 1532 aa28.73■■■□□ 2.19
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 PPLO60437 1756 aa28.73■■■□□ 2.19
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 FAM9BQ8IZU0 186 aa28.73■■■□□ 2.19
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.71■■■□□ 2.19
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.7■■■□□ 2.19
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 IDI1Q13907 227 aa28.7■■■□□ 2.18
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 RALBP1Q15311 655 aa28.69■■■□□ 2.18
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 CDCA8Q53HL2 280 aa28.69■■■□□ 2.18
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 PIK3C2GO75747 1445 aa28.68■■■□□ 2.18
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.66■■■□□ 2.18
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 PANK3Q9H999 370 aa28.66■■■□□ 2.18
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.65■■■□□ 2.18
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SLC24A1O60721 1099 aa28.64■■■□□ 2.18
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.62■■■□□ 2.17
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.6■■■□□ 2.17
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 TMC1Q8TDI8 760 aa28.6■■■□□ 2.17
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 PARD3Q8TEW0 1356 aa28.59■■■□□ 2.17
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ERVK-7P63135 1459 aa28.58■■■□□ 2.17
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 MLECQ14165 292 aa28.57■■■□□ 2.16
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ADGRB1O14514 1584 aa28.56■■■□□ 2.16
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.54■■■□□ 2.16
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.54■■■□□ 2.16
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ZFYVE9O95405 1425 aa28.53■■■□□ 2.16
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.53■■■□□ 2.16
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.53■■■□□ 2.16
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa28.52■■■□□ 2.16
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.51■■■□□ 2.15
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ZBED9Q6R2W3 1325 aa28.5■■■□□ 2.15
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 NLRP13Q86W25 1043 aa28.5■■■□□ 2.15
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 KNSTRNQ9Y448 316 aa28.48■■■□□ 2.15
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 MYOM1P52179 1685 aa28.46■■■□□ 2.15
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.46■■■□□ 2.15
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.45■■■□□ 2.15
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.15
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 QRICH2Q9H0J4 1663 aa28.4■■■□□ 2.14
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ZMYM3Q14202 1370 aa28.4■■■□□ 2.14
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 NEFLP07196 543 aa28.37■■■□□ 2.13
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.37■■■□□ 2.13
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 FKBP8Q14318 412 aa28.36■■■□□ 2.13
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.35■■■□□ 2.13
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa28.34■■■□□ 2.13
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 STK26Q9P289 416 aa28.3■■■□□ 2.12
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 EVC2Q86UK5 1308 aa28.28■■■□□ 2.12
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 CARD14Q9BXL6 1004 aa28.28■■■□□ 2.12
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.28■■■□□ 2.12
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 PPP2R1AP30153 589 aa28.27■■■□□ 2.12
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ALKQ9UM73 1620 aa28.27■■■□□ 2.12
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa28.24■■■□□ 2.11
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 TNRQ92752 1358 aa28.23■■■□□ 2.11
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.22■■■□□ 2.11
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.22■■■□□ 2.11
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 PTPRMP28827 1452 aa28.21■■■□□ 2.11
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa28.2■■■□□ 2.1
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.2■■■□□ 2.1
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 INSRP06213 1382 aa28.2■■■□□ 2.1
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 PRAM1Q96QH2 718 aa28.19■■■□□ 2.1
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 POGKQ9P215 609 aa28.18■■■□□ 2.1
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 BCANQ96GW7 911 aa28.18■■■□□ 2.1
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 CABP2Q9NPB3 220 aa28.16■■■□□ 2.1
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 NSD3Q9BZ95 1437 aa28.16■■■□□ 2.1
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 NUDCQ9Y266 331 aa28.15■■■□□ 2.1
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.9 ms