RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-204ENST00000558666 CUL7Q14999 1698 aa7.41□□□□□ -1.22
TMOD3-204ENST00000558666 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa7.41□□□□□ -1.22
TMOD3-204ENST00000558666 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa7.41□□□□□ -1.22
TMOD3-204ENST00000558666 CERKQ8TCT0 537 aa7.41□□□□□ -1.22
TMOD3-204ENST00000558666 NBPF3Q9H094 633 aa7.41□□□□□ -1.22
TMOD3-204ENST00000558666 RABGEF1Q9UJ41 708 aa7.41□□□□□ -1.22
TMOD3-204ENST00000558666 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
TMOD3-204ENST00000558666 CLASP1Q7Z460 1538 aa7.41□□□□□ -1.22
TMOD3-204ENST00000558666 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
TMOD3-204ENST00000558666 ARHGEF11O15085 1522 aa7.4□□□□□ -1.22
TMOD3-204ENST00000558666 ERCC6L2Q5T890 1561 aa7.39□□□□□ -1.23
TMOD3-204ENST00000558666 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa7.39□□□□□ -1.23
TMOD3-204ENST00000558666 CDCA7LQ96GN5 454 aa7.39□□□□□ -1.23
TMOD3-204ENST00000558666 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TMOD3-204ENST00000558666 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TMOD3-204ENST00000558666 TSKSQ9UJT2 592 aa7.39□□□□□ -1.23
TMOD3-204ENST00000558666 SYNJ2O15056 1496 aa7.38□□□□□ -1.23
TMOD3-204ENST00000558666 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TMOD3-204ENST00000558666 PRSS12P56730 875 aa7.38□□□□□ -1.23
TMOD3-204ENST00000558666 GRIN2AQ12879 1464 aa7.37□□□□□ -1.23
TMOD3-204ENST00000558666 PTGDRQ13258 359 aa7.37□□□□□ -1.23
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TMOD3-204ENST00000558666 SMYD5Q6GMV2 418 aa7.37□□□□□ -1.23
TMOD3-204ENST00000558666 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TMOD3-204ENST00000558666 KIAA1468Q9P260 1216 aa7.37□□□□□ -1.23
TMOD3-204ENST00000558666 FAM198AQ9UFP1 575 aa7.37□□□□□ -1.23
TMOD3-204ENST00000558666 ERICH3Q5RHP9 1530 aa7.37□□□□□ -1.23
TMOD3-204ENST00000558666 TTC13Q8NBP0 860 aa7.36□□□□□ -1.23
TMOD3-204ENST00000558666 STAC3Q96MF2 364 aa7.36□□□□□ -1.23
TMOD3-204ENST00000558666 NUTM2FA1L443 756 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD3-204ENST00000558666 GPR37O15354 613 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD3-204ENST00000558666 PADI6Q6TGC4 694 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD3-204ENST00000558666 LAPTM4BQ86VI4 370 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD3-204ENST00000558666 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TMOD3-204ENST00000558666 SHROOM2Q13796 1616 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-204ENST00000558666 NBPF26B4DH59 902 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-204ENST00000558666 PACS2Q86VP3 889 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-204ENST00000558666 ARAP1Q96P48 1450 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-204ENST00000558666 FCHSD2O94868 740 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-204ENST00000558666 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-204ENST00000558666 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-204ENST00000558666 C3orf80F5H4A9 247 aa7.32□□□□□ -1.24
TMOD3-204ENST00000558666 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TMOD3-204ENST00000558666 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TMOD3-204ENST00000558666 GOLGA8CPA6NN73 597 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-204ENST00000558666 GPIHBP1Q8IV16 184 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-204ENST00000558666 WNT2BQ93097 391 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-204ENST00000558666 FHAD1B1AJZ9 1412 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-204ENST00000558666 KIF27Q86VH2 1401 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-204ENST00000558666 SMAPO00193 183 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-204ENST00000558666 HIC1Q14526 733 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-204ENST00000558666 THSD4Q6ZMP0 1018 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-204ENST00000558666 ANKK1Q8NFD2 765 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-204ENST00000558666 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
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TMOD3-204ENST00000558666 TATDN2Q93075 761 aa7.29□□□□□ -1.24
TMOD3-204ENST00000558666 IQGAP2Q13576 1575 aa7.29□□□□□ -1.24
TMOD3-204ENST00000558666 TSPOAP1O95153 1857 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-204ENST00000558666 NUDT18Q6ZVK8 323 aa7.28□□□□□ -1.24
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TMOD3-204ENST00000558666 ADGRG1Q9Y653 693 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-204ENST00000558666 KIF13AQ9H1H9 1805 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-204ENST00000558666 GNPATO15228 680 aa7.27□□□□□ -1.25
TMOD3-204ENST00000558666 BCAMP50895 628 aa7.27□□□□□ -1.25
TMOD3-204ENST00000558666 NUP160Q12769 1436 aa7.27□□□□□ -1.25
TMOD3-204ENST00000558666 SOWAHBA6NEL2 793 aa7.26□□□□□ -1.25
TMOD3-204ENST00000558666 LMOD2Q6P5Q4 547 aa7.26□□□□□ -1.25
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TMOD3-204ENST00000558666 EYA1Q99502 592 aa7.25□□□□□ -1.25
TMOD3-204ENST00000558666 ADCY10Q96PN6 1610 aa7.25□□□□□ -1.25
TMOD3-204ENST00000558666 FECHP22830 423 aa7.24□□□□□ -1.25
TMOD3-204ENST00000558666 FAM161AQ3B820 660 aa7.24□□□□□ -1.25
TMOD3-204ENST00000558666 SAMD7Q7Z3H4 446 aa7.24□□□□□ -1.25
TMOD3-204ENST00000558666 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
TMOD3-204ENST00000558666 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
TMOD3-204ENST00000558666 KIAA0556O60303 1618 aa7.23□□□□□ -1.25
TMOD3-204ENST00000558666 PTPN5P54829 565 aa7.23□□□□□ -1.25
TMOD3-204ENST00000558666 CYB5RLQ6IPT4 315 aa7.23□□□□□ -1.25
TMOD3-204ENST00000558666 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
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TMOD3-204ENST00000558666 BCANQ96GW7 911 aa7.22□□□□□ -1.25
TMOD3-204ENST00000558666 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
TMOD3-204ENST00000558666 PXYLP1Q8TE99 480 aa7.21□□□□□ -1.26
TMOD3-204ENST00000558666 HPS5Q9UPZ3 1129 aa7.21□□□□□ -1.26
TMOD3-204ENST00000558666 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa7.21□□□□□ -1.26
TMOD3-204ENST00000558666 IGF1RP08069 1367 aa7.2□□□□□ -1.26
TMOD3-204ENST00000558666 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa7.2□□□□□ -1.26
TMOD3-204ENST00000558666 KIF21BO75037 1637 aa7.2□□□□□ -1.26
TMOD3-204ENST00000558666 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
TMOD3-204ENST00000558666 OATP04181 439 aa7.2□□□□□ -1.26
TMOD3-204ENST00000558666 MAP2K5Q13163 448 aa7.2□□□□□ -1.26
TMOD3-204ENST00000558666 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
TMOD3-204ENST00000558666 NYAP1Q6ZVC0 841 aa7.2□□□□□ -1.26
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM134Q9H6X4 195 aa7.2□□□□□ -1.26
TMOD3-204ENST00000558666 WBP1LQ9NX94 342 aa7.2□□□□□ -1.26
TMOD3-204ENST00000558666 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
TMOD3-204ENST00000558666 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
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