RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559737.5

USP3-AS1-203, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3-AS1, Length 1,434 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLIT1O75093 1534 aa26.99■■□□□ 1.91
USP3-AS1-203ENST00000559737 PPLO60437 1756 aa26.99■■□□□ 1.91
USP3-AS1-203ENST00000559737 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
USP3-AS1-203ENST00000559737 IFT172Q9UG01 1749 aa26.98■■□□□ 1.91
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZFYVE9O95405 1425 aa26.98■■□□□ 1.91
USP3-AS1-203ENST00000559737 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.97■■□□□ 1.91
USP3-AS1-203ENST00000559737 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.97■■□□□ 1.91
USP3-AS1-203ENST00000559737 LTKP29376 864 aa26.95■■□□□ 1.9
USP3-AS1-203ENST00000559737 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.94■■□□□ 1.9
USP3-AS1-203ENST00000559737 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.92■■□□□ 1.9
USP3-AS1-203ENST00000559737 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.9■■□□□ 1.9
USP3-AS1-203ENST00000559737 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.9■■□□□ 1.9
USP3-AS1-203ENST00000559737 EID1Q9Y6B2 187 aa26.9■■□□□ 1.9
USP3-AS1-203ENST00000559737 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
USP3-AS1-203ENST00000559737 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.9■■□□□ 1.9
USP3-AS1-203ENST00000559737 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
USP3-AS1-203ENST00000559737 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.89■■□□□ 1.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 MYOM2P54296 1465 aa26.88■■□□□ 1.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.87■■□□□ 1.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 STRCQ7RTU9 1775 aa26.84■■□□□ 1.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 STAC3Q96MF2 364 aa26.83■■□□□ 1.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.82■■□□□ 1.88
USP3-AS1-203ENST00000559737 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.81■■□□□ 1.88
USP3-AS1-203ENST00000559737 PIK3C2GO75747 1445 aa26.79■■□□□ 1.88
USP3-AS1-203ENST00000559737 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.79■■□□□ 1.88
USP3-AS1-203ENST00000559737 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.79■■□□□ 1.88
USP3-AS1-203ENST00000559737 MED14O60244 1454 aa26.78■■□□□ 1.88
USP3-AS1-203ENST00000559737 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.78■■□□□ 1.88
USP3-AS1-203ENST00000559737 IQGAP1P46940 1657 aa26.78■■□□□ 1.88
USP3-AS1-203ENST00000559737 BCANQ96GW7 911 aa26.78■■□□□ 1.88
USP3-AS1-203ENST00000559737 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
USP3-AS1-203ENST00000559737 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.76■■□□□ 1.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.74■■□□□ 1.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.73■■□□□ 1.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.73■■□□□ 1.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 ALKQ9UM73 1620 aa26.73■■□□□ 1.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.69■■□□□ 1.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.67■■□□□ 1.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 LAMC1P11047 1609 aa26.67■■□□□ 1.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.66■■□□□ 1.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 TBX22Q9Y458 520 aa26.66■■□□□ 1.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 DIP2AQ14689 1571 aa26.65■■□□□ 1.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.65■■□□□ 1.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.65■■□□□ 1.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 METP08581 1390 aa26.64■■□□□ 1.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.63■■□□□ 1.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.62■■□□□ 1.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 ADGRB1O14514 1584 aa26.61■■□□□ 1.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 PTPRUQ92729 1446 aa26.57■■□□□ 1.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.55■■□□□ 1.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 PIK3R4Q99570 1358 aa26.54■■□□□ 1.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 STK26Q9P289 416 aa26.54■■□□□ 1.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.53■■□□□ 1.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.52■■□□□ 1.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.5■■□□□ 1.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 KCNA6P17658 529 aa26.49■■□□□ 1.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.49■■□□□ 1.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 ABCC11Q96J66 1382 aa26.47■■□□□ 1.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 NWD1Q149M9 1564 aa26.47■■□□□ 1.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 KNDC1Q76NI1 1749 aa26.47■■□□□ 1.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 TECPR2O15040 1411 aa26.44■■□□□ 1.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 CPS1P31327 1500 aa26.43■■□□□ 1.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 ROBO2Q9HCK4 1378 aa26.42■■□□□ 1.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 DLC1Q96QB1 1528 aa26.41■■□□□ 1.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 USP47Q96K76 1375 aa26.4■■□□□ 1.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 WAPLQ7Z5K2 1190 aa26.39■■□□□ 1.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 PTCH1Q13635 1447 aa26.39■■□□□ 1.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa26.38■■□□□ 1.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 SIRT1Q96EB6 747 aa26.38■■□□□ 1.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 PRAM1Q96QH2 718 aa26.38■■□□□ 1.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.36■■□□□ 1.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.36■■□□□ 1.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 POGKQ9P215 609 aa26.35■■□□□ 1.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.35■■□□□ 1.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.34■■□□□ 1.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.33■■□□□ 1.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
USP3-AS1-203ENST00000559737 QRICH2Q9H0J4 1663 aa26.31■■□□□ 1.8
USP3-AS1-203ENST00000559737 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.31■■□□□ 1.8
USP3-AS1-203ENST00000559737 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms